利用局部基因网络模式的方法寻找复杂疾病的新靶点基因

摘要

人类的许多复杂疾病如：糖尿病、癌症、肥胖等已严重地威胁着人类的身体健康,成为一个急待解决的世界性难题。这些复杂疾病一般对应着一群直接相关基因,目前认识复杂疾病相关基因的研究手段仍然非常有限,生物学家们还缺乏有效地认识多个基因间互相作用的方法,短期内也很难弄清楚这些基因在复杂的细胞网络中的作用方式.随着人类基因组测序工作的完成以及相应的基因组学乃至系统生物学研究手段的建立,产生了大量功能基冈研究数据,在此基础上建立一批较为可行的计算或分析方法用以处理多基因之间的复杂关系已经有较高的可行性。局部基因网络模式( LGNP)方法的用途之一是可以寻找疾病新的靶点基因.利用特定疾病的己知相关基因或利用基因表达芯片确定一批疾病/正常之间的差异表达基因，通过KEGG (www.kegg.com)分子通路信息将这些基因连接起来.本方直观地发现一些新的相关基因并且非常明了地看出其和其他已知相关基因的连接状态及关系;反映疾病相关基因间的作用状态;并反映其主要的信号传导通路之间的组合变化方式，可以从信号传导通路的角度来更加针对性地开展疾病的治疗及预防等方面的研究.