基于高通量基因测序分析滨海湿地公园水体细菌种群特征

摘要

为研究天津临港滨海湿地公园水体中细菌种群特征,采用16S rDNA高通量测序方法对公园内水体细菌基因组DNA进行序列分析.结果发现:湿地公园整体运行良好,细菌种群Shannon多样性指数在3.0705-4.6881之间,Chao指数在473.22-995.81之间,不同采样点细菌种群多样性和丰富度均存在差异;检测得到细菌共35门、74纲、158目、283科、539属、820种,在门和属水平下进一步分析,发现变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)为主要优势门,各采样点第一优势门及其丰度百分比分别为:变形菌门(42.9％)、变形菌门(67.8％)、蓝细菌门(44.2％)、蓝细菌门(47.5％)、变形菌门(29.5％)、蓝细菌门(40.3％)、蓝细菌门(41.0％)、蓝细菌门(41.3％)、蓝细菌门(42.5％)、蓝细菌门(34.7％);聚球藻属(synechococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、norank_f__LD29、hgcI_clade、红细菌属(Rhodobacter)、unclassified_f__FamilyI_o__SubsectionI为主要优势属,各采样点第一优势属及其丰度百分比为:红细菌属(14.6％)、嗜冷杆菌属(44.1％)、聚球藻属(21.3％)、聚球藻属(25.0％)、聚球藻属(14.0％)、聚球藻属(24.6％)、聚球藻属(22.2％)、聚球藻属(24.66％)、聚球藻属(25.2％)、聚球藻属(17.5％).细菌种群结构差异性的产生主要受到NO3_、NH4+、T、pH、DO等环境条件影响,在主要优势属中,嗜冷杆菌属与研究区域环境条件的相关性最强。