不同相思树种根际与非根际土壤细菌群落结构及多样性特征

摘要

提取不同相思树种根际与非根际土壤的基因组DNA,采用Illumina NovaSeq高通量测序技术,分析了不同相思树种根际与非根际土壤的细菌群落结构及多样性。研究结果表明:多样性指数Chao、ACE、Shannon和Simpson指数显示相思树种根际土壤细菌群落具有更高的丰富性和多样性;在纲水平上,优势菌纲为Acidobacterlia和Alphaproteobacteria,且Alphaproteobacteria、Gammaproteobacteria在同一相思树种根际土壤中所占丰度均高于非根际土壤;在目水平上,Acidobacteriales占主导地位,其在不同相思树种根际土壤中的丰度高于非根际土壤;在科水平上,在不同相思树种根际土壤及非根际土壤中,Xanthobacteraceae、Acidothermaceae、unidentified_Acidobacteriales均为优势菌群,且同一相思树种根际土壤的细菌群落丰度高于非根际土壤。