声明
摘要
缩略语表
1前言
1.1问题的提出
1.2分子标记的开发
1.2.1分子标记的类型
1.2.2简化基因组技术的比较
1.3遗传图谱的构建
1.3.1作图群体的选择
1.3.2茶树遗传作图的策略
1.3.3茶树遗传图谱的研究现状
1.4 QTL作图
1.4.1 QTL作图策略
1.4.2茶树数量性状QTL作图的研究现状
1.4.3 QTL的精细定位
1.5本研究的目的和意义
2.材料与方法
2.1材料与试剂
2.1.1植物材料
2.1.2主要试剂
2.2实验方法
2.2.1茶树F1群体的来源
2.2.2茶树SNP高密度遗传图谱构建
2.2.3群体数量性状的表型测定
2.2.4 QTL作图
2.2.5 SNP注释与候选基因筛选
2.2.6 qRT-PCR验证生长势候选基因
3结果与分析
3.1茶树SNP高密度遗传图谱构建
3.1.2 2b-RAD标记开发
3.1.3 SNP遗传连锁图谱
3.2作图群体的表型变异
3.2.1花青素含量的群体变异
3.2.2作图群体生长势的表型变异
3.3数量性状的QTL定位
3.3.1花青素的QTL作图
3.3.2生长势的QTL作图
3.3.3部分数量性状的重定位
3.3 SNP的比对与注释
3.3.1 SNP标记比对
3.3.2 SNP标记注释
3.4候选基因筛选与qRT-PCR验证
3.4.1候选基因筛选
3.4.2候选基因TEA009062.1的qRT-PCR验证
4讨论
4.2茶树群体构建和作图策略
4.3茶树遗传图谱的加密
4.4数量性状的QTL分析
4.4.1花青素的QTLs
4.4.2生长势的QTLs
4.4.3重定位性状的QTLs
4.5数量性状的候选基因挖掘
4.5.1花青素相关候选基因筛选
4.5.2发芽期相关候选基因筛选
4.5.3生长势相关候选基因筛选
4.6候选基因TEA009062.1的初步验证
4.7总结与展望
参考文献
附录
致谢