食管癌中circRNA差异表达研究

摘要

目的：分析食管癌和癌旁组织中circRNA表达模式,探讨差异表达circRNA可能的功能. 方法：选取3对手术切除食管癌和癌旁组织RNA进行去线性化测序,应用配对样本t检验分析食管癌和癌旁组织中circRNA表达差异(P＜0.05,FoldChange＞2).针对circRNA接口位点设计引物,并对产物进行PCR测序验证.选取收集到的经病理验证的食管癌和癌旁组织,分别提取RNA采用实时荧光定量PCR法检测人群样本中circRNA差异表达情况.利用circRNA的来源基因信息,对差异表达circRNA进行GO富集和KEGG pathway分析. 结果：食管癌和癌旁组织中存在大量circRNA,这些circRNA可能与多种miRNA及mRNA相互作用. 结论：食管癌和癌旁组织中circRNA表达存在差异,差异表达的circRNA可能在食管癌进程中发挥重要作用.