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【6h】

玉米赤霉素响应的编码RNA和长链非编码RNA研究

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目录

摘要

符号说明

第一章文献综述

1.1赤霉素合成通路

1.2赤霉素代谢通路

1.3赤霉素信号通路

1.4赤霉素与矮秆性状

1.5非编码RNA分类

1.6.1长链非编码RNA的来源与分类

1.6.2长链非编码RNA的作用机制

1.7植物长链非编码RNA的功能

1.7.1参与春花作用诱导开花

1.7.2参与花粉发育

1.7.3调控磷元素吸收

1.7.4参与胁迫响应

1.7.5其它功能

第二章玉米赤霉素响应的编码RNA分析

2.1材料与方法

2.1.1材料

2.1.2外源赤霉素处理

2.1.3转录组测序文库构建与测序

2.1.4数据过滤及差异表达基因的发掘

2.1.5差异表达基因的基因本体和通路富集分析

2.2结果与分析

2.2.1高世代回交群体中野生型和矮秆材料D11对外源赤霉素施用的响应

2.2.2转录组测序数据处理

2.2.3野生型材料中差异表达基因

2.2.4野生型差异表达基因GO分析和Pathway分析

2.2.5野生型差异表达基因中含有的赤霉素通路基因

2.2.6高世代回交矮秆种质D11中差异表达基因

2.2.7 D11差异表达基因GO分析和Pathway分析

2.2.8 D11差异表达基因中含有的赤霉素通路基因

2.2.9野生型和矮秆材料D11中共同检测到的差异表达基因

第三章玉米赤霉素响应的长链非编码RNA分析

3.1材料与方法

3.1.1材料

3.1.2外源赤霉素处理

3.1.3转录组测序文库构建与测序

3.1.4数据过滤

3.1.5 LncRNA鉴定和差异表达LncRNA发掘

3.1.6 LncRNA靶基因预测

3.1.8 PCR验证

3.1.9亚细胞定位

3.2结果与分析

3.2.1 LncRNA发掘

3.2.2 LncRNA差异表达分析

3.2.3野生型中差异表达lncRNA的靶基因分析

3.2.4矮秆材料D11中差异表达lncRNA的靶基因分析

3.2.5 lncRNA靶基因中赤霉素通路基因分析

3.2.6 LncRNA验证

3.2.8 LncRNA TCoNS-00025659在不同组织中的表达

3.2.9 LncRNA TCONS_00025659亚细胞定位

3.2.10 LncRNA TCONS_00025659来源

讨论小结

参考文献

附录

致谢

攻读学位期间发表的深信论文目录

声明

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著录项

  • 作者

    赵佳;

  • 作者单位

    扬州大学;

  • 授予单位 扬州大学;
  • 学科 作物遗传育种
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 王益军;
  • 年度 2019
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类
  • 关键词

    玉米; 赤霉素; 编码; RNA; 长链;

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