鸭流感病毒4/2004-H6N2亚型毒株的血凝素基因全序列克隆与分析

摘要

2004初从正常鸭群中分离到一株鸭源禽流感病毒,命名为 A/Duck/HN/4/2004(H6N2).经对血凝素基因( HA)序列分析发现 HA基因全长为 1 744 bp,共编码 566个氨基酸,在裂解位点仅含一个碱性氨基酸-精氨酸( R),符合 LPAIV的标准.将所得基因序列与已发表的同一亚型参考序列分析表明,与 H6亚型流感 HA基因同源性为 89.2%～ 97.1%,经分子遗传演化分析表明本次分离株与香港分离株 A/Duck/Hong Kong/3600/99(H6N2)、 A/Duck/Hong Kong/3600/99(H6N2)最近.