生物医学文献中的蛋白质相互作用关系抽取系统

摘要

从生物医学文献中抽取蛋白质(基因)相互作用关系对蛋白质知识网络的建立,蛋白质关系的预测,新药的研制等均具有重要的意义。本文提出了一个生物医学文献中的蛋白质相互作用关系抽取系统。该系统首先使用条件随机域模型对文献进行实体识别,然后通过指代消解和链接语法分析等将复杂句子划分为简单句,最后通过识别句子的语法成分从这些语法成分和它们的组合中抽取蛋白质(基因)相互作用关系。本文的最后给出了实验结果和错误分析。