丛枝菌根真菌侵染甘蔗对甘蔗养分吸收及转录组的影响

目录

声明

1 前言

1.1 研究背景

1.2 国内外研究现状

1.2.1 关于丛枝菌根真菌

1.2.2 丛枝菌根真菌促进植物的营养吸收

1.2.3 转录组学

1.2.4 实时荧光定量PCR

1.3 本研究的目的与意义

1.4 技术路线

2 材料与方法

2.1 实验材料

2.1.1 供试菌种

2.1.2 供试植株

2.1.3 培养基质

2.2 试验设计与步骤

2.2.1 装盆和接种

2.2.2 培养和管理

2.3 测定项目与方法

2.3.1 甘蔗地上部生长量的测定

2.3.2 甘蔗根系生长量的测定

2.3.3 甘蔗蔗叶叶绿素、类黄酮含量的测定

2.3.4 甘蔗根系AM真菌侵染率的测定

2.3.5 土壤各理化性质的测定

2.3.6 甘蔗根系总RNA的提取

2.3.7 减量施肥水平下不同接种处理的甘蔗根系RNA-Seq测序

2.3.8 实时荧光定量PCR检测

2.3.9 数据处理与统计分析

3 结果与分析

3.1 不同菌种类型及不同施肥水平对甘蔗生物学特性的影响

3.1.1 菌种类型及施肥水平对甘蔗生物量的影响

3.1.2 菌种类型及施肥水平对甘蔗根系发育的影响

3.1.3 菌种类型及施肥水平对甘蔗叶绿素等含量的影响

3.2 不同菌种类型及不同施肥水平对甘蔗根系土壤理化性质的影响

3.2.1 菌种类型及施肥水平对根系土壤pH的影响

3.2.2 菌种类型及施肥水平对根系土壤碱解氮含量的影响

3.2.3 菌种类型及施肥水平对根系土壤有效磷含量的影响

3.2.4 菌种类型及施肥水平对根系土壤速效钾含量的影响

3.2.5 菌种类型及施肥水平对根系土壤有机质含量的影响

3.3 不同菌种类型及不同施肥水平对甘蔗根系菌丝侵染率的影响

3.4 转录组数据的整体概述

3.4.1 测序结果统计

3.4.2 与参考基因组比对分析

3.4.3 样本相关性分析

3.5 差异表达基因分析

3.5.1 差异基因GO功能分类

3.5.2 差异基因KEGG通路富集分析

3.5.3 相关差异表达基因分析

3.6 实时荧光定量PCR验证

4 讨论、结论与展望

4.1 讨论

4.1.1 不同菌种类型及不同施肥水平对甘蔗生物学特性的影响

4.1.2 不同菌种类型及不同施肥水平对甘蔗根系土壤理化性质的影响

4.1.3 不同菌种类型及不同施肥水平对甘蔗根系菌丝侵染率的影响

4.1.4 减量施肥水平下各接种处理差异表达基因转录组结果分析

4.1.5 减量施肥水平下各接种处理相关差异表达基因分析

4.2 结论

4.3 展望

参考文献

致谢