茶树全基因组生长素反应因子(ARF)基因家族鉴定及表达分析

摘要

生长素反应因子(Auxin response factor)作为调控生长素应答基因表达的转录因子,对调控植物生长发育起着十分重要的作用。研究结合茶树基因组数据,使用生物信息学分析,共鉴定出25个ARF基因,并将其命名为CsARF1~CsARF25。可将它划分入5个亚族,同一亚族内的基序和保守结构域相对保守。通过对CsARF顺势作用元件的分析,发现其可能参与茶树对逆境胁迫的响应和调控茶树的生长发育。通过转录组基因表达情况分析,CsARF在茶树不同组织的表达情况有很大区别,从一定程度上说明了CsARF参与调控茶树的生长发育,qRT-PCR验证分析结果趋势与转录组数据基本一致,也从侧面验证了这一结果。研究结果可为茶树ARF基因家族的进一步研究提供理论依据和参考。