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【6h】

基于信息熵与深度森林的蛋白质亚细胞位置预测

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第1章 绪论

1.1 研究背景与意义

1.2 国内外研究现状

1.3 本文研究内容

1.4 论文组织结构

第2章 相关研究方法

2.1 蛋白质亚细胞位置预测方法框架

2.2蛋白质序列信息特征表示方法

2.2.1基于氨基酸组成信息的特征表示方法

2.2.2基于氨基酸理化性质的特征表示方法

2.3 蛋白质进化信息特征表示方法

2.3.1位置特异性矩阵

2.3.2基于PSSM的进化信息特征表示方法

2.4 分类算法

2.4.1 SVM算法

2.4.2 随机森林算法

2.4.3 集成算法

2.5 本章小结

第3章 基于信息熵与自协方差的蛋白质特征表示

3.1 IE-MoACC-PFR方法

3.1.1蛋白质序列信息特征提取

3.1.2 蛋白质进化信息特征提取

3.2 数值实验及性能分析

3.2.1 数据集介绍

3.2.2评价指标

3.2.3 参数敏感性分析

3.2.4 对比方法介绍

3.2.5 实验结果分析

3.4本章小结

第4章 基于特征选择的深度森林改进模型

4.1深度森林

4.2 基于特征选择的深度森林改进模型

4.3 数值实验及性能分析

4.3.1实验设置

4.3.2实验结果分析

4.4本章小结

第5章 基于禁忌搜索的深度森林改进模型

5.1 禁忌搜索

5.2 基于禁忌搜索的深度森林改进模型

5.3 数值实验及性能分析

5.3.1实验设置

5.3.2实验结果分析

5.4本章小结

第6章 总结与展望

6.1 本文工作总结

6.2 未来工作展望

参考文献

致谢

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