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摘要
第一章大肠杆菌aroA基因突变株的构建
引言
1.1实验材料
1.1.1供试菌株及质粒
1.1.2培养基
1.1.3酶及生化试剂
1.1.4主要仪器
1.1.5引物合成与测序
1.2实验方法
1.2.1大肠杆菌基因组的提取(CTAB法)
1.2.2琼脂糖凝胶中DNA片段的回收(参照试剂盒QIAEXⅡ的说明书)
1.2.3质粒提取
1.2.4感受态细胞的制备(氯化钙转化法)及热击转化DNA
1.2.5电击转化感受态细胞制备
1.2.6电击转化
1.2.7线性DNAAK的准备
1.2.8线性DNAAC的准备
1.2.9含有pKD46的E.coliBW25113电转化感受态细胞的制备
1.2.10线性DNA的转化及突变株的筛选
1.2.11突变株的鉴定
1.3结果
1.3.1含抗性盒的线性片段的获得
1.3.2突变株的筛选结果
1.3.3突变株的分子验证
1.3.4突变株的功能验证
1.4讨论
参考文献
第二章草甘膦极端污染土壤高抗EPSPS新基因RDaroA的克隆及其表达产物的酶动力学研究
引言
2.1实验材料
2.1.1土壤样品
2.1.2供试菌株及质粒
2.1.3培养基
2.1.4酶及生化试剂
2.1.5主要仪器
2.1.6酶活检测相关溶液
2.1.7引物合成与测序
2.2实验方法
2.2.1草甘膦污染土壤细菌总DNA提取和纯化
2.2.2宏基因组文库的建立
2.2.3草甘膦抗性重组子的筛选
2.2.4草甘膦抗性新基因RD aroA的草甘膦抗性检测
2.2.5 RD aroA基因大肠杆菌表达载体的构建
2.2.6 RD EPSPS蛋白表达产物SDS-PAGE分析
2.2.7 RD EPSPS蛋白酶粗提
2.2.8 RD EPSPS酶动力学分析
2.3实验结果与分析
2.3.1土壤细菌DNA的提取
2.3.2宏基因组文库的构建及EPSPS基因克隆
2.3.3草甘膦抗性片段的草甘膦耐受实验
2.3.4RDaroA基因表达载达体的构建及表达
2.3.5RDEPSPS粗酶液的提取
2.3.6RDEPSPS酶动力学分析
2.4讨论
2.4.1土壤总DNA提取方案
2.4.2RDEPSPS的谱系及动力学参数分析
参考文献
第三章草甘膦N-Z酰转移酶保守区预测及抗性相关位点分析
引言
3.1实验材料
3.1.1预测所用的生物信息网站及生物学信息软件
3.1.2供试菌株及质粒
3.1.3酶及生化试剂
3.1.4主要仪器
3.1.5引物合成与测序
3.2实验方法
3.2.1gat基因保守区的预测
3.2.2gat基因的定点突变
3.2.3MT-GATS的草甘膦抗性实验
3.2.4MT-GATS蛋白的诱导表达
3.2.5MT-GATS蛋白的纯化
3.2.6MT-GATS纯化蛋白的透析和浓缩
3.2.7MT-GATS纯化蛋白的定量
3.2.8MT-GATS纯化蛋白的圆二色谱检测
3.2.9MT-GATS纯化蛋白的荧光光谱检测
3.3实验结果
3.3.1 gat基因保守区的预测
3.3.2 gat基因的定点突变
3.3.3 MT-GATS的草甘膦抗性实验
3.3.4MT-GATS蛋白的诱导表达
3.3.5 MT-GATS蛋白的纯化
3.3.6 MT-GATS纯化蛋白的圆二色谱检测
3.3.7 MT-GATS纯化蛋白的荧光光谱检测
3.4讨论
3.4.1 GAT保守位点与草甘膦抗性
3.4.2 GAT保守区的空间位置
3.4.3 S52、I53及p134位点与草甘膦抗性相关的可能机制
参考文献
结论
文献综述
致谢
在读期间发表论文、申请专利情况
四川大学;
宏基因组文库; 5-烯醇丙酮莽草酸-3-磷酸合酶; 草甘膦抗性; 大肠杆菌aroA突变株; 草甘膦N-乙酰转移酶; 定点突变; 活性位点; 除草剂;