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Localization of gene expression regions in Drosophila embryonic images

机译:果蝇胚胎图像中基因表达区的定位

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摘要

Automatic localization of gene expression regions in Drosophila embryonic images is an important step in a computational system for the discovery of patterns of gene-gene interaction. In this paper, we propose a thresholding framework that selects an optimal threshold via a consistency criterion on good candidate thresholds provided by multiple response functions, including intensity histograms. In experiments, we test the proposed framework, being compared with four well-known methods, on images in Berkley Drosophila Genome Project (BDGP) dataset, and obtain promising results.
机译:果蝇胚胎图像中基因表达区域的自动定位是计算系统中发现基因与基因相互作用模式的重要步骤。在本文中,我们提出了一个阈值框架,该框架可以通过一致性标准在多个响应函数(包括强度直方图)提供的良好候选阈值上选择最佳阈值。在实验中,我们在伯克利果蝇基因组计划(BDGP)数据集中的图像上测试了提出的框架,并与四种众所周知的方法进行了比较,并获得了可喜的结果。

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