深海热液区化能自养菌Sulfurimonas sp. 的分离、鉴定及其化能自养代谢特征的初步研究

目录

声明

引 言

1 综述

1.1 深海热液区 Epsilonproteobacteria

1.1.1 深海热液区的化能自养

1.1.2 Epsilonproteobacteria化能自养类群的来源

1.1.3 Epsilonproteobacteria的分布

1.1.4 Epsilonproteobacteria 的代谢特征

1.1.5 Epsilonproteobacteria 的分类

1.2 Sulfurimonas 的研究进展

1.3 本论文的研究内容与目的意义

2.1 实验材料

2.1.1 样品来源

2.1.2 培养基

2.1.3 主要试剂与药品

2.1.4 主要仪器

2.1.5 分析软件

2.2 实验方法

2.2.1 Sulfurimonas sp. 的富集、分离及纯化

2.2.2 细菌基因组DNA的制备

2.2.3 PCR反应扩增体系及程序

2.2.4 以16S rRNA序列为基础的系统进化树构建

2.2.5 菌株在不同电子供体/受体组合下的生长

2.3 结果与分析

2.3.1 Sulfurimonas sp.的富集、分离及纯化结果

2.3.2 以16S rRNA基因序列为基础的系统发育分析

2.3.3 菌株在不同电子供体/受体组合下的生长结果

2.4 讨论

3 两株Sulfurimonassp.新种NW8N及NW10的鉴定

3.1 材料与方法

3.1.1 样品来源

3.1.2 材料

3.1.3 实验方法

3.2 结果与分析

3.2.1 形态学特征

3.2.2 菌株的生长特征

3.2.3 主要脂肪酸组成分析及G+C含量分析

3.2.4 菌株的属内比较

3.2.5 基于16S rRNA基因序列的系统发育分析

3.3 讨论

4 Sulfurimonas sp.NW8N及Sulfurimonas sp.NW10基因组数据初步分析

4.1 材料与方法

4.1.1 实验材料

4.1.2 实验方法

4.2 结果与分析

4.2.1 基因组评估

4.2.2 基因组学特征

4.2.3 比较基因组初步分析

4.3 讨论

5 总结与展望

参考文献

在学研究成果

致谢