中国丝光绿蝇种群线粒体细胞色素b基因的遗传多样性及其对法医学上死亡地点推断的意义

摘要

[目的]对中国多地丝光绿蝇Lucilia sericata种群线粒体细胞色素b(cytochrome b,CYTB)基因进行测序,探究地理隔离对中国丝光绿蝇线粒体细胞色素b基因遗传多样性的影响,并探讨其在法医学上死亡地点推断中的应用.[方法]对2016年采自中国11个地区的丝光绿蝇55头个体的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和测序;运用MEGA 6.0进行遗传多样性分析、系统发育分析和遗传距离分析,运用Primer 5进行聚类分析,运用WinArl35软件进行遗传分化研究,运用DnaSP 5.0进行单倍型统计分析,运用SPSS进行数据整理.并于2017年采用随机抽样的方法抽取其中2个地区(七台河和楚雄),再捕捉丝光绿蝇进行地域特征单核苷酸多态性(SNP)位点的验证实验.[结果]共获得55条丝光绿蝇线粒体CYTB基因序列(GenBank登录号:MG696659-696663;MG734397-734446),共发现19个变异位点,样本总体核苷酸多态度(Pi)为0.00205,组内平均遗传距离为0.00178.主坐标聚类分析显示所有样本聚为3簇.种群间遗传分化指数Fst有统计学意义的共有6组,范围为0.056 ～ 0.350.累计遗传距离和累计纬度差之间具有较高的相关性.序列比对共发现11个地域性私有SNP位点,14个私有单倍型.SNP位点验证实验表明,楚雄样本无新增的SNP位点,七台河样本新增3个SNP位点,其中2个地域性私有SNP位点.[结论]地理隔离对中国丝光绿蝇线粒体细胞色素b基因的遗传多样性具有影响,这种影响可能对法医学上死亡地点的推测有所帮助.