nPTB基因座上T-uc.33在小鼠神经系统发育中的功能

摘要

目的 nPTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能.方法 利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到nPTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-uc.33的RNA转录本全长;用实时荧光定量PCR检测T-uc.33和nPTB在小鼠脑组织发育及神经干细胞分化不同时间点的表达谱;用siRNAs转染细胞法检测T-uc.33对nPTB所起的调控作用.结果 筛选并鉴定了nPTB基因座上的T-uc.33为真实转录的超保守长非编码RNA,全长为807 nt;T-uc.33和nPTB在小鼠脑组织中的表达呈显著正相关(P＜0.01),并随着脑组织发育从胚胎到成年期呈现先升高后降低的趋势,在体外神经干细胞分化过程也存在差异表达;敲低T-uc.33可显著降低nPTB的表达(P＜0.01).结论 T-uc.33为nPTB基因座上的超保守长非编码RNA,对nPTB起到正向调控作用,潜在地影响小鼠脑组织发育和神经干细胞的分化过程.