结肠腺癌

摘要： 目的:基于生物信息学挖掘阐明ERBB3在结肠腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine、TCGA、String-DB数据库等基因数据库,分析ERBB3在正常组织与结肠腺癌的表达差异,用R-sdutio进行患者生存及复发分析,并对与ERBB3相关的分子进行分析和预测。结果:(1)对ERBB3在结肠腺癌中365项研究数据进行差异性分析发现,ERBB3在结肠腺癌中表达明显增高;(2)在结肠腺癌中ERBB3 mRNA上调比ERBB3 mRNA下调多;(3)ERBB3mRNA表达与DNA拷贝数改变状态呈显著正相关;(4)在ERBB3高表达组较低表达组结肠腺癌复发率高。结论:ERBB3可能成为结肠腺癌的诊断及减少复发的新靶点,对其分子机制的研究具有重要意义。

摘要： 目的发掘结肠腺癌(colon adenocarcinoma,COAD)免疫预后标志物并精准预测COAD生存风险。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载COAD患者的临床信息以及RNA-seq数据,获取差异的免疫相关基因(differential immune related gene,DEIRG)。利用单变量和多变量Cox比例风险回归模型鉴定具有预后价值的免疫基因构建模型。利用Kaplan-Meier法分析模型中高风险和低风险患者的生存状态,并使用受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估该风险评分模型的准确度,并且从样本中随机抽取70%的病例作内部验证。采用单因素和多因素Cox回归分析,确定COAD的独立预后因素。结果利用单因素和多因素Cox比例风险回归分析确定载脂蛋白12(lipocalin 12,LCN12)、嗜铬素A(chromogranin A,CHGA)、抑制素β亚基(inhibin subunit beta B,INHBB)、R3H域包含像(R3H domain containing like,R3HDML)和黑皮质素1受体(melanocortin 1 receptor,MC1R)为COAD患者预后风险模型中的5个风险基因(均P<0.05),对该模型进行风险评分,高风险组患者总生存时间较低风险组短(P=0.007),在随机抽取的内部测试组中得到验证,高风险组患者预后较低风险组差(P=0.028)。风险评分预测1年和3年总生存的ROC曲线下面积(area under curve,AUC)为0.715和0.683,内部验证组ROC AUC分别为0.736和0.673。单因素和多因素Cox分析显示,在实验组及内部验证组中风险评分是COAD的独立预后因素(P<0.01)。结论开发并验证的COAD免疫预后基因LCN12、CHGA、INHBB、R3HDML和MC1R可提高COAD筛查及诊断效率,并对鉴定高或低生存风险的COAD患者亚组的治疗具有意义。

摘要： 目的构建和验证能量代谢相关信使RNA(mRNA)-长链非编码RNA(LncRNA)在结肠腺癌(COAD)患者中的预后预测模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)中下载TCGA-COAD项目中COAD转录本数据与临床病理信息,转录本数据用于筛选差异表达的mRNA(DEGs)与差异表达的LncRNA(DELs)。从MSigDB数据库中收集能量代谢相关基因,与DEGs取交集得到能量代谢相关DEGs,再将其与DELs进行共表达分析得到能量代谢相关DEGs、DELs。将得到的能量代谢相关DEGs与DELs纳入Cox回归模型中,筛选并建立COAD患者的预后预测模型。根据预测模型结果建立风险得分,将其分为高风险组与低风险组,然后利用Kaplan-Meier曲线、受试者工作特征曲线(ROC)、Cox回归分析对风险得分进行评估。结果共表达分析得到125个能量代谢相关DEGs和451个能量代谢相关DELs。Cox回归结果显示1个mRNA(LRP2)与5个LncRNA(分别为CTC-428G20.6、LINC02257、PRR7-AS1、RP11-29G8.3、RP11-677M14.3)与COAD患者预后独立相关。Kaplan-Meier分析显示高风险组与低风险组的中位数生存期分别是5.066年和8.334年(P<0.05);1、3、5年生存的患者风险得分的ROC曲线下面积分别是0.767、0.694和0.691;多因素Cox回归显示高风险组生存时间明显短于低风险组(HR=3.78,95%CI:2.29~6.22,P<0.05)。结论研究成功构建COAD能量代谢相关mRNA-LncRNA预后预测模型,该模型具有较好的预测性能。

摘要： 目的:探究过表达硫氧还蛋白相互作用蛋白(thioredoxin interacting protein,TXNIP)对结肠腺癌细胞凋亡的影响及其机制。方法:收集我院30例结肠腺癌患者的结肠腺癌组织及癌旁组织,实时荧光定量PCR检测组织中TXNIP mRNA表达,免疫组织化学染色检测组织中自噬标志蛋白LC3-Ⅱ与凋亡标志蛋白Cleaved Caspase-3表达;将人结肠腺癌LoVo细胞随机分为对照组、阴性空载体组(LV-GFP)和TXNIP过表达组(LV-GFP-TXNIP),倒置荧光显微镜下观察细胞转染效率,收集转染72 h后的LoVo细胞,通过流式细胞术检测细胞凋亡,透射电子显微镜观察细胞自噬情况,免疫荧光染色检测细胞中LC3表达,Western blot检测细胞中自噬相关蛋白与凋亡相关蛋白表达变化。结果:与癌旁组织比较,结肠腺癌组织中TXNIP mRNA相对表达量显著降低(P<0.01),LC3-Ⅱ阳性表达率显著升高(P<0.05),Cleaved Caspase-3阳性表达率显著降低(P<0.05);慢病毒转染72 h后转染效率较高(P<0.05);与对照组比较,LV-GFP-TXNIP组LoVo细胞的凋亡率显著增加(P<0.05),细胞质较为致密,自噬体数目明显减少,LC3荧光染色减弱,Beclin-1、LC3-Ⅱ蛋白表达显著下降(P<0.05),而LC3-I、p62蛋白表达显著增加(P<0.05),同时,Bax、Cleaved Caspase-3蛋白表达显著增加(P<0.05),Bcl-2蛋白表达显著下降(P<0.05)。结论:在结肠腺癌细胞中过表达TXNIP可通过抑制自噬来促进细胞凋亡。

摘要： 目的:利用生物信息学工具在结肠腺癌中(COAD)构建预后相关竞争内源性RNA(ceRNA)网络并进行综合分析。方法:从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载COAD的RNA测序(RNA-seq)数据和miRNA测序(miRNA-seq)数据及相应的患者临床信息,筛选差异表达的mRNAs(DEmRNAs)、lncRNAs(DElncRNAs)和miRNAs(DEmiRNAs)。对所有DEmRNAs进行功能和通路富集分析,以及蛋白互作网络(PPI)分析。根据这些差异RNAs之间的调控关系构建了COAD的ceRNA网络。用Kaplan-Meier曲线评估差异RNAs对COAD患者总生存率(OS)的影响,结合患者相关的临床信息分析差异基因的表达模式与其他临床特征之间的相关性。用c-bioportal和TIMER数据库分析DElncRNAs与免疫相关分子及浸润细胞的关系。结果:我们构建的ceRNA网络中有5个DElncRNAs(C2orf48、HOTAIR、KCNQ1OT1、LINC00355和MIR31HG)、2个DEmiRNAs(miR-145和miR-152)和6个DEmRNAs(FAM46C、FJX1、MACC1、SLC16A9、TPM2和ULBP2)与患者的OS显著相关。此外,预后相关lncRNAs中有4个被证实还与其它某些临床特征相关,KCNQ1OT1、MIR31HG和PD-L1表达之间也存在显著相关性。结论:本研究在COAD中构建了一个新的ceRNA调节网络,并确定了C2orf48、HOTAIR、KCNQ1OT1、LINC00355和MIR31HG可作为COAD潜在标志预后、靶向治疗以及免疫治疗反应的生物标志物。

摘要： 1病例资料患者,女性,51岁,2021年4月2日因“发现头部皮下包块3月余”至南京大学医学院附属鼓楼医院普外科门诊就诊。患者2020年12月24日因“左下腹隐痛3月余、加重20 d”至南京大学医学院附属鼓楼医院查肠镜,病理示:降结肠腺癌,中分化(图1a)。

摘要： 结肠腺癌(COAD)是迄今为止最常见的结肠癌组织学类型,是全球范围内导致死亡的主要原因之一,早期诊断、治疗及预防复发在临床中意义重大。充当竞争性内源性RNA(ceRNA)的长链非编码RNA(lncRNA)在结肠癌的发展中发挥重要作用,通过分析与lncRNA相关的ceRNA网络中COAD诊断、预后及复发相关的潜在生物标志物,可为lncRNA在COAD中的功能研究提供新的思路,为临床上COAD的诊断及治疗提供很大的帮助。本文就lncRNA相关的ceRNA网络中COAD潜在生物标志物的研究进展进行综述。

摘要： 目的构建一个基于Notch通路相关基因的结肠腺癌预后模型并通过列线图绘制进行验证。方法下载TCGA结肠腺癌患者的mRNA表达量和临床病理资料。GSEA(gene set enrichment analysis)分析Notch信号通路相关基因集,筛选癌与癌旁组织中差异表达的基因。单因素与多因素Cox比例回归模型进行预后相关mRNAs的筛选,并构建基于mRNAs表达谱的预后模型和列线图,通过生存分析C-index、ROC曲线和校准曲线评估其预测价值。从GEO数据库中下载验证队列GSE29621,对预后模型预测患者预后的有效性进行验证。使用在线网站人类蛋白图谱(HPA)对预后模型内基因进行蛋白表达情况验证。结果从TCGA中下载444例结肠腺癌患者mRNA表达数据和临床病理资料,排除临床资料不全的患者信息,最终纳入385例患者的信息作为研究对象。从GSEA中3个Notch信号通路基因集中获取Notch相关基因,并与TCGA表达数据结合,得到Notch相关基因的表达量,最后进行Notch相关基因的差异基因的筛选。使用GSEA在结肠腺癌mRNAs表达谱中筛选出391个Notch信号通路相关差异表达基因(P<0.05)。利用单变量Cox回归分析筛选出14个结肠腺癌预后相关Notch通路基因,进一步多变量Cox回归分析构建出5种mRNAs(CDHR2,KRT8P12,NEURL1B,SELE,FSTL3)组成的预后模型。ROC曲线和生存分析显示,高Notch通路相关基因风险评分与较差的生存结果显著相关(AUC=0.748,P<0.05)。Notch通路相关的基因评分被证明是一个独立的预后因素。构建了具有临床病理特征和Notch通路相关基因评分的列线图,进一步预测结肠腺癌患者的预后,在C-index、ROC曲线和校准曲线上也表现良好(C-index=0.794,AUC=0.969)。结论构建的包含5个Notch信号通路相关基因的结肠腺癌预后模型具有良好的预后预测效果,有望作为评估结肠腺癌患者预后的指标。

摘要： 1 病例资料患者,女,56岁,初始因腹胀伴恶心呕吐、反酸、乏力,于2018年11月15日在当地县人民医院行肠镜检查提示:升结肠近肝曲可见该部肠腔四壁高低不平菜花样新生物,质硬脆,触之易出血,取病理示结肠腺癌。CT检查示多发肝转移,临床分期:cTNMⅣ期。既往史:2019年行左侧乳腺癌根治术,具体病理类型不详,术后行4个周期辅助化疗。治疗方案:2018年12月于南阳医学高等专科学校第一附属医院行mFOLFOX6方案化疗3个周期。

摘要： 目的 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠腺癌(COAD)转录组数据进行分析,区别KDM5c高低表达组结肠癌预后区别及两组差异基因分析探索可能影响预后的机制。方法 从TCGA数据库中下载COAD的转录组数据,以KDM5c mRNA水平中位数界,分为KDM5c高低表达组,进行生产分析,利用R语言edge R包筛选出差异基因后,对差异基因进行GESA分析及RNA m6A相关蛋白分析。结果 与癌旁组织相比,KDM5c高表达于结肠腺癌组织中,且Logistics回归分析发现KDM5c高表达结肠腺癌好发与KDM5c在多结肠腺瘤转化所致结肠癌、女性肠癌、腺癌类型肠癌以及右半结肠癌,KDM5c影响结肠癌5年生存率。同时KDM5c差异表达基因上调多种促癌基因,且KDM5c差异表达影响11种RNA m6A蛋白表达,其中可能通过影响METTL14基因CpG岛甲基化下调其表达。结论 KDM5c可能通过影响RNA m6A相关蛋白表达影响结肠腺癌预后。

摘要： 目的：研究温郁金醚提物中二萜类化合物C体外对人结肠腺癌SW620细胞的抑制作用及其与MAPK信号通路间的关系。rn 方法：以含10％胎牛血清的Leibovitz’s L-15为培养基，置37°C、体积分数为5％的CO2培养箱中培养SW620细胞；将温郁金醚提物中二萜类化合物C溶于二甲基亚砜(Dimethyl sulfoxide，DMSO)，配成10mg/mL母液；以5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil，5-FU)和奥沙利铂(Oxaliplatin，L-OHP)为阳性对照药物，采用噻唑蓝(MTT)还原法检测三种药物在10～70μg/mL浓度时对SW620细胞增殖的影响；用倒置相差显微镜观察化合物C在0，40，55，70μg/mL浓度、48h时对SW620细胞的作用效果；用流式细胞仪检测化合物C在0，40，55，70μg/mL浓度对SW620细胞周期分布的影响及其凋亡率；用Western blot法检测化合物C在0，40，55，70μg/mL浓度、48h时对SW620细胞中ERK、p-ERK、JNK、p-JNK、p38、p-p38表达的影响。rn 结果：MTT法显示化合物C能以时间-浓度依赖性方式抑制SW620细胞的增殖，与阳性对照组相比差异有统计学意义，其最高抑制率达95.302±1.482％(p＜0.01)；倒置相差显微镜下观察发现化合物C作用后的细胞呈典型的凋亡改变；流式细胞术(flow cytometry，FCM)显示化合物C能阻滞SW620细胞于G0/G1和S期，减少G2/M的比例，并诱导细胞凋亡，其最高凋亡率达98.20±0.910％；Western blot法显示化合物C对SW620细胞中ERK、JNK、p38及其相应磷酸化产物均有浓度依赖性的抑制作用，且三者磷酸化产物的抑制程度更高。rn 结论：温郁金醚提物中二萜类化合物C对人结肠腺癌SW620细胞的增殖有显著的抑制作用，阻滞其细胞周期，诱导细胞凋亡，并抑制MAPK通路中关键蛋白的表达与活化，是温郁金二萜类化合物C发挥抗肿瘤作用的机制之一。

摘要： 目的：探讨结肠腺癌与细胞凋亡及其相关抑凋亡蛋白Bcl-2、Bcl-xl和Bcl-w的关系。rn 方法：收集北京大学第三医院手术切除14例结肠腺癌标本,肠镜取正常结肠粘膜组织27例,所有标本均经病理明确诊断。用TUNEL法检测其凋亡水平,并用免疫组化PV法检测蛋白Bcl-2、Bcl-xl和Bcl-w的表达水平。rn 结果：正常结肠粘膜组织的细胞凋亡指数明显高于结肠腺癌(t=3.35,P=0.0020.05)。rn 结论：结肠腺癌的凋亡水平明显低于正常结肠粘膜组织,抑制凋亡蛋白Bcl-xl和Bcl-w的高表达可能在结肠腺癌的发生发展中发挥了重要的作用。

摘要： 目的：研究黄芪中活性成分毛蕊异黄酮在Caco-2细胞中的吸收转运.方法：采用高效液相法测定药物浓度,计算表观渗透系数(Papp),各处理组间采用LSD和Dunnett法进行多重比较低、中、高三种浓度的表观渗透系数.结论：毛蕊异黄酮的吸收可能主要以被动转运为主,同时有主动转运机制参与.

摘要： 目的：研究黄芪中活性成分毛蕊异黄酮在Caco-2细胞中的吸收转运.方法：采用高效液相法测定药物浓度,计算表观渗透系数(Papp),各处理组间采用LSD和Dunnett法进行多重比较低、中、高三种浓度的表观渗透系数.结论：毛蕊异黄酮的吸收可能主要以被动转运为主,同时有主动转运机制参与.

摘要： 目的：研究黄芪中活性成分毛蕊异黄酮在Caco-2细胞中的吸收转运.方法：采用高效液相法测定药物浓度,计算表观渗透系数(Papp),各处理组间采用LSD和Dunnett法进行多重比较低、中、高三种浓度的表观渗透系数.结论：毛蕊异黄酮的吸收可能主要以被动转运为主,同时有主动转运机制参与.

摘要： 目的：研究黄芪中活性成分毛蕊异黄酮在Caco-2细胞中的吸收转运.方法：采用高效液相法测定药物浓度,计算表观渗透系数(Papp),各处理组间采用LSD和Dunnett法进行多重比较低、中、高三种浓度的表观渗透系数.结论：毛蕊异黄酮的吸收可能主要以被动转运为主,同时有主动转运机制参与.

摘要： 目的：研究黄芪中活性成分毛蕊异黄酮在Caco-2细胞中的吸收转运.方法：采用高效液相法测定药物浓度,计算表观渗透系数(Papp),各处理组间采用LSD和Dunnett法进行多重比较低、中、高三种浓度的表观渗透系数.结论：毛蕊异黄酮的吸收可能主要以被动转运为主,同时有主动转运机制参与.

摘要： 公开了四臂-聚乙二醇-7-乙基-10-羟基喜树碱轭合物，如式(I)；公开了制备轭合物的方法和利用该轭合物治疗哺乳动物的方法。

摘要： 公开了四臂－聚乙二醇－7－乙基－10－羟基喜树碱轭合物，如式(I)；公开了制备轭合物的方法和利用该轭合物治疗哺乳动物的方法。

摘要： 本发明涉及一种结肠腺癌易感性预测试剂盒，其包括以下组分：STR‑1引物、STR‑2引物、STR‑3引物、STR‑4引物、STR‑5引物、STR‑6引物；进一步地，其还可包括：PCR扩增反应液、LIZ‑500分子量内标、去离子甲酰胺。本发明所述结肠腺癌易感性预测试剂盒可以用于结肠腺癌的诊断及易感性预测。本发明还提供了一种结肠腺癌易感性预测系统。

摘要： 本发明属于生物医药领域，公开了PROCR基因作为结肠腺癌的诊治标志物的用途。本发明的实验证明PROCR基因在正常组织和结肠腺癌组织中的表达存在显著差异。根据PROCR基因与结肠腺癌的相关性，可以将PROCR基因作为临床上诊断结肠腺癌的新的分子标志物，同时还可以将其作为结肠腺癌治疗药物的新靶标。

摘要： 本发明公开了COL18A1基因可以作为结肠腺癌早期诊断的分子标志物。本发明的实验证明，与正常组织相比，结肠腺癌组织中的COL18A1基因表达显著降低，且经过过表达实验证明COL18A1能够影响结肠腺癌细胞增殖和凋亡。根据本发明的研究成果，可以研发能够促进COL18A1基因表达的药物，从而实现临床上对于结肠腺癌的预防和治疗。

摘要： 本发明公开了VCAN基因可以作为结肠腺癌诊断的分子标志物，本发明的实验证明：与正常组织相比，VCAN基因在结肠腺癌组织中表达量低。本发明还公开了VCAN基因可以用于制备治疗结肠腺癌的药物。本发明的研究成果提供了一种新的结肠腺癌临床诊断方法，同时提供了一种治疗结肠腺癌的药物新靶标。

摘要： 本发明公开了SLC38A4作为结肠腺癌的诊治靶标。据此可将SLC38A4用于开发诊断结肠腺癌的产品、开发治疗结肠腺癌的药物。本发明的研究成果为临床医师制定个性化治疗方案提供理论基础、并且能够为结肠腺癌药物的开发提供新的药物靶点。

摘要： 本发明公开了基于PCD相关基因组合构建的模型在制备预测结肠腺癌预后产品中的应用。采用结直肠癌中差异表达的14个PCD关键基因包括(SPTBN2、DNAJC2、DRD4、SH3GL3、FOXS1、GSTM1、ISYNA1、NOL3、GPR27、PPARGC1A、RAB36、SEZ6L2、SERPINE1和TNNT1)作为检测靶标构建的预后模型PCDSig，该模型具有良好的1年、2年、3年临床预后预测能力，模型可较好的区分高风险人群和低风险人群，且高风险和低风险患者在免疫浸润,免疫治疗的应答与药物靶点基因表达及化疗药物敏感性方面存在差异，可通过模型筛选目标获益人群，有效的指导临床进行精准及个性化治疗，避免过度治疗以及延误患者病情。基于上述模型开发了预测患者1年、3年、5年生存概率的列线图，使模型可视化，为临床医生判断COAD患者的预后提供了条件。

摘要： 本发明公开了一种结肠腺癌的焦亡相关lncRNA预后模型及其构建方法和应用，构建方法包括：S1、从TCGA数据库获取结肠腺癌的转录组数据、miRNA数据及患者临床数据；S2、筛选得到DEmRNAs、DElncRNAs和DEmiRNAs；S3、根据数据库筛选出焦亡相关mRNAs及相关联的焦亡相关miRNAs和焦亡相关lncRNAs，构建焦亡相关ceRNA网络；S4、将焦亡相关lncRNAs与临床数据进行整合，进行单因素Cox回归分析，得到与结肠腺癌生存相关的lncRNA；S5、根据LASSO回归分析建立焦亡相关lncRNA预后模型。本发明实现通过焦亡相关lncRNA对结肠腺癌进行预后判定。

摘要： 本发明属于生物技术领域，公开了CUL7作为生物标志物在结肠腺癌预后评估中的应用，具体公开了CUL7作为生物标志物的应用。本发明通过用生物信息学和组织芯片(TMA)探讨CUL7表达与COAD的预后和临床病理特征之间的关系，结果表明，与正常组织相比，CUL7在COAD肿瘤组织中表达明显增加。K‑M曲线显示，在COAD中，CUL7高表达与生存率降低相关，提示CUL7可作为结肠腺癌早期筛查或预后的生物标志物，作为临床试验的治疗靶点。