猪传染性胃肠炎病毒全基因组克隆与序列分析

摘要

猪传染性胃肠炎是由猪传染性胃肠炎病毒引起的一种急性、高度接触性传染病,以呕吐、水样腹泻、脱水和对2周龄以内仔猪高度致死率为特征,病毒基因组为单股正链RNA,具有感染性。全长约28.5kb,包括8个功能基因,可编码4个结构蛋白(纤突蛋白S、外膜蛋白sM、膜蛋白M、核衣壳蛋白N)和4个非结构蛋白。病毒感染细胞后,首先在自身编码RNA复制酶的作用下产生负链RNA,然后在转录酶的参与下,合成子代RNA和7个亚基因mRNAs.基因组5'端20kb为ORF1,编码复制酶聚蛋白,即PP1a和PP1ab,其余3'端8.3kb包括mRNAs表达的全部基因,病毒基因组顺序为5'-ORF1-s-3a-3b-sm-m-n-7-3'.迄今GenBank仅公布了2株TGEV全基因组序列(PUR46-MAD,NC002306和TS,DQ201447)。目前，国外学者己从猪传染性胃肠炎病毒基因组全长cDNA拯救出了具有感染性的病毒粒子，然后在体外对病毒基因组进行人工操作，研究病毒复制、致病机制及病毒与宿主细胞之间的关系。本文对TGEVSC-Y株基因组进行了克隆和测序，这为SC-Y株的亲源关系判定提供了分子理论依据，也为研究病毒基因功能及进一步开展TGEV反向遗传打下了良好基础。