利用微卫星标记鉴定德州驴亲子关系

摘要

试验旨在建立一套适用于德州驴亲子关系的鉴定体系.选取13个微卫星基因座作为标记,采集了53头德州驴血液样本,其中子代驴驹16头,候选父本13头,候选母本24头,用酚-仿法抽提血液基因组进行PCR扩增和基因扫描,并利用Peak Scanner Software v 1.0软件读取基因型分型结果.对微卫星基因座的遗传多样性进行分析,利用似然法(Cervus 3.0软件)和排除法对个体间的亲子关系进行了鉴定.结果 显示,13个微卫星基因座的平均等位基因数、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)分别为6.846、0.689、0.671和0.625.期望杂合度与观测杂合度之差在0.002～0.088之间,差值较小.13个微卫星基因座的累计排除概率(EP)达到0.990以上.微卫星基因座具有高度多态性和较高的排除概率,适用于遗传分析和个体鉴定.利用Cervus 3.0软件基于似然法分析得到了16头子代驴驹的最似亲本,结合排除法对这16头驴驹及其最似亲本进行基因型比对,最终在53头德州驴中确定了11个亲子对.本试验建立了以13个微卫星位点作为核心标记,将似然法和排除法相结合作为主要分析方法的德州驴亲子关系鉴定体系,为育种工作提供参考资料.