利用基因组比对方法寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列

摘要

目的:寻找大肠杆菌DH1基因组中的非必需序列.方法:采用基因组比对的方法,通过软件MAUVE分别对大肠杆菌DH1与miniMG1655、miniW3110进行基因组比对,筛选得到大肠杆菌DH1基因组中的候选非必需序列,进而以基因必需性评分的方法确定非必需序列.结果与结论:通过基因组比对及基因必需性评分的方法,确定了大肠杆菌DH1基因组中64个非必需序列区域,占全基因组的26.3％.非必需序列区域的确定,为后续构建基因组减小的大肠杆菌miniDH1提供了基础.