菜心BclUBE2基因的克隆与表达分析

摘要

采用同源克隆法从菜心中获得cDNA全长459 bp的E2基因,命名为BclUBE2.该基因编码153个氨基酸,分子量为17.24 ku,理论等电点为5.37,为亲水性非分泌蛋白.结构分析显示,该蛋白含有一个泛素结合酶E2活性位点、一个WD重复序列和一个高度保守的半胱氨酸.进化分析发现,菜心BclUBE2蛋白与芸薹属芜菁和油菜的亲缘关系较近.qRT-PCR分析表明,菜心BclUBE2基因在根、茎、叶、叶柄中均有表达,且表达丰度和变化趋势不同.在低温胁迫下,根中的表达量呈现先降低后升高的变化趋势,且在处理1 h时表达量最低;在茎、叶、叶柄中均呈现先升高后降低的表达趋势,茎和叶柄处理6 h时的表达量最高,叶片处理1 h时的表达量最高.说明菜心BclUBE2基因在响应低温胁迫中发挥作用.