声明
摘要
第一章 绪论
1.1 新一代测序技术的发展现状
1.1.1 测序技术的发展与应用
1.1.2 新一代测序技术的特点
1.1.3 新一代测序技术商业化平台
1.1.4 新一代测序平台发展的局限性
1.2 新一代测序文库制备的发展状况
1.2.1 文库制备的发展
1.2.2 DNA片段化研究的进展
1.2.3 DNA扩增方法研究的进展
1.2.4 现有文库制备方法的优点与不足
1.3 本文研究的方向
1.3.1 本文研究的目的
1.3.2 本文研究的内容
第二章 用于高通量测序文库制备的DNA超声方法的优化
2.1 引言
2.2 实验目的与理论分析
2.2.1 实验目的
2.2.2 理论分析
2.2.3 仪器与样品
2.3 实验步骤与结果讨论
2.3.1 样品与容器类参数的探究
2.3.2 在超声打碎的过程维持温度参数的稳定
2.3.3 仪器与时间参数的综合探究
2.3.4 适合的理想条件的选择
2.4 本章小结
第三章 基于高通量测序平台两端测序文库的制备
3.1 引言
3.2 本文的设计思路
3.3 两端测序文库的技术难点
3.4 双引物的固定磁珠的制备
3.4.1 引言
3.4.2 设备材料与试剂
3.4.3 双引物固定磁珠的步骤
3.4.4 实验结果与讨论
3.5 核酸内切酶V作用于P1切割位点的效率
3.5.1 引言
3.5.2 实验试剂与器材
3.5.3 实验方法
3.5.4 图像扫描与数据处理
3.5.5 实验结果与讨论
3.5.6 结论
3.6 碱性磷酸酶用于P2探针解封闭的效率
3.6.1 引言
3.6.2 实验试剂与器材
3.6.3 实验过程
3.6.4 图像扫描与数据处理
3.6.5 实验结果与分析
3.6.6 结论
3.7 两端测序文库的制备
3.7.1 引言
3.7.2 两端测序文库样品准备
3.7.3 第一轮乳液PCR及磁珠富集
3.7.3 第二轮单步桥式PCR
3.7.4 实验设计层面的改进
3.8 讨论
第四章 总结与展望
4.1 课题研究总结
4.1.1 基于Covaris超声平台的样品打碎优化
4.1.2 基于高通量平台的两端测序文库的建立
4.2 展望
致谢
参考文献
附录