犬博卡病毒流行病学调查及基因序列分析

摘要

犬博卡病毒(CBoV)属于细小病毒科的无囊膜病毒,是一种从犬粪便中检测发现的新发病原,该病毒现已在多个国家和地区犬粪便中检测到,但其在上海地区的流行情况及其致病机制目前还不是很清楚。为了调查犬博卡病毒在上海犬中的流行情况,本研究于2019年6月至2019年12月,从上海市采集犬新鲜粪便206份,通过PCR扩增方法进行鉴定并进一步通过进化树对其基因组进行分析。结果显示在所搜集的206份样品中有3份为CBoV阳性(1.5%),为了对检测出的CBoV基因组特性进行分析,我们扩增出CBoV的全基因组,发现其基因组共含有5246个核苷酸,其中包含大小为249 bp的5'UTR、4853 bp的开放阅读框和144 bp的3'UTR。从系统进化树中可以看出该病毒与其他亚洲分离株亲缘关系较近,处于同一个分支,同属于CBoV2。本研究通过对CBoV的流行情况进行调查,揭示了CBoV在上海犬中的感染情况,为进一步研究CBoV的致病性及潜在的CBoV传染病的预警和防控提供科学依据和理论参考。