盲鼹形鼠属(Spalax)物种形成式样的基因组研究

目录

声明

1 概述

1.1 引言

1.2 物种形成与分化

1.3 盲鼹形鼠的起源与分布

1.4 以色列境内盲鼹形鼠概况

1.5 盲鼹形鼠的分类与差异

1.6 研究目的与意义

1.7 研究内容

1.7.1 盲鼹形鼠Spalax物种遗传多样性、种群遗传结构和物种形成方式

1.7.2 盲鼹形鼠Spalax物种分化过程中的基因流大小和方向

1.7.3 种间和种内适应性进化

1.7.4 使用Treemix检测群体基因交流事件

2 材料与方法

2.1 实验材料

2.1.2 样品收集

2.1.3 实验仪器及设备

2.1.4 实验试剂

2.1.5 实验耗材

2.2 技术路线

2.3 研究方法

2.3.1样本采集

2.3.2 DNA提取

2.3.3 DNA文库构建与测序

2.3.4 数据过滤和SNP提取

2.3.5群体亲缘关系系数

2.3.6 群体遗传结构分析

2.3.7群体遗传多样性

2.3.8计算群体之间的分化系数

2.3.9 群体遗传连锁不平衡分析

2.3.10群体历史

2.3.11 群体结构可视化

2.3.12 受选择基因鉴定

3 结果与分析

3.1 群体亲缘关系系数

3.2 群体基因组测序结果

3.3 群体遗传多样性和群体分化

3.4群体之间的分化系数

3.5 Spalax属物种的群体分化历史

3.6 Spalax属种群的受选择基因

3.7 Spalax属物种的分化关系

4 讨论

4.1 盲鼹形鼠Spalax物种适应性研究

4.2 群体基因组分化

4.3 遗传多样性、基因流动和连锁不平衡

4.4 各物种受到选择的基因

5 全文总结

5.1 主要结果

5.2 主要结论

5.3 创新点

6 文献综述

7 展望

参考文献

个人简历、在校期间发表的学术论文与研究成果

致谢