Cytb

摘要： 为探究新疆塔里木河叶尔羌高原鳅(Triplophysa yarkandensis)遗传多样性现状,研究基于线粒体Cytb和D-loop序列对塔里木河两条支流(车尔臣河和渭干河)的8个地理群体进行了遗传学多样性和遗传结构分析。结果显示,基于Cytb和D-loop序列分别获得了41和51个单倍型,单倍型多样性指数/核苷酸多样性指数分别为0.9247±0.0124/0.9776±0.0032和0.0065±0.0034/0.0115±0.0058,表明各群体的遗传多样性水平均较高。AMOVA结果显示,遗传变异主要来自群体内部(Cytb F_(st)=96.57%;D-loop F_(st)=95.25%),仅有3.43%(Cytb)和4.75%(D-loop)来自群体间;各群体间的遗传距离值小,遗传分化指数F_(st)值低,属于弱分化水平。基于样本构建的系统发育树和单倍型构建的网络进化图均显示,各群体的样本没能形成明显的地理聚群和谱系结构。虽然两支流群体间存在潜在的遗传障碍,并发生了一定的遗传分化,但其遗传距离值只在0.05附近(Cytb,F_(ct)=0.0540;D-loop,F_(ct)=0.0471)。种群历史动态分析结果表明,叶尔羌高原鳅种群相对稳定,未经历过明显的扩张。综合上述结果,塔里木河叶尔羌高原鳅群体遗传多样性水平较高,但是遗传分化主要来源于群体内部,群体间有明显的基因交流,建议将其作为一个保护管理单元进行保护。研究为叶尔羌高原鳅种质资源开发利用、制定合理的保护措施提供了基础数据。

摘要： 为了解洞庭湖区养殖克氏原螯虾的遗传多样性,从线粒体Cytb和COⅠ基因入手,经基因组DNA提取、PCR扩增、序列测定和拼接,比较分析了岳阳华容县和益阳南县2处主养殖区内共11个采集点的克氏原螯虾遗传结构。试验结果显示,在华容县的6个采集点中,基于Cytb基因的克氏原螯虾的单倍型多样性指数为0.506,核苷酸多样性指数为0.27265;基于COⅠ基因的克氏原螯虾的单倍型多样性指数为0.258,核苷酸多样性指数为0.1361。在南县的5个采集点中,基于Cytb基因的克氏原螯虾的单倍型多样性指数为0.467,核苷酸多样性指数为0.25974;基于COⅠ基因的克氏原螯虾的单倍型多样性指数为0.244,核苷酸多样性指数为0.1223。单倍型系统进化树和遗传距离分析表明,11个采集点的克氏原螯虾呈现交叉分布,遗传分化不显著。结果表明,洞庭湖区养殖克氏原螯虾近亲交配严重,遗传多样性低。

摘要： 为了解中国东南沿海可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)自然群体的遗传多样性水平,探明该物种的种质资源情况,采用线粒体细胞色素b(cytb)基因和线粒体DNA控制区(d-loop)序列分析技术对广东湛江(ZJ)、广东阳江(YJ)、广西钦州(QZ)、福建宁德(ND)、浙江温州(WZ)5个可口革囊星虫自然群体进行测序分析。在150个样本中,cytb和d-loop序列分别检测到了118和158个多态位点,定义了62和79种单倍型。基于cytb和d-loop序列的遗传多样性参数分析均表现出较高的基因多样性(cytb:0.8713~0.9632;d-loop:0.9425~0.9816)和较低水平的核苷酸多样性(cytb:0.032487~0.040975;d-loop:0.033247~0.046151)。而分子方差分析(AMOVA)结果一致表明,群体内部的遗传变异(cytb:98.56%;d-loop:98.61%)比例显著高于群体间的遗传变异(cytb:1.44%;d-loop:1.39%),表明可口革囊星虫在不同地理群体间的遗传变异并不明显,不同地理群体之间不存在地理隔离。单倍型邻接树的拓扑结构简单,未呈现明显的地理谱系结构。从Tajima’s D和Fu’s Fs检验结果显著偏离中性这一现象,可推测出可口革囊星虫群体近期经历过群体快速扩张事件。

摘要： 研究福建省龙岩市象洞鸡养殖群体的遗传多样性及起源进化关系,为其选育和遗传改良提供理论依据。本研究通过PCR扩增与测序技术获得象洞鸡细胞色素b(Cytb)基因和线粒体控制区(D-loop)部分序列,采用DNAMAN软件进行序列拼接,Dna SP和Mega软件分析序列变异和种群的遗传多样性。结果显示:获得象洞鸡Cytb序列为810 bp,检测到7个核苷酸多态位点,定义了6种单倍型,核苷酸多样度为0.00199,单倍型多样度为0.713;获得D-loop序列为565 bp,检测到25个核苷酸多态位点,定义了16种单倍型,核苷酸多样度为0.001173,单倍型多样度为0.940。系统发育树分析显示象洞鸡有4个母系来源。该研究结果从分子水平为象洞鸡遗传资源保护和开发利用提供了理论参考。

摘要： [目的]为全面了解新疆地方绵羊品种的遗传多样性和系统发育关系,为后期选种、保种和种质资源合理利用提供理论依据.[方法]对新疆13个地方绵羊品种线粒体DNA细胞色素b(cytochrome b,cytb)基因序列进行PCR扩增和测序分析.[结果]除和田羊外,其余12个品种遗传多样性均较丰富;中性检验显示和田羊经历过种群扩张;遗传距离和聚类分析显示和田羊与策勒黑羊遗传距离最近,与巴尔楚克羊遗传距离最远,其它品种与巴尔楚克羊的遗传距离均较远;单倍型网络图分析显示,13个地方品种分为3个分支;分子方差分析表明,群体内变异占91.33％,群体间变异占8.67％,品种间分化不明显.[结论]新疆13个地方绵羊品种有3个母系起源,其亲缘关系与育成史和地理分布基本一致,和田羊的遗传多样性较低,需要加强遗传资源保护.

摘要： 以采自我国14个省(自治区)的77种库蠓标本为研究对象,测定分析库蠓的线粒体COⅠ、Cyt b、16S rDNA及核糖体ITS1-ITS2基因序列,并构建系统发育树.多基因聚类分析显示:77种库蠓分别隶属于屋室亚属、带纹亚属、库蠓亚属、二囊亚属、血色亚属、三囊亚属和单囊亚属,该结果与形态学鉴定结果基本吻合,表明基于多基因的分子分类技术可用于库蠓的种类鉴定.

摘要： 自2012年以来,河南鱼类资源调查队对全省进行鱼类资源调查.在调查过程中,采集到多尾鳅科鱼类标本,结合线粒体基因C_(yt)b和COI分子数据及可测量的形态指标,对河南省鳅科3种鱼类进行了重新整理与描述,同时对《河南鱼类补遗》中紫薄鳅(Leptobotia taeniops)的特征进行了详细的补充描述.结果表明河南省分布有3种鳅科鱼类:紫薄鳅(Leptobotia taeniops)、花斑副沙鳅(Parabotia fasciata)以及分布在河南省的新纪录种——漓江副沙鳅(Parabotia lijiangensis).漓江副沙鳅首次在河南省发现,且与花斑副沙鳅在形态上差别较大,漓江副沙鳅体型稍短,头部较为短小,体色偏棕黄色,体斑有差别,在臀鳍有一明显的斑纹,尾鳍较短且分叉.花斑副沙鳅和紫薄鳅在河南省有描述及记录.结合线粒体基因C_(yt)b、COI序列及形态特征两方面进行详细描述和确认.

摘要： 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNACytb基因进行分析.Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本76.7﹪,表明晋南牛具有76.7﹪的普通牛父系血统;具有130bp的等位基因,约占总样本23.3﹪,表明晋南牛具有32.2﹪的瘤牛父系血统.Cytb基因的HinfⅠ酶切分析表明,在这31个个体中,没有发现牦牛和班腾牛的母系起源.

摘要： 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNACytb基因进行分析.Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本76.7﹪,表明晋南牛具有76.7﹪的普通牛父系血统;具有130bp的等位基因,约占总样本23.3﹪,表明晋南牛具有32.2﹪的瘤牛父系血统.Cytb基因的HinfⅠ酶切分析表明,在这31个个体中,没有发现牦牛和班腾牛的母系起源.

摘要： 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNACytb基因进行分析.Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本76.7﹪,表明晋南牛具有76.7﹪的普通牛父系血统;具有130bp的等位基因,约占总样本23.3﹪,表明晋南牛具有32.2﹪的瘤牛父系血统.Cytb基因的HinfⅠ酶切分析表明,在这31个个体中,没有发现牦牛和班腾牛的母系起源.

摘要： 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNACytb基因进行分析.Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本76.7﹪,表明晋南牛具有76.7﹪的普通牛父系血统;具有130bp的等位基因,约占总样本23.3﹪,表明晋南牛具有32.2﹪的瘤牛父系血统.Cytb基因的HinfⅠ酶切分析表明,在这31个个体中,没有发现牦牛和班腾牛的母系起源.

摘要： 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNACytb基因进行分析.Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本76.7﹪,表明晋南牛具有76.7﹪的普通牛父系血统;具有130bp的等位基因,约占总样本23.3﹪,表明晋南牛具有32.2﹪的瘤牛父系血统.Cytb基因的HinfⅠ酶切分析表明,在这31个个体中,没有发现牦牛和班腾牛的母系起源.

摘要： 本发明涉及马铃薯晚疫病菌细胞色素b基因Cytb核苷酸点突变的鉴定及其在杀菌剂吡唑醚菌酯抗性检测中的应用，具体公开了两种快速鉴定马铃薯晚疫病菌Cytb基因406位核苷酸突变对吡唑醚菌酯产生抗性的分子检测方法及其专用引物。所述突变位点指马铃薯晚疫病菌中Cytb基因自5’末端起第406位核苷酸为A纯合，由此导致Cytb蛋白自N端起第136位氨基酸为纯合的精氨酸。本发明提供的分子检测方法灵敏度高、特异性强、检测周期短，可以实现马铃薯晚疫病菌对吡唑醚菌酯抗性菌株的快速鉴定，高通量监测田间马铃薯晚疫病菌对吡唑醚菌酯的抗性发生及发展情况，为我国马铃薯晚疫病的发生流行和抗性治理提供理论指导。

摘要： 本发明涉及一种物种鉴定领域，是一种以高分辨率熔解曲线为基础的白纹伊蚊和埃及伊蚊鉴别试剂盒，其特点是根据白纹伊蚊和埃及伊蚊CYTB基因序列设计通用引物，利用优化的高分辨率熔解曲线反应体系鉴别白纹伊蚊和埃及伊蚊各种形态如成虫、卵、幼虫和蛹等。能对白纹伊蚊和埃及伊蚊进行鉴别，操作简单、速度快、PCR产物无需后处理、可以检测出单个碱基的差异、真正实现闭管操作。

摘要： 本发明涉及分子生物学和昆虫分类技术，旨在提供一种基于线粒体CYTB基因的散白蚁分子鉴定方法。该方法包括：构建用于散白蚁分子分类鉴定的DNA条形码库；提取和扩增待鉴定散白蚁的CYTB基因序列；根据CYTB基因序列的比对确定散白蚁的种类。本发明利用特定引物进行散白蚁属白蚁线粒体CYTB基因的PCR克隆测序，将测序结果作为散白蚁分子分类鉴定的DNA条形码，弥补了利用形态鉴定以及利用COI、COII和16SrRNA等分子标记进行散白蚁鉴定过程中的不足。本发明的鉴定方法较现有技术鉴定成本低，耗时短，对散白蚁属下种的鉴定更准确。在实现散白蚁的快速、准确鉴定，能够缩短鉴定时间。

摘要： 基于物种Cytb基因的吸血蠓常见寄主鉴定试剂盒及使用方法，包含12种常见寄主动物Cytb基因的特异性扩增引物以及基因组DNA。该试剂盒使用方法为提取吸血蠓饱血腹部的血液基因组DNA，利用特异性引物进行PCR扩增，再根据PCR扩增产物大小来鉴定出对应的寄主。本申请提供扩增12种常见寄主动物Cytb基因的扩增引物及寄主鉴定方法，有利于实现吸血蠓常见寄主生物准确、快速的鉴定，降低物种鉴定成本。

摘要： 本发明公开了一种基于Cytb基因序列的

摘要： 本发明公开了一种基于Cytb基因序列的蛇鮈和长蛇鮈的分子鉴别方法。该方法包含以下步骤：(1)分别提取蛇鮈和长蛇鮈的基因组DNA；(2)PCR扩增蛇鮈和长蛇鮈的细胞色素b基因片段；(3)扩增产物纯化后，直接测序，蛇鮈的Cytb基因扩增产物如SEQ ID NO.3所示，长蛇鮈的Cytb基因扩增产物如SEQ ID NO.4所示。COI基因序列第15位点碱基是G的为蛇鮈，若该位点是C的为长蛇鮈。该方法可以简便、快速、准确、有效地鉴别蛇鮈和长蛇鮈，结果稳定性好，重复率高，填补了目前国内分子生物学标准鉴别蛇鮈和长蛇鮈的空白，也有利于开展蛇鮈和长蛇鮈资源调查及渔业资源物种多样性和遗传多样性保护。

摘要： 本发明公开了一种臂尾轮属轮虫线粒体Cytb基因的部分DNA测序方法及鉴定臂尾轮属轮虫的方法。包括以下步骤：提取臂尾轮属轮虫DNA；PCR引物扩增及序列测定，所述PCR引物为Cytb1S：5’‑TWGATYTWCCTTCTCCHGC‑3’；Cytb1R：5’‑GGWGAYGCWGCWGGACAD CTHCC‑3’；系统发生分析。/本测序方法中所设计的PCR引物可以扩增出臂尾轮属轮虫线粒体Cytb基因的部分DNA，测序结果可用于对臂尾轮属轮虫进行精确鉴定，解决了利用形态学和超微结构存在的鉴定困难，使得在大规模培养轮虫的过程中，减少种群混杂带来的种群竞争而造成轮虫减产甚至大量死亡的可能性。

摘要： 本发明涉及一种扩增白纹伊蚊(Aedes albopictus)Cytb基因特异性引物及利用其进行测序的方法，所述引物序列为上游引物CytbAEDF:5’‑ATTTTACCTTTTATTGTATTA‑3’、下游引物CytbAEDR:5’‑CCAATTCATGTTAGAAGA‑3’，所述方法包括步骤1：提取待测样本模板DNA；步骤2：对步骤1中提取的待测样本的模板DNA进行PCR扩增；步骤3：将步骤2中PCR扩增产物进行电泳确定；步骤4：对步骤3中确定后的PCR产物进行DNA序列测定。利用白纹伊蚊Cytb基因特异性引物，采用相应测序方法，快速准确得扩增出目的基因序列，为有害生物的快速检出及鉴定提供参考。

摘要： 本发明涉及一种扩增蚊科昆虫Cytb基因特异性引物及利用其进行测序的方法，所述引物序列为CytbMOSF:TTTCAGCTYGATGAAATTTTGG；CytbMOSR:TATAAAACWGTTAAAATTTG，所述方法包括步骤1：提取待测样本模板DNA；步骤2：对步骤1中提取的待测样本的模板DNA进行PCR扩增；步骤3：将步骤2中PCR扩增产物进行电泳确定；步骤4：对步骤3中确定后的PCR产物进行DNA序列测定。利用蚊科昆虫Cytb基因特异性引物，采用相应测序方法，快速准确得扩增出基因序列，为后续Cytb基因进行病媒生物蚊科昆虫的分子鉴定和溯源提供基础。

摘要： 基于Cytb基因鉴别裸盖鱼的引物和探针，引物包括一对扩增引物，分别包括SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的核苷酸序列。探针包括SEQ ID No.3所示的核苷酸序列，5’端携带有荧光报告基团，3’端携带有荧光淬灭基团。本发明还提供鉴别裸盖鱼的方法和实时荧光PCR检测试剂盒，该方法和实时荧光PCR检测试剂盒基于上述引物和探针来鉴别裸盖鱼。本申请所提供的引物和探针能对来源于含有裸盖鱼成分的DNA产生特异性扩增信号，而对没有裸盖鱼成分的DNA不发生特异性扩增。采用本发明的方法和实时荧光PCR检测试剂盒，能够对裸盖鱼与其易混品种的水产品进行鉴别区分，具有准确、快速、灵敏等优点。