高致病性猪蓝耳病病毒ORF5基因和NSP2基因变异分析

摘要

采用RT-PCR方法对2006～2007年华南地区部分省份的疑似PRRS阳性病料进行克隆和测序，获得13个Nsp2基因的部分序列片段和14个ORF5基因片段。序列分析结果表明，所获得的13个Nsp2基因序列中均有两个区域存在明显缺失，核苷酸的同源性为96.9～99.1%，与中国代表毒株CH-1a、美洲株代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性分别为85.1～86.4%和67.2～68.9%，与疫苗株MLV的同源性在67.6～68.9%之间，而与欧洲株代表株LV的同源性在54.1～55.9%之间；获得的14个ORF5基因序列不存在缺失现象，核苷酸的相似性为同源性为98.8～99.7%，推导编码氨基酸同源性为96.5～99%。与国内毒株相比，核苷酸同源性为85.2～100%，氨基酸同源性为84.6～99%%；与中国代表毒株CH-1a、美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性分别在94.4～95.2%和86.7～87.9%之间，与疫苗株MLV的同源性在86.4～87.6%之间，而与欧洲型代表株LV的同源性在54.1～55.7%之间，推导编码的氨基酸序列同源性则分别在91.5～93.5%，86.6～88.6%，85.6～87.6%，54.7～56.2%之间。结果表明所获得序列的流行毒株均属于美洲型，进一步分析发现这些毒株可能均起源于同一个毒株，通过猪只运输流通等途径在全国范围流行扩散。