广西地区2008-2011年猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2基因的遗传变异分析

摘要

为了解广西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况，对2008-2011年间来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行Nsp2基因的扩增和测序分析。结果显示，所获得的49个毒株均为美洲型毒株，其中46株具有高致病性变异毒株的序列特征，即其Nsp2蛋白缺失第481位aa和第533-561位aa，其余3株不具有上述缺失，属于PRRSV传统毒株。广西地区49个毒株Nsp2基因问的核苷酸序列及其推导氨基酸序列的同源性为84.8％-99.7％和89.7％-99.6％;与VR-2332、CH—1a、HB-1及JXA1株的核苷酸序列及其推导氨基酸序列的同源性分别为80.5％-83.7％和74.5％-77.9％、89.7％-92.6％和84.4％-88.4％、92.4％-96.3％和89.0％-94.5％、92.8％-99.3％和88.7％-99.3％，而与LV株核苷酸序列及其推导氨基酸序列的同源性仅为51.0％-53.9％和29.6％-32.5％。基于Nsp2基因核苷酸序列所绘制的遗传进化树，可将所有美洲型PRRSV毒株分为4个亚群，广西地区的49个毒株有3株分布在以HB—1株为代表的Ⅲ亚群，46株分布在以JXA1株为代表的IV亚群。表明，当前广西PRRSV流行毒株均为美洲型毒株，并且以Ⅳ亚群为优势基因亚群，各毒株间的Nsp2基因序列存在一定的差异，但没有明显的地域特征。