甜瓜ERF转录因子基因家族的全基因组鉴定与进化分析

摘要

本研究对甜瓜AP2/ERF转录因子超家族及ERF转录因子家族基因进行了鉴定,对ERF家族基因进行了系统发育、基因结构、保守基序、表达特性的分析,将鉴定得到的甜瓜ERF家族基因与拟南芥、番茄以及黄瓜进行了系统发生分析比较.结果表明:甜瓜AP2/ERF超家族基因包括136个成员,其中AP2,ERF和RAV家族分别含13,119和4成员。在ERF家族119个成员中，ERF和CBF/DREB亚家族成员分别为64和55个。通过系统发生分析后将ERF家族基因分为11个组,其中ERF和CBF/DREB亚家族分别包括6和5个组.基于系统发生分析分组以及基因结构的分析,可以推断ERF家族基因的功能分化先于单双子叶植物的物种分化.与拟南芥、番茄、黄瓜的系统发生比较分析表明有些小组中的ERF家族基因是甜瓜特异性的.基因表达特性分析表明,ERF亚家族基因在甜瓜的各个组织当中均有表达,但部分ERF亚家族基因的表达具有较强的组织特异性.综上所述,ERF家族基因在甜瓜的生命过程中发挥着重要的作用,ERF家族基因的鉴定为进一步阐明ERF家族基因的功能奠定了基础。