油茶炭疽病菌种群遗传结构研究

摘要

油茶炭疽病是油茶最重要的病害之一.目前对于该病原菌种群的遗传结构尚未见报道.研究病菌种群的遗传结构对制定科学的防治方法具有重要意义.本研究比较中国6个省12个不同地区的126个胶孢炭疽菌的ITS序列的差异,以期研究各不同群体的单倍体型多样性,不同地区群体之间的遗传关系,以及遗传距离与地理距离的线性关系.遗传分析发现,得到的126个胶孢炭疽菌样品ITS序列可定义为27种单倍体型.27种单倍体型中,一个主要的单倍体型(Haplotype12)含有78个样品,且基本上每个样品采集地都有分布.遗传分化指数(Fst)表明病菌不同地理种群间的遗传分化较大.AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的6％,种群内部变异占总变异的94％.Mantel测试显示地理距离与遗传距离具没有显著的线性关系.对所有地理种群病原菌ITS序列的核苷酸不配对进行分析,发现油茶炭疽病菌未经历过大规模的种群扩张过程.系统发育分析表明,来自不同地区的油茶炭疽病菌散乱的分布在系统树中.研究结果表明油茶炭疽病菌种群具有丰富的遗传多样性.