2018年德阳市胃肠炎暴发中诺如病毒分子病原学特征研究

摘要

目的 了解2018年德阳市急性胃肠炎(acute gastroenteritis,AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus,NoV)感染情况及其分子病原学特征,为NoV预防控制和疫苗研发提供参考.方法 收集德阳市2018年3起AGE暴发疫情的疑似病例及健康人标本共63份.采用实时荧光RT-PCR检测NoV核酸,阳性标本用RT-PCR扩增聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)区和衣壳蛋白(capsid protein) VP1区并测序分析.结果 NoV实时荧光RT-PCR结果显示3起AGE暴发疫情均由GⅡ组NoV感染引起,检测阳性率为33.3％(21/63),其中病例标本检出率为95％ (19/20),健康人标本检出率为4.7％(2/43).测序分析表明,2起疫情由GⅡ.17[P17]型NoV引起,与2014年以来流行的GⅡ.17变异株高度同源;1起疫情由GⅡ.2[P16]型NoV引起,与2016年以来流行的GII.2[P16]重组株高度同源.结论 2018年德阳市至少存在2种以上不同型别的NoV同时流行.