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论文说明
摘要
第一章 前言
1.1 谱系地理学研究概述
1.1.1 谱系地理学概述
1.1.2 谱系地理学研究相关理论和方法
1.1.3 谱系地理学研究基因组的选择
1.1.4 谱系地理学探讨的问题
1.2 中国亚热带
1.2.1 中国亚热带简介
1.2.2 影响中国亚热带植物分布的几大因素
1.3 中国亚热带谱系地理学研究
1.4 青钱柳研究概况
1.4.1 青钱柳分类地位和生物学特性
1.4.2 青钱柳分布格局
1.4.3 青钱柳国内外研究
1.5 胡桃科现存的几个属的化石记录
1.6 研究目的与意义
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.2.1 基因组DNA提取
2.2.2 引物筛选
2.2.3 PCR扩增和测序
2.3 数据分析
2.3.1 序列比对与拼接
2.3.2 遗传多样性和遗传结构分析
2.3.3 中性检验
2.3.4 种群动态(demography)分析
2.3.5 单倍型系统发育关系分析
2.3.6 单倍型谱系关系分析
2.3.7 单倍型分化时间推测
2.3.8 单倍型地理分布
第三章 实验结果与分析
3.1 总DNA提取结果
3.2 引物筛选结果
3.3 DNA扩增和测序
3.4 单倍型变异和分布
3.4.1 叶绿体单倍型变异和分布
3.4.2 核基因单倍型变异和分布
3.5 青钱柳遗传多样性和遗传结构
3.5.1 遗传多样性和遗传分化分析
3.5.2 空间遗传结构分析
3.6 中性检验
3.7 失配分布
3.8 单倍型间关系和分布
3.8.1 叶绿体单倍型关系
3.8.2 核基因单倍型间关系和分布
3.9 叶绿体单倍型分化时间估算
第四章 讨论
4.1 遗传多样性和遗传结构
4.2 青钱柳第四纪之前的进化历史
4.3 青钱柳的第四纪的进化历史
4.4 青钱柳的保护
第五章 总结
参考文献
致谢