汉坦病毒H8205株基因组全序列分析

摘要

采用RT-PCR技术扩增出汉坦病毒H8205株L、M、S基因序列,利用5'-RACE和3'-RACE扩增出基因的末端,将其分别克隆于pGEM-T Easy载体上进行序列测定,利用重叠片段拼装出汉坦病毒H8205株的基因组全序.结果表明所测汉坦病毒基因的L片段长度为6533bp,最大读码框架从37到6492,共编码2151个氨基酸;M片段长度为3615bp,最大读码框架从41到3446,共编码1135个氨基酸;S片段长度为1699bp,最大读码框架从37到1324,共编码429个氨基酸.利用DNAstar进行同源性比较,汉坦病毒H8205株的L基因与汉坦病毒不同株氨基酸同源性为68.6％～98.3％,M基因与同型汉坦病毒氨基酸同源性为85.2％～99.7％,S基因与同型汉坦病毒氨基酸同源性为97.2％～99.8％.绘出了3个片段的系统发生树,进行生物信息学分析,为研究汉坦病毒H8205毒株的生物学特性、分子机制等提供了基础.