山羊ACOX1基因剪切体变异及其差异表达规律研究

摘要

作为过氧化物酶体脂肪酸β氧化通路的第一个反应酶和关键限速酶,过氧化物酶体增殖物激活受体a(PPARα)的下游调控基因,酰基辅酶A氧化酶1(ACOX1)对脂肪酸的氧化和沉积是至关重要的,尤其对于超长链脂肪酸的新陈代谢十分关键.ACOX1的可变剪接事件已经在啮齿动物、尼罗河罗非鱼、斑马鱼和人类中被发现,但在山羊上仍是空白.于此,检测到了山羊ACOX1基因的新剪切体和完整的转录本,并将新剪切体命名为ACOX1-SV1.ACOX1-SV1编码序列的长度为1983bp,并且完整转录本ACOX1相比,它的第2外显子是由部分的旧外显子2和部分内含子1组成.蛋白质序列分析表明ACOX1-SV1在不同的物种是十分保守的.逆转录定量实时聚合酶链反应(RT-qPCR)分析表明,这两种亚型表达存在着时间和组织特异性,在哺乳期个体中,ACOX1和ACOX1-SV1在肝、脾、脑和脂肪组织高表达,而在成年个体中,它们在脂肪、肝脏和脾脏中大量表达.有趣的是,无论是哺乳期还是成年期的脂肪中,ACOX1的mRNA表达水平远远高于ACOX1-SV1.相比之下,在肝脏中ACOX1-SV1的表达明显高于ACOX1.这样的差异表达模式表明剪切体的变异存在着组织特异性剪接调控模式.这些新发现能为进一步的研究ACOX1功能提供新的见解,并且对于其变异的研究也将在山羊育种,尤其是关于提高肉质性状的育种中提供助力.