预测药物和蛋白质相互作用划分天然药物化学成份升压机制的研究

摘要

一种通过化合物-蛋白质相互作用的方法被应用去评估升压机制.本文的方法假设不同升压机制的化合物应该结合到不同的靶标蛋白,因此不同的机制可以通过化合物-蛋白质相互作用予以区分.首先,与血压升高有关的天然药物成份和靶标蛋白被收集,使用一个随机森林模型计算化合物-蛋白相互作用概率,然后根据参考文献和其它方法判断可信度.从一个热图、化合物-蛋白相互作用网络图,可以清晰地观察到天然药物成份和不同的靶标蛋白的相互作用关系.最终,使用主成份分析对这些预测概率进行处理,这些升压靶标能够划分为三个大的区域.本章探索了使用化合物-蛋白质相互作用进行药理(毒理)机制分类的可行性,这个方案同时也适用于未知化合物的药理(毒理)机制推导.