缅甸蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析

摘要

蝙蝠是许多人兽共患病毒的储存宿主,并可以将其传播给人类和其他动物。为了掌握边境地区蝙蝠病毒情况,防范蝙蝠病毒跨境传播,本研究在邻近中国云南省的缅甸的两个县采集到816只蝙蝠,分属2个种,然后通过基于Solexa高通量测序的病毒宏基因组学技术对蝙蝠组织进行病毒组学研究,最终获得平均长度为114个碱基的读长(Reads)3742314条,并拼接成1649512条重叠序列(Contigs).通过序列注释发现,2%(26698条)的重叠序列与病毒相关,能进一步注释到24个病毒科,其中45%的病毒序列(12086/26698)系脊椎动物病毒,28%的(7443/26698)系昆虫病毒,27%(7074/26698)的系噬菌体,还有95条序列系植物病毒。根据病毒宏基因组学结果,对所有蝙蝠样品进行特异性的PCR或RT-PCR扩增鉴定,发现许多新的蝙蝠病毒,包括星状病毒、博卡病毒、圆环病毒、软化病毒,获得了它们在蝙蝠中的流行情况。本研究旨在了解缅甸蝙蝠携带的病毒组的构成,初步明确了边境地区蝙蝠病毒的生态学,为防范蝙蝠病毒跨境传播提供了数据,同时也进一步丰富了蝙蝠携带病毒种类。

著录项

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号