组蛋白甲基化

摘要： IgA肾病(IgA Nephropathy,IgAN)是目前最常见的原发性肾小球肾炎,是一种多基因参与的免疫相关性疾病。然而目前GWAS研究中关于IgAN的遗传易感位点仅能解释4~7%的疾病遗传度。有研究发现了表观遗传学在IgAN中的作用。表观遗传学是指DNA序列未发生变化,但生物体的表型发生了可遗传性的改变,其机制主要包括DNA甲基化、组蛋白甲基化、MicroRNA调控、染色质重塑等。本文就目前表观遗传学特别是DNA甲基化在IgA肾病中的研究进展做一综述。

摘要： Molecular Cell|组蛋白H3.3 K27M和K36M突变通过破坏染色体修饰之间的拮抗作用影响发育编码组蛋白变体H3.3基因发生点突变是多种癌症发生的原因之一,其中最典型的是第27位(H3.3K27M)和36位赖氨酸被蛋氨酸所取代(H3.3K36M)。这两种突变通过抑制对应组蛋白甲基转移酶的活性调控肿瘤发生。然而,H3.3K27M和H3.3K36M突变是否通过调控组蛋白甲基化来调控个体发育尚不清楚。

摘要： 膀胱癌发病机制复杂,同时又是基因突变最频繁的人类癌症之一。近年研究表明,表观遗传学调控在膀胱癌的发生发展中具有重要作用,与组蛋白甲基化修饰相关的组蛋白甲基转移酶和组蛋白去甲基化酶是其中重要的环节。组蛋白甲基转移酶和组蛋白去甲基化酶的高频突变及异常表达改变了核小体的原子结构,导致细胞基因表达模式发生变化,通过促进或抑制各种效应蛋白募集,调控广泛的上下游信号通路促进上皮间充质转化,赋予干细胞表型和影响肿瘤免疫等,对膀胱癌的增殖、迁移和侵袭等恶性生物学行为产生影响,直接参与膀胱癌的发生发展过程。

摘要： 组蛋白修饰为表观遗传学的重要内容之一,对神经发育有重要影响,如对神经细胞分化及记忆的形成有重要作用。组蛋白修饰异常可改变正常表观遗传的平衡,造成一系列神经发育障碍疾病。组蛋白乙酰化及甲基化是最常见的两种修饰,前者由组蛋白乙酰转移酶与组蛋白去乙酰化酶共同调控,后者由组蛋白甲基转移酶和组蛋白脱甲基化酶调控。组蛋白乙酰化和甲基化调控基因表达异常可影响神经发育。组蛋白乙酰化酶相关基因异常导致疾病包括Rubinstein-Taybi综合征、KAT6A综合征、Genitopatellar综合征、SBBYSS综合征等;组蛋白去乙酰化酶相关基因异常导致疾病主要有2q37缺失综合征。组蛋白甲基化酶相关基因异常导致疾病主要有歌舞伎综合征、Sotos综合征、Wiedemann-Steiner综合征等。目前对组蛋白修饰与神经发育之间的相互作用机制知之甚少,进一步研究相关机制,可为神经发育障碍性疾病的治疗提供新的理论依据并为药物研究、开发提供新的思路。

摘要： 遗传和表观遗传改变的相互依存控制着肿瘤的发生发展。鳞状细胞癌扩增基因1(gene amplified in squamous cell carcinoma 1,GASC1)在多种肿瘤中扩增和过表达,其上调与患者不良预后相关。GASC1基因编码的Jumonji C结构域蛋白为组蛋白赖氨酸去甲基化酶,其过表达可引起组蛋白甲基化程度降低,调控肿瘤干细胞维持中关键基因的表达,从而诱发肿瘤。GASC1是极富潜能的抗癌治疗靶点,其多种抑制剂已被鉴定和报告。

摘要： 果蝇zeste基因增强子的人类同源物2(EZH2)编码组蛋白甲基转移酶EZH2,与其他关键蛋白共同组成多梳抑制复合物PRC2,通过催化组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化发挥转录抑制作用。研究发现,在多种恶性肿瘤细胞中存在EZH2的突变及异常表达,这些异常导致了某些抑癌基因的沉默,与癌症的发生、发展、转移、侵袭及预后不良有重要关系。目前,EZH2作为癌症治疗的靶标成为了研究热点,其抑制剂也作为新型癌症靶向药物,投入临床试验及应用。该文对EZH2的肿瘤生物学效应及其在癌症治疗等领域的应用进行综述,以期更加清晰地展示EZH2在肿瘤学领域的研究价值。

摘要： 目的 评估骨质疏松性骨折(osteoporotic fracture, OPF)患者与非OPF患者肌肉病理状态及组蛋白甲基化情况的差异。方法 从上海中医药大学附属龙华医院骨伤科随机收取6例符合纳入标准的OPF和非OPF患者,手术内固定时取骨折部位肌肉,进行HE染色、MASSON染色、免疫组化染色及RT-qPCR检测,评估OPF患者和非OPF患者的肌肉病理状态差异和组蛋白甲基化情况。结果 HE染色显示OPF患者肌肉与非OPF患者肌肉相比,肌肉松弛现象比较明显,而非OPF患者肌肉较紧实。MASSON染色显示OPF患者肌肉与非OPF患者肌肉相比,肌肉胶原纤维分布更多。骨折断端肌肉RT-qPCR显示OPF患者较非OPF患者SUV39H1基因相对表达量增高。骨折断端肌肉免疫组化显示OPF患者较非OPF患者肌肉H3K9Ac乙酰化程度低,肌肉H3K9me3甲基化程度高。结论 骨质疏松性骨折患者肌肉更加松弛,胶原纤维含量增高,而这可能是由于肌肉组蛋白甲基化程度升高,乙酰化降低造成的。

摘要： 在真核生物中,作为表观遗传调控的常见机制,DNA甲基化和组蛋白甲基化主要影响染色质结构和基因的转录表达,特别是在哺乳动物细胞基因表达调控、维持基因组稳定性等方面起着重要的作用。本文综述了DNA甲基化修饰及其基因表达调控作用;组蛋白甲基化修饰的基因表达调控方式、功能及其研究进展;以及DNA甲基化和组蛋白甲基化在表观遗传调控方面的相互作用。

摘要： 根系微生物组与植物的养分吸收、抗病抗逆等生长发育过程密切相关,其在植物根系的定殖和组装受环境和植物遗传途径等因素的影响。表观遗传调控是调节染色体行为和基因表达的重要机制,探究表观遗传途径与植物根系微生物的关系能够更系统地揭示植物生长发育过程。表观遗传调控与宿主微生物组的关系已在动物模型中得到研究,但在植物中相关研究较少。

摘要： 结直肠癌是发生于结肠或直肠的恶性肿瘤,发病率较高.为了提高结直肠癌的预后,需要进一步阐明结直肠癌的发病机制.表观遗传能够直接影响结直肠癌的进展和转移,而组蛋白甲基化是一种重要的组蛋白修饰手段,能够调控下游基因的转录过程.大量研究结果证实组蛋白甲基化对结直肠癌的进展产生影响,相关组蛋白甲基化及去甲基化的抑制剂可作为潜在的结直肠癌治疗药物发挥作用.对结直肠癌及其相关甲基化调控进行综述,总结组蛋白甲基化修饰的类型及其调控,论证组蛋白甲基转移酶与去甲基化酶参与结直肠癌进展调控方式,并总结组蛋白甲基化抑制剂对于治疗结直肠癌的潜在意义,探究相关抑制剂作为结直肠癌治疗药物的可能性.

摘要： 目的:观察组蛋白甲基化与基因启动子区甲基化在抑制骨肉瘤细胞中印迹基因TSSC3表达中的作用,探讨二者在调控TSSC3表达中的先后顺序及作用.方法:利用BSP、染色质免疫共沉淀检测印迹基因TSSC3启动子区的甲基化情况及组蛋白甲基化标记的结合情况;利用5-AzA(去甲基化药物)处理骨肉瘤细胞SaOS2或敲低SaoS2细胞中EZH2(组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶)的表达,在不同时相点检测TSSC3启动子区的甲基化情况及组蛋白甲基化标记的结合程度.

摘要： 机体代谢过程和速率的变化直接影响胞内腺苷浓度的变化.腺苷直接调控许多代谢酶的活性.与DNA甲基化相比,组蛋白的甲基化的动态变化更明显,受细胞的甲基化SAM/SAH潜力影响更大.腺苷是SAH水解酶的抑制剂,腺苷的变化影响SAM/SAH的变化,引起组蛋白的甲基化的变化.基因的启动子部位的组蛋白甲基化变化启动或抑制该基因的表达.一些重要的疾病如2型糖尿病和肝纤维化疾病都与腺苷调控的组蛋白甲基化有关。

摘要： 血液病肿瘤的发生发展与抑癌基因、细胞周期蛋白基因、分化调节基因、DNA损伤修复基因等的异常表达或沉默有密切的关系.本文旨在从组蛋白甲基化对白血病相关基因的表达的调控作用研究和对白血病治疗指导研究进展进行综述.

摘要： 组蛋白甲基化修饰是遗传信息外遗传的一种重要方式.它与乙酰化一样也是一个动力学过程,它是由组蛋白甲基化酶和去甲基化酶进行动力学调控的.现已明确知道组蛋白去甲基化是由组蛋白去甲基化酶所催化的,在此过程中有内源性甲醛的产生.甲醛能否成为组蛋白甲基化过程的甲基供体?是我们研究组十分感兴趣的一个问题.有两种可能性:(1)直接反应,其机理不甚清楚;(2)间接反应,即内源性甲醛向组蛋白提供甲基可能经历"甲醛→活性甲醛→S-腺苷甲硫氨酸"的过程;使组蛋白甲基化、去甲基化与甲醛之间形成一个反应环路.证实这个假设的关键是解决细胞内甲醛的测量技术.

摘要： 通过研究p300-RNAi后心脏发育相关核心转录因子GATA4基因表达及组蛋白乙酰化和甲基化修饰变化,同时探讨组蛋白乙酰化修饰与组蛋白甲基化修饰之间的相互影响,以期阐明胚胎心脏发育过程中GATA4基因的组蛋白乙酰化及甲基化修饰调控网络及两种不同修饰方式之间的复杂的相互作用.本研究结果提示，GATA4表达的表观调控主要由p300与组蛋白H3结合并催化H3K4,H3K9乙酰化修饰而完成，p300介导的乙酰化修饰对甲基化修饰存在调控作用，但具体机制尚不明确。本研究成果为进一步阐明心脏发育过程中的表观遗传调控网络奠定了基础，并为研究先天性心脏病的表观遗传学发生机制提供了线索。

摘要： 组蛋白甲基化是表观调控的重要组成部分，对植物体的生长发育和基因表达调控有着至关重要的作用。本研究从水稻中克隆了编码组蛋白H 3 K 9甲基转移酶基因S D G 714.其N端具有核定位信号，C端具有甲基转移酶活性和位点催化特异性。采用RNAi手段产生的S D G 714功能缺失性突变体，表型为颖壳、叶片、茎上大表皮毛缺失。同时，copia类逆转座子Tos17位点的组蛋白甲基化、包括CNG和CpG位点的DNA甲基化也降低，SDG 714功能缺失性突变体后代中Tos17转座子的表达水平明显的提高，且发生转座。该研究首次将组蛋白甲基化与逆转座子转座现象联系在一起，不仅为肿瘤研究提供一定的理论基础，同时，由于SDG 714功能缺失性突变体后代不经过组织培养Tos17可以发生一定频率的转座，为快速产生水稻突变体提供了一条新途径。

摘要： 目的：本研究在灵芝转录组基础上,对灵芝精氨酸甲基转移酶GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析. 方法：利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM值分析灵芝不同生长时期GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量. 结果：生物信息学分析表明GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的ORF区且为全长,而GLPRMT3不为全长cDNA;蛋白结构域分析显GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3都具有组蛋白精氨酸甲基转移酶最保守的AdoMet-MTases结构域;利用同源建模法对灵芝的PRMT进行分析,预测了其整体空间结构;系统进化树聚类分析显示GLPRMT1、GLPRMT2、GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族、PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;基因表达水平显示GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1、GLPRMT3,且3个精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势. 结论：本研究结果为揭示灵芝表观调控机理奠定了理论基础.

摘要： 目的：本研究在灵芝转录组基础上,对灵芝精氨酸甲基转移酶GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析. 方法：利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM值分析灵芝不同生长时期GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量. 结果：生物信息学分析表明GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的ORF区且为全长,而GLPRMT3不为全长cDNA;蛋白结构域分析显GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3都具有组蛋白精氨酸甲基转移酶最保守的AdoMet-MTases结构域;利用同源建模法对灵芝的PRMT进行分析,预测了其整体空间结构;系统进化树聚类分析显示GLPRMT1、GLPRMT2、GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族、PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;基因表达水平显示GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1、GLPRMT3,且3个精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势. 结论：本研究结果为揭示灵芝表观调控机理奠定了理论基础.

摘要： 目的：本研究在灵芝转录组基础上,对灵芝精氨酸甲基转移酶GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析. 方法：利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM值分析灵芝不同生长时期GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量. 结果：生物信息学分析表明GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的ORF区且为全长,而GLPRMT3不为全长cDNA;蛋白结构域分析显GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3都具有组蛋白精氨酸甲基转移酶最保守的AdoMet-MTases结构域;利用同源建模法对灵芝的PRMT进行分析,预测了其整体空间结构;系统进化树聚类分析显示GLPRMT1、GLPRMT2、GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族、PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;基因表达水平显示GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1、GLPRMT3,且3个精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势. 结论：本研究结果为揭示灵芝表观调控机理奠定了理论基础.

摘要： 目的：本研究在灵芝转录组基础上,对灵芝精氨酸甲基转移酶GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因进行全面的生物信息学分析. 方法：利用生物信息学方法对灵芝GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因编码氨基酸序列的理化特性、亲/疏水性、功能域、二级结构、三级结构和系统发育进化等进行分析和预测;利用转录组FPKM值分析灵芝不同生长时期GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3基因的相对表达量. 结果：生物信息学分析表明GLPRMT1和GLPRMT2均具有完整的ORF区且为全长,而GLPRMT3不为全长cDNA;蛋白结构域分析显GLPRMT1、GLPRMT2和GLPRMT3都具有组蛋白精氨酸甲基转移酶最保守的AdoMet-MTases结构域;利用同源建模法对灵芝的PRMT进行分析,预测了其整体空间结构;系统进化树聚类分析显示GLPRMT1、GLPRMT2、GLPRMT3分别与真菌的PRMT3家族、PRMT1家族和PRMT5家族聚为一支;基因表达水平显示GLPRMT2的表达量明显高于GLPRMT1、GLPRMT3,且3个精氨酸甲基转移酶基因表达随着灵芝个体的发育均呈上升趋势. 结论：本研究结果为揭示灵芝表观调控机理奠定了理论基础.

摘要： 本发明提供用于检测组蛋白位点三甲基化修饰的重组蛋白及其应用。本发明重组蛋白的氨基酸序列中包括串联的N端GST融合蛋白序列和C端Tudor结构域序列。本发明的重组蛋白对H3K4和H4K20的亲和力强，可用于替代商业化抗体来进行Western Blot实验，灵敏度高，没有交叉结合发生，且生产成本显著降低，批次质量十分稳定，可以快速实现批量化生产。

摘要： 本发明属于植物基因工程技术领域，具体涉及一种水稻组蛋白去甲基化酶基因及其编码蛋白与应用。本发明提供了一种新的水稻组蛋白去甲基化酶基因OsJMJ706，该基因失活可导致水稻花发育异常，内、外颖壳发育异常或缺失，种子变小，用western blot方法检测发现其有去除组蛋白H3K9me3和H3K9me2位点甲基化的酶活性。本发明提供了这个基因的核酸序列以及其蛋白序列与其应用。

摘要： 本发明提供用于检测组蛋白位点三甲基化修饰的重组蛋白及其应用。本发明重组蛋白的氨基酸序列中包括串联的N端GST融合蛋白序列和C端Tudor结构域序列。本发明的重组蛋白对H3K4和H4K20的亲和力强，可用于替代商业化抗体来进行Western Blot实验，灵敏度高，没有交叉结合发生，且生产成本显著降低，批次质量十分稳定，可以快速实现批量化生产。

摘要： 本发明公开了组蛋白去甲基化酶基因OsJMJ718在调控植物种子活力中的应用。本发明通过分别构建OsJMJ718基因的过表达载体和CRISPR/Cas9敲除载体并转化水稻中花11，分别获得OsJMJ718基因的超表达和功能缺失突变体转基因植株；结果显示，突变OsJMJ718基因影响正常条件下水稻种子萌发及幼苗建成能力，表明OsJMJ718基因调控水稻种子活力，为培育高活力水稻品种奠定了基础，也有利于直播稻生产。

摘要： 本发明属于生物基因工程技术领域，具体为一种水稻组蛋白赖氨酸甲基化修饰识别蛋白及其编码基因与应用。该识别蛋白是下述氨基酸残基序列之一：1）序列表中的SEQ ID No：1；2）将序列表中的SEQ ID No:1的氨基酸残基序列经过一至五十个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且对植物的生长发育具有调控作用的蛋白质。本发明还包括含有本发明基因的重组表达载体、转基因细胞系和工程菌以及扩增该基因中任一片段的引物对。该水稻组蛋白赖氨酸修饰识别蛋白的功能缺失突变体株系生长矮小。本发明为植物品种改良提供了一个优质基因，具有较高的实际应用价值，应用前景广阔。

摘要： 本发明属于植物基因工程技术领域，具体涉及一种水稻组蛋白去甲基化酶基因及其编码蛋白与应用。本发明提供了一种新的水稻组蛋白去甲基化酶基因OsJMJ706，该基因失活可导致水稻花发育异常，内、外颖壳发育异常或缺失，种子变小，用western blot方法检测发现其有去除组蛋白H3K9me3和H3K9me2位点甲基化的酶活性。本发明提供了这个基因的核酸序列以及其蛋白序列与其应用。

摘要： 本申请公开了一种组蛋白去甲基化酶KDM6选择性抑制剂用存放装置，包括存放结构、定位结构和螺纹柱；所述存放结构包括底板、中间板和顶板，所述中间板位于所述顶板与所述底板之间，所述螺纹柱底端固接于所述底板顶端，且所述顶板与所述中间板均套接于所述螺纹柱表面；所述顶板顶端设有螺母，且所述螺母与所述螺纹柱螺纹连接；所述底板与所述中间板顶端均开有凹槽，所述凹槽内部设有第二弹簧，且所述第二弹簧套接于所述螺纹柱表面。采用了底板、中间板以及顶板的组合时结构，通过设置放置槽与压槽来将瓶装抑制剂收纳至两者之间，提高了对瓶装抑制剂的防护性能，同时本装置的可拆性较好，便于对其进行维修，且移动方便，稳定性较好。

摘要： 本发明公开了一种具有抑制组蛋白甲基化酶DOT1L二甲基化活性的多肽、抑制剂及其设计方法与应用，所述多肽的氨基酸序列如Seq No.1所示。所述抑制剂包括上述多肽。所述设计方法包括以下步骤：S1、获取AF10‑DOT1L复合物晶体结构，找出具有抑制DOT1L结合的多肽前体；S2、获得AF10‑多肽前体复合物晶体；S3、设计出具有与AF10特异性结合的多肽片段；S4、在S3的基础上进一步优化出具有抑制组蛋白甲基化酶DOT1L二甲基化活性的多肽。本发明还包括将上述多肽应用在组蛋白去甲基化酶DOT1L抑制剂药物制备中。与现有技术相比，该多肽具有能够特异性抑制组蛋白甲基化酶DOT1L二甲基化活性，具有良好的应用前景。

摘要： 本发明涉及一种研究基因启动子区DNA甲基化和组蛋白甲基化调控模式的方法，包括以下步骤：确定DNA甲基化对目的基因的调控、确定组蛋白H3K4me2/3对目的基因的调控、确定DNA甲基化和组蛋白H3K4me2/3对目的基因的表达调控；确定何种表观遗传修饰对目的基因起主要调控作用。通过本发明，本方法简单可行，具有可行性，操作简便，研究思路清晰可靠，具有广泛应用性，因DNA甲基化和组蛋白甲基化具有高度保守性，因此在不同物种或不同生物学过程中均能使用该方法研究DNA甲基化和组蛋白甲基化对基因表达的调控模式。

摘要： 本发明公开了一种具有抑制组蛋白甲基化酶DOT1L二甲基化活性的多肽、抑制剂及其设计方法与应用，所述多肽的氨基酸序列如Seq No.1所示。所述抑制剂包括上述多肽。所述设计方法包括以下步骤：S1、获取AF10‑DOT1L复合物晶体结构，找出具有抑制DOT1L结合的多肽前体；S2、获得AF10‑多肽前体复合物晶体；S3、设计出具有与AF10特异性结合的多肽片段；S4、在S3的基础上进一步优化出具有抑制组蛋白甲基化酶DOT1L二甲基化活性的多肽。本发明还包括将上述多肽应用在组蛋白去甲基化酶DOT1L抑制剂药物制备中。与现有技术相比，该多肽具有能够特异性抑制组蛋白甲基化酶DOT1L二甲基化活性，具有良好的应用前景。