篌竹（phyllostachys nidularia）遗传多样性研究

摘要

该文采用RAPD分子标记技术,研究了篌竹(Phyllostachys nidularia)的遗传多样性,揭示其群体遗传结构,并在遗传多样性研究的基础上,探讨篌竹种质资源的保存方法;采用同样的技术又分析了篌竹五个变型遗传变异的大小.主要结论如下:1.采用19个RAPD引物对篌竹3个天然群体进行扩增和分析,共扩增出307条重复性高、清晰的谱带,分子量从200bp到3000bp不等,其中272条为多态,物种水平的多态条带百分率为88.6％,Shannon多样性指数(I)为0.5040,基因多样性(h)为0.2948,有效等位基因数(Ne)为1.4872,等位基因平均数(A)为1.8860;Popgee32计算出的篌竹3个群体的的基因分化系数Gst为0.8432,基因流(Nm)为0.0930,TFPGA计算出的分化度Fst值为0.8950,利用Shannon多样性指数分析的群体间遗传多样性比例为(Hsp-Hpop)/ Hsp=0.8432,这些结果表明篌竹天然群体内存在着丰富的遗传多样性,并且群体间的遗传分化很高;通过计算三个群体间的遗传距离和相似性显示,篌竹天然群体的遗传距离和空间距离之间存在着显著的相关性.2.由200条RAPD引物中筛选出19条引物对篌竹5个种下变异类型进行扩增和分析,共扩增出209条谱带,其中146条为多态,物种水平的多态条带百分率为69.86％,结果显示篌竹的不同变型之间也存在着一定的差异.同时也表明RAPD分子标记对竹类植物种下等级进行分类有一定的可靠性,可以成为研究竹子种内遗传的有力工具.

目录

文摘

英文文摘

致谢

第一章文献综述

1.1遗传多样性概述

1.1.1遗传多样性的概念

1.1.2研究遗传多样性的意义

1.1.3遗传多样性的检测方法

1.2群体遗传结构及其影响因素

1.2.1群体遗传结构的概念

1.2.2群体遗传结构的影响因素

1.2.3 RAPD分子标记及其在群体遗传结构研究中的应用

1.2.4植物群体遗传结构与保护策略的制定

1.2.5研究植物群体遗传结构的意义和展望

1.3竹类植物遗传多样性研究

1.4本研究的目的与意义

第二章篌竹野生群体遗传结构的研究

2.1样品采集

2.2主要仪器与试剂

2.3实验方法

2.3.1篌竹总DNA提取与纯化

2.3.2扩增条件和扩增体系的确定

2.3.3 RAPD-PCR分析

2.3.4引物筛选

2.3.5数据分析

2.4结果与分析

2.4.1 DNA的提取与纯化

2.4.2引物的筛选

2.4.3遗传多样性

2.4.4群体间遗传分化

2.4.5群体间遗传距离

2.5分析与讨论

2.5.1基因组DNA的制备

2.5.2 RAPD试验的稳定性

2.5.3篌竹群体遗传多样性和遗传结构

2.5.4遗传多样性保护

2.5.5进一步工作的方向

第三章篌竹不同变异类型的RAPD分析

3.1实验材料

3.2主要仪器与试剂

3.3实验方法

3.3.1 DNA的提取与纯化

3.3.2引物筛选

3.3.3 PCR扩增

3.3.4扩增产物检测

3.3.5数据处理

3.4结果与分析

3.4.1引物的筛选

3.4.2 PCR扩增结果

3.4.3聚类及遗传关系分析

3.5分析与讨论

第四章主要结论

4.1篌竹基因组DNA的提取

4.2篌竹RAPD分析

4.3篌竹野生居群遗传结构分析

4.4篌竹种质资源的保护策略

4.5篌竹的种下变异分析

参考文献