新型冠状病毒刺突糖蛋白氨基酸序列特征分析ue012

摘要

目的 探讨我国大陆新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S)的分子特征,为特效药物和疫苗的研发提供参考依据.方法 从全球共享禽流感数据库(GISAID)和GenBank数据库收集2019年12月至2020年3月27日我国大陆255株新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的S蛋白基因序列,利用MEGA6.0软件分析S蛋白氨基酸序列的分子变异特征.结果 255株SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列处于系统进化树的同一分支,同源性为96.8％～100％;bat-coronavirus-RaTG13病毒的S蛋白序列与255株SARS-CoV-2的氨基酸同源性为86.6％～93.4％.S蛋白6个关键位点和受体结合域(RBD)的3个关键位点均未发生变异,但4株病毒S蛋白的RBD域发生个别氨基酸突变.结论 中国大陆SARS-CoV-2 S蛋白的氨基酸序列同源性较高,但仍需密切监测其分子特征.