编码蛋白

摘要： 羊口疮(Orf)是由羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)引起的一种接触性传染病,绵羊与山羊是主要宿主。该病属于自限性疾病,当不发生继发性感染时,机体调节就可以控制疾病发展,逐渐恢复痊愈。该特性可能与病毒的基因组结构有关,因此,重点阐述了羊口疮病毒基因组编码的蛋白及其功能。此外,还对羊口疮病毒的流行病学、病原学、临床诊断与防控进行了概述,为羊口疮病毒的进一步研究提供了信息与参考。

摘要： 鸭圆环病毒病是一种重要的免疫抑制性疾病,可引起鸭各免疫器官损伤及淋巴细胞严重减少,大大增加了病原菌混合感染的概率,给养鸭业带来严重的经济损失。鸭圆环病毒基因组为单股环状DNA,主要编码3种蛋白,分别为Rep蛋白、Cap蛋白及与细胞凋亡有关的ORF3蛋白。研究病毒编码蛋白的功能对于病毒致病机制研究及相关疫苗的研制具有重要作用。本文就鸭圆环病毒目前已知编码的蛋白功能进行详细地叙述,以期为鸭圆环病毒病的致病机制研究及防控提供参考。

摘要： 非编码RNA(Non-coding RNA,ncRNA)是一类无编码蛋白功能的内源性RNA转录物。根据核苷酸的大小,ncRNA通常可分为小非编码RNA(200nt),其中80%为LncRNA[1]。在过去,LncRNA被认为是转录“噪音”而并无作用。近年来,随着研究的不断深入,LncRNA因其在结构、序列及生物学功能上有高度异质性,通过参与表观遗传调控、转录调控及转录后调控等途径,多水平地调节基因表达,参与包括细胞增殖、分化及迁移在内的多个生物学过程[2,3]。

摘要： 先天性白内障是造成儿童视力下降甚至致盲的常见疾病之一,其致病因素多样,其中遗传因素占1/3左右且多数源于基因突变。该病的遗传方式分为常染色体显性遗传(AD)、常染色体隐性遗传(AR)和性染色体连锁遗传,有较大的遗传与表型异质性。基于现代科学技术的不断发展和学者们对先天性白内障的研究,本文主要对遗传性先天性白内障致病基因的研究进展进行综述。

摘要： 非洲猪瘟(Africanswinefever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(Africanswinefevervirus,ASFV)引起的一种急性动物传染病,且有高度接触传染性、急性和出血性等特征,病情传播不受时间和种类的限制,其病死率高达100％.目前针对非洲猪瘟还未研究出有效的治疗方法及疫苗防控,对我国养猪业造成巨大破坏,影响经济效益.非洲猪瘟病毒是非洲猪瘟病毒科非洲猪瘟病毒属的唯一种类,是已知存在的首个虫媒病毒.非洲猪瘟病毒粒子为260～330nm,是具有囊膜结构的二十面体双链线性DNA大分子病毒,基因组长度为170～193kb,包含有150～167个开放阅读框,猪瘟病毒能够编码68种结构蛋白和100多种非结构蛋白.其中已知功能的病毒编码蛋白约有50个,仍有一半以上的ASFV编码蛋白功能尚未探究清楚.非洲猪瘟病毒主要寄宿于家猪和野猪体内,主要在巨噬细胞胞质中进行复制,能够调控IFN产生、炎症反应、细胞调亡、自噬及宿主蛋白合成等生物学过程,影响宿主细胞正常的生长周期及细胞分泌物的生成,进一步抑制宿主细胞体内的天然免疫应答系统.综述非洲猪瘟病毒编码蛋白种类及致病机理研究现状,为非洲猪瘟病毒结构研究及防治方法提供参考.

摘要： 2019年凸隆病毒独立于冠状病毒科,成为新的托巴套氏病毒科凸隆病毒亚科成员.多种动物及人类的腹泻和肠道疾病都可能与凸隆病毒有关,但由于该病毒培养困难导致对其研究相对不足.目前与凸隆病毒相似的冠状病毒已经给人类带来了巨大的灾难并造成了严重的损失,因此有必要加强对凸隆病毒的深入研究.论文对凸隆病毒的病原学、蛋白功能和检测技术等方面的研究进展进行阐述,以期为凸隆病毒的研究提供理论依据和研究思路.

摘要： 伪狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)属于甲型疱疹病毒亚科水痘病毒属,其基因组约为150 kb,可分为独特长区、内部重复序列、独特短区以及末端重复序列。PRV US3基因位于其基因组的独特短区,属于复制非必须基因,是病毒的重要毒力基因,编码产物是丝/苏氨酸激酶。US3基因编码蛋白是一种多功能蛋白,可参与PRV逃避宿主免疫清除,抑制病毒介导的细胞凋亡,影响病毒粒子在细胞核质中的运输,调动感染细胞肌动蛋白骨架重排,诱导宿主细胞形态改变进而增强PRV在细胞中的传播能力,在病毒生命周期的多个阶段发挥作用。本文综述了PRV US3编码蛋白功能的研究进展,为PRV致病机制的研究提供了参考。

摘要： 环形RNA是一类广泛存在于真核细胞中的内源性RNA分子,没有5'末端帽子和3'末端polyA尾巴,以共价键连接形成封闭环状结构.一直以来,环形RNA被认为是一类不能翻译的非编码RNA.然而近年来有研究报道,环形RNA能够编码蛋白质从而调控重要的生命活动,引起了研究者们的注意.运用机器学习的方法,基于环形RNA的序列与结构特征,使用XGBoost、随机森林和支持向量机组合而成的综合分类模型,预测环形RNA编码蛋白的潜能,平均预测准确率达到86.66％,为实验研究人员提供可靠的参考,有助于发现更多可编码蛋白的环形RNA.

摘要： 牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)是引起反刍动物呼吸道疾病的主要病毒之一,犊牛对该病毒的感染率 、发病率和病死率均较高,严重危害养殖的经济效益.牛呼吸道合胞体病毒主要编码蛋白F蛋白和G蛋白上的某些抗原表位可刺激中和抗体反应,而且是BRSV唯一能够在动物模型中诱导中和抗体并产生保护性免疫应答的蛋白.N蛋白具有高度保守性,可诱导BRSV的保护性免疫,小疏水性蛋白(SH)有助于维持病毒外壳稳定性.目前,在该病的防控措施上仍然存在未解决的问题,可根据BRSV编码蛋白的不同特性与功能,研发出一种免疫效果良好 、安全高效的疫苗,用以防控BRSV的感染.

摘要： 疱疹病毒是一类具有相同形态学且有较大囊膜的双链DNA病毒。疱疹病毒的囊膜是位于病毒颗粒最外层的包被物，表面有放射状排列的纤突，其长度约8.10nm。囊膜由多种蛋白质构成，其中大部分蛋白质被糖基化后修饰成糖蛋白。囊膜蛋白在病毒的吸附与穿入过程中起重要作用。本文就UL45基因及其编码蛋白功能等方面的研究进展进行总结，以期为疱疹病毒UL45基因的进一步研究提供参考。

摘要： PPV VP2基因是衣壳蛋白的主要编码基因,其编码蛋白能自主装配成类病毒粒子并能诱导免疫应答.本文主要介绍PPV VP2基因的复制、转录和翻译,以及VP2基因及其编码蛋白的功能和应用.

摘要： 本文在获得BSV-GD基因组全序列的基础上，将BSV-GD基因组的ORF1,ORF2和ORF3的运动蛋白(MP)、衣壳蛋白(CP),PR,RT/RH功能域序列分别构建至诱饵载体pGBKT7和猎物载体pGADT7上，分别转化啤酒酵母菌AH109，确定无蛋白毒性和自檄活活性后，将重组诱饵质粒和重组猎物质粒两两组合共转化酵母菌AH109，在营养缺陷型二缺(Leu/Trp)SD培养基上筛选阳性克隆，将阳性克隆在营养缺陷型三缺(Leu/Trp/Ade)和四缺(Leu/Trp/Ade/His)SD培养基上培养，根据是否长出菌落判断香蕉线条病毒两基因编码蛋白是否发生互作。

摘要： 为深入研究太行黑山羊ASIP基因及其编码蛋白的结构和功能,特别是在毛色形成过程中的作用机制,本研究运用RT-PCR方法从太行黑山羊皮肤组织中该基因的cDNA序列,并运用生物信息学方法分析了该基因编码蛋白的理化性质和结构特点.结果表明,太行黑山羊ASIP基因与其他12个物种该基因存在较高的同源性,说明其在进化上是相对保守的.ASIP基因CDS区长402 bp,编码113个氨基酸,其编码蛋白是一种不稳定的亲水性蛋白,具有8个潜在的糖基化位点和5个潜在的磷酸化位点,未检测到跨膜域结构.这些结果为进一步研究该基因及其编码蛋白的结构及其在毛色形成中的调控机理奠定了基础.

摘要： 脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus，EMCV)可引起的猪、某些哺乳动物乃至灵长类动物以脑炎、心肌炎或心肌周围炎。本研究以脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus,EMCV) HB10株VP2基因为目的基因,建立EMCV快速诊断方法;并对VP2基因进行克隆、测序并用生物信息学技术分析EMCV-HB10-VP2蛋白的糖基化位点、磷酸化位点、信号肽、B细胞抗原表位及其二、三级结构.结果表明,成功克隆了EMCV-HB10-VP2基因;构建重组质粒pEGFP-HB10-VP2,并以此质粒作为阳性模板建立了特异性好、灵敏性高的EMCV快速诊断方法;生物信息学分析表明,EMCV-HB10-VP2蛋白可能存在4个糖基化位点;对磷酸化位点预测:丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸分别有:6个、7个、3个位点可能存在磷酸化;可能存在6个B细胞抗原表位;对EMCV-HB10-VP2蛋白二级结构进行预测,α-螺旋占12.50％,β-折叠区域占27.34％,无规则卷曲占60.16％;三级结构存在多个螺旋和折叠区域,主要以无规则卷曲为主.本研究结果为EMCV临床样本的快速筛检提供技术支持,同时EMCV-HB10-VP2蛋白的生物信息学分析为EMCV分子诊断试剂及基因工程疫苗研究等提供参考.

摘要： 本实验设计一对特异性引物,从卢氏鸡淋巴细胞中扩增IL-21全基因并测序,详细分析该基因及其编码蛋白的各级结构。结果表明,成功克隆具有中国地方特色的卢氏鸡IL-21基因,该基因全长438bp,编码145个氨基酸,包括19个氨基酸的信号肽,基因位于4号染色体55218K至55224K之间;编码蛋白质分子量约16.67KD,为碱性蛋白,具有亲水性,无二硫键;三维结构预测表明,卢氏鸡IL-21蛋白主要由四个α螺旋和不规则卷曲构成,与人IL-21蛋白三维结构相似;同源性分析表明,该序列与其他动物IL-21的氨基酸同源性低于35％。

摘要： 开展麦蚜的嗅觉信号途径研究，探明麦蚜对报警信息素的反应、寄主植物识别、植物趋避等嗅觉行为的分子机理，具有重要的理论和实际意义。本研究通过RACE技术，以室内饲养的麦长管蚜有翅成蚜cDNA为模板，克隆出目的基因，命名为saaor。预期先通过Northern-blot，检测saaor在蚜虫中组织定位，判断其是否在触角中专性表达；然后通过跨膜蛋白体外可溶性表达，制备抗体进一步检测互作蛋白，对不同化合物与目的蛋白的结合检测实验，以及RNAi技术等方法，进而明确saaor编码蛋白在麦长管蚜对气味物质的嗅觉识别过程中作用，探明该蛋白的功能。

摘要： 本实验设计一对特异性引物，从卢氏鸡淋巴细胞中扩增IL-21全基因并测序，详细分析该基因及其编码蛋白的各级结构。结果表明，成功克隆具有中国地方特色的卢氏鸡IL-21基因，该基因全长438bp，编码145个氨基酸，包括19个氨基酸的信号肽，基因位于4号染色体55218K至55224K之间;编码蛋白质分子量约16.67KD，为碱性蛋白，具有亲水性，无二硫键;三维结构预测表明，卢氏鸡IL-21蛋白主要由四个α螺旋和不规则卷曲构成，与人IL-21蛋白三维结构相似;同源性分析表明，该序列与其他动物IL-21的氨基酸同源性低于35％。

摘要： 真菌为了生存,进化了一系列机制来感应和适应生境的变化.有关裂殖酵母、白色念珠菌、构巢曲霉等真菌感应和适应环境pH变化的机制,已得到了广泛和深入的研究,但稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)感应和适应环境pH变化的机制及其与致病性的关系没有报道.在前期研究中,本实验室以稻瘟菌P131菌株为受体,构建了含有近7万个独立转化体的ATMT突变体库.作者通过筛选该库获得了9个菌落颜色和大小相似、产孢量减少、且对碱性pH值敏感一致的菌丝生长缓慢突变体.提出了一个有关稻瘟菌PacC-pH信号途径及其对菌丝生长、分生孢子产生和致病性调控机理的模型。

摘要： 真菌为了生存,进化了一系列机制来感应和适应生境的变化.有关裂殖酵母、白色念珠菌、构巢曲霉等真菌感应和适应环境pH变化的机制,已得到了广泛和深入的研究,但稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)感应和适应环境pH变化的机制及其与致病性的关系没有报道.在前期研究中,本实验室以稻瘟菌P131菌株为受体,构建了含有近7万个独立转化体的ATMT突变体库.作者通过筛选该库获得了9个菌落颜色和大小相似、产孢量减少、且对碱性pH值敏感一致的菌丝生长缓慢突变体.提出了一个有关稻瘟菌PacC-pH信号途径及其对菌丝生长、分生孢子产生和致病性调控机理的模型。

摘要： 本发明涉及一种核酸序列，所述核酸序列包含或编码：编码区，所述编码区编码至少一种包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物的肽或蛋白，至少一个组蛋白茎环和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号。此外，本发明提供所述核酸用于增加所编码的肽或蛋白的表达(特别是用于基因治疗)的应用。本发明还公开了其用于制备药物组合物的应用，所述药物组合物例如，用于基因治疗，特别是用于治疗需要使用治疗性肽或蛋白(优选如本文定义)的疾病。本发明还描述了利用包含或编码组蛋白茎环和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号的核酸增加包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物的肽或蛋白的表达的方法。

摘要： 本发明涉及植物基因工程领域，公开了一种水稻铁氧还蛋白编码基因OsFd1、该基因编码的蛋白质及其用途，该基因的核苷酸序列如Seq ID No：1、Seq ID No：2所示；其编码的蛋白质的氨基酸序列如Seq ID No：3所示。上述基因编码的蛋白能够从PSI处接受电子并将电子传递给FNR、亚硝酸还原酶和亚硫酸还原酶，参与水稻碳、氮、硫的同化。本发明可用于调节水稻光合电子传递效率，促进碳水化合物、氮，硫等大量元素的固定和同化及光合产物积累等。

摘要： 本发明涉及一种核酸序列，所述核酸序列包含或编码：编码区，所述编码区编码至少一种包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物的肽或蛋白，至少一个组蛋白茎环和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号。此外，本发明提供所述核酸用于增加所编码的肽或蛋白的表达(特别是用于基因治疗)的应用。本发明还公开了其用于制备药物组合物的应用，所述药物组合物例如，用于基因治疗，特别是用于治疗需要使用治疗性肽或蛋白(优选如本文定义)的疾病。本发明还描述了利用包含或编码组蛋白茎环和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号的核酸增加包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物的肽或蛋白的表达的方法。

摘要： 本发明涉及用于预防性和/或治疗性治疗哺乳动物的甲型流感病毒诱发的疾病的多核苷酸，其中所述多核苷酸包含编码具有TRAF2和/或TRAF6结合结构域的Mx蛋白的基因。本发明还提供了转基因动物，其具有减弱的对甲型流感病毒的易感性，表达编码Mx蛋白的基因，所述Mx蛋白具有TRAF2和/或TRAF6结合结构域；条件是所述动物不属于灵长目、牛科(牛属、印度水牛、Ovis)、鳍脚目或啮齿目的分类组。

摘要： 本发明涉及植物基因工程领域，公开了一种水稻铁氧还蛋白编码基因OsFd1、该基因编码的蛋白质及其用途，该基因的核苷酸序列如Seq ID No：1、Seq ID No：2所示；其编码的蛋白质的氨基酸序列如Seq ID No：3所示。上述基因编码的蛋白能够从PSI处接受电子并将电子传递给FNR、亚硝酸还原酶和亚硫酸还原酶，参与水稻碳、氮、硫的同化。本发明可用于调节水稻光合电子传递效率，促进碳水化合物、氮，硫等大量元素的固定和同化及光合产物积累等。

摘要： 本发明涉及一种核酸序列，所述核酸序列包含或编码：编码区，所述编码区编码至少一种包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物的肽或蛋白，至少一个组蛋白茎环和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号。此外，本发明提供所述核酸用于增加所编码的肽或蛋白的表达(特别是用于基因治疗)的应用。本发明还公开了其用于制备药物组合物的应用，所述药物组合物例如，用于基因治疗，特别是用于治疗需要使用治疗性肽或蛋白(优选如本文定义)的疾病。本发明还描述了利用包含或编码组蛋白茎环和聚腺苷酸序列或聚腺苷酸化信号的核酸增加包含治疗性蛋白或其片段、变体或衍生物的肽或蛋白的表达的方法。

摘要： 本发明公开了一种编码木糖转运蛋白的核酸分子及其编码的木糖转运蛋白，以及表达该木糖专一性转运蛋白的宿主细胞。实验证明本发明提供的木糖转运蛋白对木糖的运输能力和酿酒酵母高效內源转运蛋白Gal2p的水平相当。该蛋白专一性的向酿酒酵母中运输木糖而不运输葡萄糖，并且其对木糖的运输不受葡萄糖的抑制。提示表达该转运蛋白将有利于在葡萄糖木糖共发酵时提高木糖运输的能力，为木糖转运蛋白在酶工程、基因工程、代谢工程以及合成生物学技术领域的应用开拓了空间。

摘要： 本发明首次公开了核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示的稻纵卷叶螟钙粘蛋白Cry毒素结合区编码基因，以及其氨基酸序列如SEQ ID NO.15所示的编码蛋白，该稻纵卷叶螟钙粘蛋白的毒素结合区CmCad‑CR6‑MPED与Cry1Ac毒素具有结合作用,可以应用于预测稻纵卷叶螟Cry毒素抗性，若待测稻纵卷叶螟的钙粘蛋白Cry毒素结合区基因核苷酸序列与SEQ ID NO.14不同，则说明该稻纵卷叶螟受体发生基因突变，结合能力降低，昆虫对Cry毒素产生了一定抗性；该编码蛋白还可以用于筛选针对稻纵卷叶螟的Bt蛋白，若待筛选的Bt蛋白与编码具有高度亲和力,则必然会插入入稻纵卷叶螟中肠BBMV上,使上皮细胞膜破裂，可以快速筛选或改造对稻纵卷叶螟具有高毒力的Bt毒素杀虫蛋白。

摘要： 本申请描述了编码核酸序列以及其用于使所编码蛋白的表达增加的用途，所述核酸序列具体地是信使RNA(mRNA)，其包含或编码组蛋白茎-环和多聚腺甘酸序列或多聚腺苷酸化信号。还公开了其用于制备药物组合物(特别是疫苗)或在基因治疗中的用途，所述药物组合物例如用于治疗肿瘤和癌症疾病、心血管疾病、传染性疾病、自身免疫性疾病或遗传性疾病。本发明进一步描述了体外转录方法、利用包含或编码组蛋白茎-环和多聚腺甘酸序列或多聚腺苷酸化信号的核酸使蛋白表达增加的体外方法以及离体和体内方法。

摘要： 本发明首次公开了核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示的稻纵卷叶螟钙粘蛋白Cry毒素结合区编码基因，以及其氨基酸序列如SEQ ID NO.15所示的编码蛋白，该稻纵卷叶螟钙粘蛋白的毒素结合区CmCad‑CR6‑MPED与Cry1Ac毒素具有结合作用,可以应用于预测稻纵卷叶螟Cry毒素抗性，若待测稻纵卷叶螟的钙粘蛋白Cry毒素结合区基因核苷酸序列与SEQ ID NO.14不同，则说明该稻纵卷叶螟受体发生基因突变，结合能力降低，昆虫对Cry毒素产生了一定抗性；该编码蛋白还可以用于筛选针对稻纵卷叶螟的Bt蛋白，若待筛选的Bt蛋白与编码具有高度亲和力,则必然会插入入稻纵卷叶螟中肠BBMV上,使上皮细胞膜破裂，可以快速筛选或改造对稻纵卷叶螟具有高毒力的Bt毒素杀虫蛋白。