中国鱚(Sillago sinica)群体形态学及遗传学研究

摘要

中国鱚(Sillago sinica)隶属于鲈形目(Perciforms)、鱚科(Sillaginidae)、鱚属(Sillago),是新发现的一种鱚属鱼类,目前仅发现于中国东营、青岛及温州附近海域。除新种报道之外,尚未见有关于中国鱚的研究。本文采用传统形态学和耳石形态学多元统计分析以及线粒体DNA多种分子标记对中国鱚群体的形态学特征、遗传多样性进行了研究。
　　传统形态学方面,对东营、青岛和温州近海的中国鱚(S.sinica)3个地理群体共69尾样品进行了常规形态特征测定,以框架测量法测定了18个框架数据,并基于多变量分析法对测量数据进行了统计分析。研究结果表明,中国鱚不同地理群体可数性状上均无显着差异;单因子方差分析结果显示,在27个形态特征值中,东营群体与青岛和温州群体间分别有17个和14个变量存在显着差异,温州和青岛群体间仅有6个变量存在显着差异;聚类分析结果显示,群体间存在交叉现象,无法检测到与地理相对应的分支类群;根据第一和第二主成分构建的散布图显示,东营群体个体相对集中。以上实验结果均表明,中国鱚三个群体间存在一定程度的形态差异,东营群体与其它两群体间形态差异较大。
　　耳石形态学方面,通过Shape Index分析法和傅里叶分析方法,对3个群体,83尾中国鱚耳石的8个形状指标和77个傅里叶谐值进行多元统计分析,结果显示,温州群体形态差异更为显着,而东营群体和青岛群体间相互混杂,形态差异较小,无法形成与地理分支想对应的群体。
　　为检测群体遗传结构及群体间的遗传差异,本研究中扩增并分析了3个地理群体的中国鱚控制区片段序列和Cyt b全序列。在控制区片段分析中,共测定了55个个体,获得了17个单倍型,其中温州群体显示了较高的单倍型分布频率及核苷酸多样性。AMOVA分析的结果也显示,大多数分子变异发生在群体内,而群体间较小,但统计检验是显着的。说明中国鱚3个地理群体间出现了一定的遗传分化。
　　在Cyt b全序列分析中,两两群体间的Fst和AMOVA分析结果表明,温州群体的遗传多态更为显着,而东营和青岛群体显示了较低的遗传多样性。而单倍型系统发育树和单倍型网络关系图结果均显示,群体间遗传差异不显着,不存在显着的系统地理格局。
　　基于耳石形态学标记和线粒体DNA分子标记对东营群体进行了年间差异比较。耳石形态学方面,运用Shape Index分析法和傅里叶分析方法分析了东营群体年间的耳石形态差异,结果显示,两群体年间形态差异较小;遗传学方面,基于K-2P模型计算得到两群体间的平均遗传距离、确切P检验以及FST值均显示,两群体间的遗传分化并不显着。而序列差异研究表明,东营群体年间控制区序列的碱基组成基本相同,基因多样性及核苷酸多样性均处于较低的水平。从以上结果可以看出,两群体间遗传多样性相似,没有显着差异。
　　耳石形态学和遗传学均显示群体间存在一定的遗传分化,且温州群体具有更为显着的遗传差异,东营和青岛群体间差异相对较小。本研究可为进一步分析中国鱚的遗传多样性提供有价值的参考,并为中国鱚的资源利用与保护管理提供理论依据。

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第一章 绪论

1.1 群体遗传多样性的研究方法

1.1.1 传统形态标记（Morphological markers）及其应用

1.1.2 耳石形态标记及耳石研究进展

1.1.3 细胞学标记

1.1.4 生化标记（Biochemical markers）

1.1.5 DNA分子标记

1.2 mtDNA在鱼类系统发育中的应用

1.3 中国鱚研究现状

1.4 本论文的目的及意义

第二章 中国鱚（Sillago sinica）群体形态学初步研究

2.1 传统形态学比较分析

2.1.1 材料与方法

2.1.2 实验结果

2.1.3 讨论

2.2 中国鱚耳石形态学研究

2.2.1 材料与方法

2.2.2 结果与分析

2.2.3 讨论

第三章 基于线粒体DNA控制区及Cyt b的中国鱚种群遗传学研究

3.1 线粒体控制区序列分析

3.1.1 材料与方法

3.1.2 实验方法

3.1.2 结果

3.1.3 讨论

3.2 线粒体细胞色素b（Cyt b）序列分析

3.2.1 实验材料

3.2.2 实验方法

3.2.3 结果

3.2.4 讨论

第四章 东营中国鱚年间差异分析

4.1 东营群体耳石形态差异

4.1.1 材料与方法

4.1.2 结果

4.1.3 讨论

4.2 东营群体线粒体DNA高变区序列年间差异比较

4.2.1 材料与方法

4.2.2 结果

4.2.3 讨论

第五章 结论

参考文献

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