鸡源鲍氏志贺茵hn03株的分子鉴定与起源分析

摘要

以鸡源鲍氏志贺菌为研究对象，分别根据G-enBank中登陆的相应序列针对八个管家基因thrB/th，trpC/trpB,purM/purN,mdh/R设计8对引物，用鸡源鲍氏志贺菌基因组DNA为模板，分别扩增出八个目的基因，并克隆到PMD18-T vector中，进一步进行了序列测定。序列测定结果已经登陆C-enBank(按照上述顺序登陆号分别为：DQ995264，DQ995265，DQ995261，DQ995263，DQ995260，DQ995258，DQ995259，DQ995257)。利用BLAST和ClustalX程序分析测序结果，并构建了八个管家基因在染色体上4个区域的相应遗传进化树。由八个管家基因在染色体上4个区域的系统进化树可知：志贺菌分为三个主要分支，且均落在大肠杆菌中，本研究中的分离菌株鸡源鲍氏志贺菌在染色体上4个区域的进化树中分布位置是一致的，均落在志贺菌三个主要分支中的第一分支；从整个基因水平上看，鸡源鲍氏志贺分离株应起源于人源志贺菌。我们预测了该株鸡源鲍氏志贺菌起源于50,000-270,000年以前。