冬瓜高密度遗传图谱构建及果皮颜色QTL定位

目录

声明

第一章 前 言

1.1分子遗传图谱的构建

1.1.1遗传图谱的研究进展

1.1.2遗传图谱的构建方法

1.2QTL定位

1.2.1QTL定位原理

1.2.2QTL 定位方法

1.3全基因组测序技术的研究进展

1.4冬瓜果皮颜色的相关研究进展

1.4.1冬瓜皮色遗传规律的研究进展

1.4.2冬瓜皮色遗传图谱构建的研究进展

1.4.3其他葫芦科蔬菜皮色的研究进展

1.5研究目的及意义

第二章 基于全基因组重测序的冬瓜高密度遗传图谱构建

2.1试验材料

2.1.1亲本及作图群体

2.1.2田间设计

2.2试验方法

2.2.1DNA提取和检测

2.2.2DNA文库构建及测序

2.2.3重测序数据质量评估

2.2.4测序比对分析

2.2.5SNP标记的分型与筛选

2.2.6高密度遗传图谱构建

2.2.7遗传图谱质量评估

2.3结果与分析

2.3.1重测序数据评估

2.3.2基因分型及SNP筛选

2.3.3高密度遗传图谱的构建

2.3.4图谱质量评估

2.4讨论

2.4.1全基因组重测序技术开发SNP标记的应用

2.4.2作图群体与图谱质量

第三章 冬瓜果皮颜色QTL定位与候选基因预测

3.1试验材料

3.2试验方法

3.2.1表型测定及计算

3.2.2QTL定位

3.2.3候选基因预测

3.3结果与分析

3.3.1果皮颜色性状的遗传分析

3.3.2果皮颜色QTL定位分析

3.3.3候选基因预测

3.4讨论

3.4.1冬瓜果皮颜色性状的遗传分析

3.4.2冬瓜果皮颜色的QTL定位

3.4.3冬瓜墨绿色果皮候选基因预测与分析

第四章 全文结论

参考文献

附录1

附录2

致谢

攻读学位期间科研、发表论文情况