表观遗传

摘要： 背景:牙周炎是发生在牙周支持组织的炎症,具体表现为牙龈的炎症及牙槽骨吸收。巨噬细胞可通过M1,M2极化在牙周炎发生发展中发挥作用,影响牙周炎的病情进展。目的:通过对巨噬细胞极化与牙周炎的关系及其相关机制进行综述,为牙周炎的临床治疗提供思路。方法:第一作者利用Pub Med和中国知网数据库检索1991-2022年发表的相关文献,以“macrophage polarization,M1/M2 macrophage”等为英文检索词,以“巨噬细胞极化、M1/M2巨噬细胞、牙周炎”等为中文检索词,阅读每篇文献的文题、摘要进行初筛,最终筛选出97篇文献进行归纳分析。结果与结论:①巨噬细胞作为人体固有免疫细胞,在炎症发生发展过程中起重要作用。巨噬细胞在环境刺激下会发生极化,且巨噬细胞极化是一个复杂的过程。②JAK/STAT、TLRs/核转录因子κB、PI3K/Akt等信号通路,炎症因子如肿瘤坏死因子α、干扰素γ、白细胞介素4和白细胞介素13等,以及表观遗传学等均可影响其极化。③巨噬细胞M1型极化促进炎症进展,巨噬细胞M2型极化发挥抗炎作用。④不同极化类型的巨噬细胞通过各种信号通路及分泌炎性因子等在牙周炎疾病过程中发挥促炎或抗炎作用,且通过多种途径影响骨吸收与骨形成,进而影响牙周炎的进展。⑤巨噬细胞通过相关机制进行极化,极化后的巨噬细胞又可以在牙周炎过程中发挥抗炎或促炎作用,对牙周炎进展产生影响。⑥研究巨噬细胞极化在牙周炎发病过程中的作用及机制对牙周炎治疗有重要意义,但目前对于巨噬细胞极化机制不完全明确,因此发现其极化的潜在机制,并将其与牙周炎治疗结合,促进牙周炎过程中巨噬细胞向M2型转化及其所占比例或者抑制或减少M1型巨噬细胞表达,对未来牙周炎治疗有重要意义;将表观遗传与巨噬细胞极化及牙周炎联合,从基因和蛋白水平上治疗牙周炎,可能成为临床上治疗牙周疾病的一种有效的方法。

摘要： 背景:干细胞具有自我更新和多能定向分化潜能,是机体维持生理功能所必须的,并在多种疾病发生发展以及疾病治疗与器官移植等方面具有重要意义。近年研究发现m6A甲基化修饰可调控干细胞生物学特性在多种疾病中发挥重要作用。目的:文章主要就m6A甲基化修饰对干细胞的自我更新、定向分化以及其免疫学特性等生物学过程的最新研究进展进行综述。方法:以“stem cells,m6A,RNA methylation,biological characteristics,self-renewal,proliferation,differentiation,immunization”为英文检索词,以“干细胞、m6A、甲基化、生物学特性、自我更新、增殖、分化、免疫”为中文检索词,检索Pub Med、Web of Science以及中国知网数据库1955-2022年的相关文献,最后纳入88篇文献进行综述。结果与结论:m6A作为真核生物m RNA中丰度最高的表观遗传学修饰,也是当前表观遗传学研究的热点,由甲基转移酶、去甲基化酶和甲基阅读蛋白组成,已成为一种重要的转录组标记。m6A甲基化修饰调控干细胞生物学特性方面得出以下结论:(1)m6A甲基化修饰可通过相关的酶靶向调节细胞周期转化、增殖相关分子的转录后翻译、DNA复制过程中关键酶的表达、向特定细胞的分化、免疫检查点分子的表达以及对放化疗药物的敏感性等,进而在治疗恶性疾病、延缓病情、改善预后发挥着关键作用。(2)m6A相关酶分子与干细胞的增殖与自我更新、定向分化以及免疫调节方面的生物学特性关系密切,可作为药物治疗的靶标。(3)m6A甲基化修饰对人类疾病的研究尚处于基础研究阶段,且部分恶性疾病的m6A修饰机制尚未深入探究清楚,随着表观遗传学的发展,RNA m6A修饰在治疗恶性疾病以及临床转化过程中有望实现新的突破。

摘要： 急性髓系白血病(AML)的病因目前尚未完全阐明,研究发现其与异常的表观遗传学改变密切相关.DNA甲基化是由DNA甲基转移酶(DNMT)介导的表观遗传过程.DNMT由DNMT1、DNMT3A和DNMT3B组成,是高度保守的DNA修饰酶,其在表观遗传调控中发挥重要作用,并与AML的临床特征与治疗效果的关系十分密切.深入了解DNMT在AML中的作用,有助于阐明AML的发生机制,并为其临床治疗提供潜在的靶点.

摘要： 为了使小组各成员各司其职,将小组成员进行详细的划分,增强学生间的沟通合作能力。根据新课程标准的内容要求、学业要求和学业质量标准,并围绕培养学生生物核心素养,对“基因表达与性状的关系”一节进行教学设计,以期学生能够达成知识学习和小组合作的共同发展,使学生获得解决实际问题的探究能力和必备的思维品质。同时,表观遗传属于新课程标准中的内容知识,能够为高中生物教学提供一定的参考和应用价值。

摘要： 胎儿血红蛋白是胎儿体内主要的血红蛋白类型,是由两条α肽链和两条γ肽链组成的四聚体。出生后胎儿血红蛋白在人体中的表达急剧降低至1%,由两条α肽链和两条β肽链组成的成人血红蛋白取而代之成为主要的血红蛋白类型。β地中海贫血和镰刀型细胞贫血发病原因均基于β-珠蛋白基因发生突变,致使β-珠蛋白合成不足或异常,进而引起一系列临床症状。诸多实验结果及临床疗效表明,提高患者体内γ-珠蛋白的表达可部分替代异常β-珠蛋白从而有效缓解患者的临床症状。随着基因治疗的发展,如何安全高效的再激活胎儿血红蛋白的表达成为治疗β型地中海贫血和镰刀型细胞贫血患者的重要科学命题。本文重点回顾近年来γ-珠蛋白表达的调控机制,以期对寻找更加有效激活胎儿血红蛋白的方法提供参考。

摘要： 国际放射防护委员会(ICRP)第121任务组(TG 121)是ICRP 2021年主委员会会议设立的一个任务组,任务是准备《电离辐射照射对后代的影响》的报告,报告目的是:(1)重新审议关于人类和非人类物种个体后代受到电离辐射照射后辐射诱发效应的相关科学文献。审议将包括两个主要部分:由于双亲受到照射后产生的孕前效应:遗传效应和隔代效应(涉及遗传和表观遗传机理及对疾病的影响)、及对生育和繁殖力的影响。

摘要： 基于图尔敏论证模型和PBL教学策略,选择蜜蜂的雌蜂幼虫的发育分化和小鼠毛色杂交的典型实例,利用图尔敏论证模型结合PBL教学策略,促使学生建构表观遗传概念,发展科学思维.

摘要： 类风湿关节炎(RA)是以关节肿胀、发热、疼痛、功能障碍和变形为主要特征的自身免疫性疾病,关节病变常会导致关节残疾和生活质量下降。因为对RA发病机制的认识仍受疾病异质性的限制,RA靶向治疗仍不理想。N6-甲基腺苷(m6A)的修饰对于包括免疫应答在内的多种生物过程是必需的。该文通过对m6A表观遗传修饰参与RA发病的梳理,进一步研究M6A甲基化在RA中的作用机制,以期更好的服务于临床。

摘要： 染色质开放性是指核小体或转录因子等蛋白与真核生物染色质DNA结合后,对其他蛋白能否再结合的开放程度,这一特性能够反映转录活性。染色质结构是动态变化的,染色质开放性与动物生长发育、细胞分化等过程密切相关,基因组开放染色质高效精准定位可为解析基因表达调控机制提供重要线索。本文介绍染色质开放性检测方法、染色质开放性的影响因素,重点阐述染色质开放性与动物发育的关系并对其发展及应用前景进行阐述,以期为动物发育基因表达调控等相关研究提供参考依据。

摘要： 中心体相关蛋白55(CEP55)可调节细胞质分裂过程,且是其中关键的调节因子。CEP55不仅在正常细胞中发挥作用,还可导致某些遗传疾病的发生,但具体机制仍需进一步研究验证。此外,CEP55还是一个促瘤因子,参与多种实体及血液肿瘤的发生发展,并影响肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭以及转移等生物学行为,因此有可能成为肿瘤治疗靶点及预后评估指标。目前关于CEP55在肿瘤发生发展中的研究涉及信号通路、表观遗传学等方面,因此,进一步研究CEP55在恶性肿瘤中的作用及机制有助于理解恶性肿瘤的生物学特征,对肿瘤的诊治具有重要意义。

摘要： 环境因素是能影响基因表观遗传调控的重要因素，因此一个新的研究方向正日趋成熟：哮喘的表观遗传发病机制。后文将从DNA甲基化、组蛋白乙酰化和micro RNA三个方向对这一领域作简单介绍。近年来，大量的研究已经初步揭示了表观遗传调控机制在哮喘发病中的作用，涵盖哮喘免疫应答T细胞的分化、炎症细胞的浸润与炎症因子的表达、气道高反应性、气道重构以及对治疗的反应等诸多领域，极大地填补了人们对哮喘的认知空白，并为新治疗方法的开发提供了崭新的思路与靶点。

摘要： 目的：本文研究ALK阻滞白血病细胞进入增殖周期,诱导原始细胞分化的作用,并通过DNA甲基化表观遗传的调控而抗白血病.rn 方法：①中剂量ALK孵育K562,HEL,SHI-1和Meg-01白血病细胞48h，流式细胞术检测对细胞增殖周期的影响。②Western blot分析增殖相关MAPK信号传递途径多种蛋白激酶的表达水平。rn 结果：ALK有效地阻滞白血病K562,HEL,SHI-1和Meg-01进入增殖周期，S期细胞的百分率显著下降，增殖指数(%)明显低于对照细胞。同时，上调细胞周期抑制因子P21蛋白的表达水平。rn 结论：ALK通过阻滞细胞增殖周期，上调周期抑制因子而有效地抑制白血病细胞的异常增殖。诱导分化是药效学研究的突破点，具有重要的实用价值。ALK通过诱导DNA甲基化表观遗传的调控，上调抑癌基因、DNA修复和分化相关基因，下调致癌基因和抗凋亡基因的表达，而发挥抑制增殖和诱导分化的抗白血病功效，机制不同于传统化疗药。综合其它的白血病动物模型、细胞学、分子实验及毒理学等结果，证明ALK能够有效地抗白血病而无明显毒副反应，为中药5类新药的开发奠定基础，可成为安全有效治疗白血病的中药新药。

摘要： 本文介绍了人类miRNA的转录机制，研究了miRNA启动子区域的预测、转录因子结合位点预测、miRNA启动子确定和DNA甲基化、组蛋白修饰、DNA甲基化和组蛋白修饰结合及miRNA反向调节的表观遗传机制。

摘要： 纤维化和肿瘤的发生都涉及到信号通路的异常,本文就表观遗传对纤维化和癌症发生中信号通路的影响进行了详细分析,指出表观遗传在信号通路中的作用并未达成一致,某个信号通路的改变是因为表观遗传作用于某一分子后引起下游信号的改变还是直接作用于下游分子引起的效应，这些都需要进一步的探讨.石英能够导致信号通路异常引起纤维化，但是石英在致病过程中表观遗传对信号通路的影响的文献目前报道较少.所以,表观遗传学在石英粉尘致病过程中机制的研究将有助于发现新的生物标志物对石英所致疾病进行诊断、判断预后、并且也有助于开发新的药物。

摘要： 最新的证据表明，当胚胎(胎儿)发育编程受到营养和外源物等多种环境因素影响，关键基因的表观遗传修饰异常，可能诱导胚胎甚至成年后多种疾病的发生，包括癌症及代谢相关性疾病。有效应对或防御氧化应激的能力对维持机体健康与生存十分重要，这种能力的潜在程序化会为宫内环境与出生后个体的疾病敏感性建立关联。抗氧化防御系统的关键基因发生了DNA甲基化或组蛋白修饰等表观遗传改变。特别关注了抗氧化防御系统的核心因子Nrf2在外界环境因素影响或刺激下可能发生的表观遗传调控。组蛋白的乙酰化作用将会增强Nrf2与DNA的结合。此外，Micro-RNA己被证明参与调控Nrf2，包括miR-144,miR-28,miR-200与miR-34。这些研究将有助于更好地理解发育编程中的表观遗传调控机制，并为治疗表观遗传相关性疾病的防治提供有效的新策略。

摘要： 本文阐述了DNA甲基化与心血管疾病之间的关系，分析了心血管疾病的组蛋白修饰。且研究证实miRNAs在心血管疾病、心肌梗死、心力衰竭和卒中过程中的重要作用。同时，心血管疾病包括冠心病、高血压、心力衰竭和卒中，它们是西方国家人们发病和致死最主要的原因。这些疾病复杂的发病机制归因于大量的遗传和环境因素相互作用，其中表观遗传机制是一项很重要的方面。DNA甲基化是哺乳动物DNA主要的表观遗传特征，全基因组和特异基因的DNA甲基化揭示了多种基因调节和蛋白功能调控的方式。

摘要： 植物花的发育依赖于花分生组织(floral meristem,FM)活性的维持与分化.当FM完成各轮花器官原基的起始后,其活性会程序性地终止(termination),这个过程就是FM的终止发育过程(FM determinacy).FM的终止发育是一个复杂精细且多步骤的调控过程.WUSCHEL(WUS)是一个具有同源异型结构域(homeodomain)转录因子,其对FM的活性维持及终止发育发挥着重要作用.越来越多的研究表明许多转录因子以及环境信号、激素信号和表观遗传相关因子通过对WUS及其调节基因的调控来影响FM终止发育过程.本研究组首次在组织水平阐明了生长素和细胞分裂素调控FM活性的分子机制:AUXIN RESPONSE FACTOR3(ARF3)能够整合AG、APETALA2(AP2)和生长素(auxin)的信号通过抑制细胞分裂素(cytokinin)信号系统调控FM终止发育;还首次证实光信号对FM活性调控的分子机制:FAR-RED ELONGATED HYP0C0TYL3(FHY3)通过PHYTOCHROME A(PHY4)信号途径介导光信号对WUS表达的调控:在基因水平上首次揭示了染色质构象变化对FM终止发育的调控作用:AGAMOUS(AG)可以直接结合到WUS的调控区并招募PcG蛋白对WUS5'-TSS和WUS3'-CRE的结合,以介导WUS染色质环状结构(chromatin loop)的形成,进而抑制WUS的转录,而DNA TOPOISOMERASE1TOP1α(TOP1α)对染色质的高级结构的重塑作用也是该染色质环形成的基础.随着3D基因组(three dimensional genomics)时代的到来为进一步理解FM终止发育机制提供了新的窗口,而FM终止发育机制在农业生产上的运用也体现了其巨大的应用价值.本文首先简述了拟南芥(Arabidopsis thaliana)花发育研究的发展史,介绍了花发育相关领域所关心的3个科学问题,并着重阐述了FM终止发育调控的研究进展与前景.

摘要： 早在1986年,Barker首次提出,成年后心脑血管疾病的发生源于胎儿期宫内发育不良.近30年来,国内外学者开展了大量有关孕期不良环境、胎儿出生体重与成年慢性疾病(如代谢综合征、神经精神性疾病、肿瘤等)之间的相关性研究.目前认为,许多成人慢性病是在多基因遗传易感性的基础上,由不良生活方式等环境因素所诱发;并提出提出人类疾病起源的新概念——"健康与疾病的发育起源"(Developmental Origins of Health and Disease,DOHaD).研究表明,除遗传因素外,母体身体状况(如母体疾病、营养状况和子宫功能等)和所暴露的外源环境因素(如环境毒物、药物、不良饮食等)皆是宫内发育不良及出生后慢性疾病易感的诱因.在正常的胚胎发育过程中，DNA甲基化和组蛋白修饰在胚胎发育中扮演着重要的角色，异常的DNA甲基化和组蛋白修饰模式会导致胚胎发育障碍。

摘要： 利用显微操作技术进行的动物体细胞核移植方法不仅是研究胚胎重编程机理、转基因工程的常规手段之一,也是地方物种保护,培育新系家畜提供了重要的实验技术平台.现在世界范围内普遍存在核移植效率低下等问题,为了优化并建立适合广西德宝黑猪体细胞核移植体系,本研究探讨了不同的融合和电激活的参数,化学激活药剂,融合激活方案,供体等因素对核移植效率的影响,并探讨了重构胚培养中添加适宜浓度和处理时间的抗氧化剂VitaminC对重构胚发育以及其表观遗传的影响,从而能提供一种提高体细胞核移植效率的方法.

摘要： 动物细胞内DNA去甲基化发生的分子机制一直不清楚.我们的研究发现Tet双加氧酶可以氧化DNA中的5-甲基胞嘧啶,生成5-羧基胞嘧啶,而后者能被TDG糖苷酶识别并切除,从而勾画出一条DNA主动去甲基化的分子通路;进一步的研究工作表明Tet3负责受精卵雄原核内5mC的氧化,启动父本基因组DNA去甲基化与转录激活;此外,Tet1介导的DNA氧化修饰对小鼠成体神经元的产生和短期记忆起到精细的调控作用;Tet和TDG介导的DNA氧化去甲基化是打破细胞重编程屏障、产生诱导多能性干细胞(iPSC)的关键.这些研究发现加深了人们对于重编程机制及其生物学意义的理解和认识.

摘要： 用于将异源功能性结构域诸如转录激活物RNA引导靶向特定基因组基因座的方法和构建体。本发明涉及用于将基因和表观基因调控蛋白，例如转录及货物，组蛋白修饰酶，DNA甲基化修饰物，RNA引导靶向特定的基因座的方法和构建物。本发明至少部分基于融合蛋白的开发，包括融合到Cas9核酸酶的异源功能性结构域(例如，转录激活结构域)，所述Cas9核酸酶通过突变具有其核酸酶活性失活(也称为“dCas9”)。

摘要： 用于将异源功能性结构域诸如转录激活物RNA引导靶向特定基因组基因座的方法和构建体。本发明涉及用于将基因和表观基因调控蛋白，例如转录及货物，组蛋白修饰酶，DNA甲基化修饰物，RNA引导靶向特定的基因座的方法和构建物。本发明至少部分基于融合蛋白的开发，包括融合到Cas9核酸酶的异源功能性结构域(例如，转录激活结构域)，所述Cas9核酸酶通过突变具有其核酸酶活性失活(也称为“dCas9”)。

摘要： 本公开内容描述了一种患者注册数据系统，其可用于汇总涉及疾病发生、进展和对治疗的反应的临床、分子和免疫参数。本公开内容可允许参与者、研究者和医师基于诸如参与者人口统计数据和免疫系统数据等参数来使数据可视化。

摘要： 用于分析DNA的方法包括通过以下形成经标记的DNA片段：将基因组DNA切割成DNA片段，用包含可水解部分的接头选择性地使DNA中存在的任何未甲基化CpG位点官能化，以及将标记连接至所述接头。所述方法还包括：将经标记的DNA片段与任何未经标记的DNA片段分离，使所分离的经标记DNA片段中接头的可水解部分水解以便从所述标记中释放DNA片段，以及对所释放的DNA片段进行测序。

摘要： 本发明提供了一种使转座因子移动的方法。所述方法包括以下步骤：a)提供DNA甲基化抑制剂和/或转录抑制剂，和b)使所述抑制剂与包含失活的转座因子的细胞接触，从而产生具有移动的转座因子的细胞。在本发明的第二方面，提供了一种增加多个真核细胞生物体中的遗传变异和/或表观遗传变异性的方法。所述方法包括以下步骤：i.提供DNA甲基化抑制剂和/或转录抑制剂，ii.使所述生物体与所述抑制剂接触，和iii.使所述生物体繁殖。

摘要： 本发明涉及生物技术领域，具体是一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法及临床应用。本发明发现，与癌旁组织相比，尽管肝癌组织中存在广泛的遗传和表观遗传变化，但肝癌组织中的肝癌干细胞只存在少量但关键的遗传和表观遗传变化。针对这些肿瘤干细胞中发生的关键的遗传和表观遗传变化的治疗，对癌症的治疗效果可能会更好。本发明为肝癌的治疗提供了新的靶标发现方法。

摘要： 本发明提供了一种使转座因子移动的方法。所述方法包括以下步骤：a)提供DNA甲基化抑制剂和/或转录抑制剂，和b)使所述抑制剂与包含失活的转座因子的细胞接触，从而产生具有移动的转座因子的细胞。在本发明的第二方面，提供了一种增加多个真核细胞生物体中的遗传变异和/或表观遗传变异性的方法。所述方法包括以下步骤：i.提供DNA甲基化抑制剂和/或转录抑制剂，ii.使所述生物体与所述抑制剂接触，和iii.使所述生物体繁殖。

摘要： 本发明属于生物制药领域，涉及着中药野菊花活性成分的应用，具体涉及具有调控表观遗传表达平衡抗肝癌作用的野菊花活性部位及其制备方法和应用。所述野菊花活性部位中总倍半萜含量≥50%，总黄酮含量≥30%；指标成分为豚草素A含量≥4.0%，野菊花内酯含量≥3.0%，芹菜素含量≥0.5%，刺槐素含量≥0.7%。本发明首次从野菊花中提取分离得到一个具有抗肝癌、保肝作用的活性部位（YJH‑B），并首次发现该活性部位作用的分子机制是通过调控DNMTs/TET2平衡关系而实现，显示了中药“祛邪扶正”的治疗癌症的理念，为基于表观遗传靶标抗癌创新药物研究开发提供了新思路、新策略。

摘要： 本发明提出了一种检测苯并[a]芘暴露的表观遗传学标志物，所述表观遗传学标志物包括人第6号染色体中cg02446434位点、cg08681110位点和cg18338863位点中的至少一个。本发明还提供了一种上述检测苯并[a]芘暴露的表观遗传学标志物的筛选方法和应用。本发明cg02446434位点、cg08681110位点和cg18338863位点的甲基化改变发生在疾病的早期，可实现一级预防的目的，且cg02446434位点、cg08681110位点和cg18338863位点均位于基因MARCKS上，可用于肺部疾病的发病机制研究，应用前景好；DNA甲基化分析灵敏度高、稳定性好、成本低。

摘要： 本公开提供了一种基于人工智能的系统，该基于人工智能的系统包括输入准备模块，该输入准备模块访问序列数据库并且生成输入碱基序列。该输入碱基序列包括具有靶向碱基的靶向碱基序列，其中该靶向碱基序列侧接具有下游上下文碱基的右端碱基序列，和具有上游上下文碱基的左端碱基序列。序列对序列模型处理输入碱基序列并且生成输入碱基序列的替代表示。输出模块处理输入碱基序列的该替代表示并且针对靶向碱基序列中的靶向碱基中的每个靶向碱基产生至少一个每碱基输出。该每碱基输出针对对应靶向碱基指定多个表观遗传轨迹的信号水平。