短喙型鹅细小病毒(SBDS-GPV)M15株全基因序列分析

摘要

根据GenBank登录的水禽细小病毒基因序列和基因组结构特征,采用PCR技术扩增获得半番鸭源短嘴型鹅细小病毒M15株(SBDS-GPV M15)全基因序列.M15株病毒全基因大小为5030nt,其基因组5'端和3'端均含有相同的末端倒置重复序列(inverted terminal repeats,ITR),ITR全长为404nt.M15基因组主要由左右两侧两个开放阅读框组成,左侧编码非结构蛋白(non-structure protein,NS),右侧编码3种结构蛋白(viral structural protein,VP).NS基因全长为1884nt,VP1基因全长2199nt.M15株病毒全基因和樱桃谷鸭源GPV核苷酸同源性最高,高达96％.上述结果为进一步明确SBDS-GPV分类地位以及进化关系提供依据,也为研究SBDS-GPV致病机理和研发基因工程疫苗奠定基础.