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抗病基因同源序列

抗病基因同源序列的相关文献在2001年到2019年内共计69篇,主要集中在农作物、分子生物学、植物学 等领域,其中期刊论文69篇、专利文献117934篇;相关期刊45种,包括生物技术通报、植物分类与资源学报、热带作物学报等; 抗病基因同源序列的相关文献由289位作者贡献,包括孙雁、朱有勇、何月秋等。

抗病基因同源序列—发文量

期刊论文>

论文:69 占比:0.06%

专利文献>

论文:117934 占比:99.94%

总计:118003篇

抗病基因同源序列—发文趋势图

抗病基因同源序列

-研究学者

  • 孙雁
  • 朱有勇
  • 何月秋
  • 刘大群
  • 张劲松
  • 张志刚
  • 李学刚
  • 杨文香
  • 林剑伟
  • 王云月
  • 期刊论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 陆秀红; 张雨; 秦舒婷; 黄金玲; 张禹; 刘志明
    • 摘要: 根据已知抗病基因的NBS-LRR保守结构域设计简并引物,从抗南方根结线虫病的番茄材料cDNA中克隆抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),并通过qRT-PCR技术检测RGAs与南方根结线虫侵染的相关性。序列分析发现,2条序列具有NBS-LRR保守结构域,分别命名为F5-8和F5-20;保守区域氨基酸比对结果显示,F5-8(GenBank登录号为MG860907)和F5-20(GenBank登录号为MG860908)与已知抗病基因保守区域具有很高的相似性,其中F5-8与Mi-1相应区域氨基酸相似性为94%,F5-20与Hero基因相应区域氨基酸相似性为96%。qRT-PCR结果发现,F5-8和F5-20在接种南方根结线虫2龄幼虫24h后其表达量均发生了变化。初步推测F5-8和F5-20为南方根线线虫侵染相关基因同源序列。
    • 付瑜华; 贺尔奇; 雷石富; 李向勇; 张正学; 卢加举
    • 摘要: 在眼斑病和轮斑病病原菌侵染下,分析果蔗NBS类抗病基因同源序列在侵染初期的表达情况,为后续克隆关键抗病基因、研究抗病机理提供理论依据.已克隆的7条果蔗RGAs可视为来源不同的3个基因片段.将2种病原菌分别针刺接种到感病基因型黔糖3号和抗病基因型黔糖5号叶片后,3条果蔗RGAs在2种病害侵染初期均受到不同程度的上调,RGA12478对两种病害的响应最为迅速,RGA5的表达量最高,尤其在轮斑病菌的胁迫下,RGA5在胁迫后12h的表达量大约分别是同时间点RGA12478和RGA36表达量的16倍和6倍.因此,RGA5可认为是果蔗在抵御轮斑病和眼斑病侵染初期发挥主要作用的抗病基因片段,后续应结合RACE技术获得基因全长,作为关键抗病候选基因研究其功能和在外源信号因子作用下的表达情况,全面了解该抗病基因的抗病机理.
    • 折红兵; 范桂彦; 张合龙; 王晓武; 武剑; 钱伟; 徐兆生
    • 摘要: In order to understand better the resistant mechanism of spinach (Spinach oleracea L.) downy mildew and lay foundation for further clone of spinach downy mildew resistance genes and marker-assisted-selection of resistance breeding,2 pares of degenerate primers were designed from the conserved motifs of NBS-LRR type plant resistance gene.There are 3 types of spinach material-commercial hybrid ‘RZ51-147’,inbred line‘ 12S3’ and‘ 12S4’ Two pares of primers were used for amplifying the disease-resistant gene analogs(RGAs) by polymerase chain reaction (PCR) from the genomic DNA of these 3 material.After cloning and sequencing the PCR products,23 resistance gene analogs with uninterrupted open reading frames (ORFs) and conserved domains of NBS were obtained from spinach,and deposited in GenBank with the accession number of KX914865-KX914887.Homology research showed that most of these 23 RGAs shared high homology with some putative disease-resistant genes or the other relative protein genes in Beta vulqaris.For example,the nucleotides of SP1,SP2,SP5,SP6,SP10,SP11,SP12,SP13 were over 86% identical to disease resistance protein RF45 from sugar beet,and the nucleotides of SP3,SP4,SP8,SP9,SP24 were over 85% identical to sugar beet disease resistance RPP13 protein.In addition,these 5 RGAs shared 32.20%-33.52% amino acid sequence homology with sunflower downy mildew resistance gene PI8,and clustered a group with PI8 gene in phylogenetic tree,suggesting that these 5 RGAs might be related to downy mildew gene.Homologous evolution analysis demonstrated that all of RGAs were ranked into non-TIR-NBS-LRR type R gene except SP7,which was consistent with the result based on multiple alignment of deduced amino acid sequences.%依据已知NBS-LRR类抗病基因的P-loop和GLPL两个保守结构域设计简并引物,对抗菠菜霜霉病商业杂交种RZ51-147、自交系12S3和12S4的基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,共获得23条具有完整开放阅读框且含有NBS结构的抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),编号为SP1~ SP17、SP19 ~ SP24,其在NCBI中的登录号为KX914865 ~ KX914887.核苷酸比较分析结果表明,这23条RGAs大多与甜菜中推测的一些抗病蛋白基因或其他相关蛋白基因具有较高的同源性,其中SP1、SP2、SP5、SP6、SP10、SP11、SP12、SP13等8条序列均与甜菜RF45类抗病蛋白有着86%以上的同源性;SP3、SP4、SP8、SP9、SP24等5条序列与甜菜RPP13类抗病蛋白的同源性在85%以上,与向日葵抗霜霉病基因PI8相应区域的氨基酸序列相似性为32.20%~ 33.52%,且在进化树上聚为一类,推测其可能与抗霜霉病相关.同源进化分析结果表明,除SP7外,其余序列均为non-TIR-NBS-LRR类抗病基因,并与推导的氨基酸序列多重比较结果一致.
    • 刘登全; 王园秀; 崔朝宇; 秦双林; 欧阳慧; 蒋军喜
    • 摘要: 为加深对柑橘黄龙病抗性机理的了解和为黄龙病抗性基因的克隆提供依据,根据已知植物抗病基因NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以柑橘黄龙病抗性品种“晚熟温州蜜柑”为供试材料,对其基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,结果共获得17条抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),其在NCBI中的登录号为KJ019189~KJ019199,KR815564~KR815569。序列分析表明,这17个RGAs与甜橙、柚等柑橘属中推测的一些抗病蛋白基因或其他相关蛋白基因具有显著高的同源性。其中一些RGAs与拟南芥抗霜霉病RPP13基因、柑橘抗衰退病毒基因Ctv或烟草抗TMV基因N具有51.7%~79.0%的氨基酸序列同源性。依据论文结果,笔者认为,晚熟温州蜜柑中存在较丰富的NBS-LRR类抗病基因,但具体哪些病基因与抗黄龙病相关尚需进一步研究。%In order to deepen understanding of the resistant mechanism of Citrus to Candiadatus Liberi-bacter asiaticus( CLas) and lay the foundation for cloning of citrus huanglongbing( HLB)-resistant gene,a pair of degenerate primers was designed from the conserved domains of NBS-LRR type plant disease-resistant gene and used for amplifying the disease-resistant gene analogs( RGAs) by polymerase chain reaction( PCR) from the genomic DNA of Citrus unshiu Marc.,a citrus cultivar resistant to HLB.After cloning and sequencing the PCR products,the nucleotide sequences and their deduced amino acid sequences of 17 RGAs were obtained and deposited in GenBank with the accession number of KJ019189-KJ019199 and KR815564-KR815569.Se-quence analysis showed that these 17 RGAs shared significantly high homology with some putative disease-re-sistant genes and other protein genes in Citrus sinensis or Citrus clementina, some of which shared 51.7%-79.0%amino acid sequence homology with the known disease gene of RPP13,Ctv,or N.Based on these re-sults,it is concluded that fairly rich NBS-LRR type plant disease-resistant genes exist in Citrus unshiu Marc. However,further research is needed to clarify which resistant genes are related with citrus huanglongbing.
    • 谢欢; 周颖; 杨文香; 张娜; 刘大群
    • 摘要: 目前已克隆的小麦抗叶锈病基因多数含有NBS类保守结构域,为克隆高抗叶锈病Lr24基因及其抗病相关基因,根据NBS保守结构域设计引物,对小麦抗叶锈病近等基因系TcLr24 cDNA进行扩增,得到534bp的抗病基因同源序列.对该序列进行同源性检索并验证,获得1408 bp的电子延伸序列.以此通过RACE技术分别获取2797 bp和3466 bp的cDNA与gDNA全长产物,其翻译的蛋白质序列含有NBS保守区的P-loop、Kinase 2a、Kinase 3a、HD和LRR保守结构,与大麦等单子叶植物NBS类蛋白序列同源性较高,生物信息学分析表明其为稳定的亲水性蛋白,分子质量104.28 ku,理论等电点6.15.半定量RT-PCR表明该片段所在基因序列为组成型表达.
    • 唐善军; 高杜娟; 陈友德; 李友荣; 薛丹; 陈新华
    • 摘要: Thirty-four rice lines’ genetic diversity was analyzed by using resistance gene analogue (RGA) principle. The results showed that abundant RGA polymorphism was observed by using primers XLRR for/XLRR rev and Pto-kin1/Pto-kin2. And there was signiifcant different in the resistance to rice false smut among tested lines with the diseased panicle rate range of 0-35.4% and the resistance to rice false smut in the range of resistance to highly susceptibility. The clustering analysis result showed that thirty-four rice lines could be divided into 5 groups at the genetic similar coefifcient 0.73, however their resistant levels couldn’t be distinguished from RGA analysis.%利用抗病基因同源序列的原理对34份水稻品系进行遗传多样性分析。结果表明:引物XLRR for/XLRR rev和Pto-kin1/Pto-kin2扩增的RGA序列具有丰富的多态性。供试材料的抗性鉴定表明,34份参试材料对稻曲病的抗性表现出明显差异,病穗率范围为0%~35.4%,抗性从抗到高感。聚类分析结果表明,在遗传相似系数为0.73时,34个水稻品种可分为5类,但与水稻材料的抗感水平没有明显的对应关系。
    • 赵芹; 谢大森; 何晓明; 罗少波; 彭庆务
    • 摘要: [目的]分离鉴定瓠瓜Lagenaria siceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs),为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.[方法]根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因保守区设计简并引物,从“大籽瓠”抗性材料基因组DNA中分离抗病基因同源序列,并利用生物信息学软件进行长度变异、保守结构域、同源比对与系统进化分析.[结果和结论]基于同源克隆策略,获得23条瓠瓜NBS抗病同源序列,命名为HNB1 ~ HNB23,GenBank登录号为KJ908192~KJ908214.序列分析及同源比对结果表明,这些RGAs长度变异在242 ~261 nt之间,18条序列具有连续开放阅读框(Open reading frame,ORF),推导氨基酸序列具有P-loop、Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域;核苷酸序列相似性为41.5%~ 98.8%,氨基酸序列相似性为21.5% ~100.0%;利用NCBI Blast同源搜索发现,与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40%~100%相似性;氨基酸序列聚类分析将其分为5个组;同源进化分析表明,23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因,与推导氨基酸序列多重比较结果一致.
    • 张艳芳; 温寿星; 黄镜浩; 包榕; 蔡子坚
    • 摘要: 本研究利用模糊搜索的方法,在2个柑橘基因组数据库中搜索到了3 731条柑橘抗病基因同源序列,并根据已知的注释信息对将其归为两类.这对研究柑橘抗病基因同源序列的分布及多样性具有重要意义.
    • 张艳芳; 温寿星; 黄镜浩; 包榕; 蔡子坚
    • 摘要: 本研究利用模糊搜索的方法,在2个柑橘基因组数据库中搜索到了3 731条柑橘抗病基因同源序列,并根据已知的注释信息对将其归为两类。这对研究柑橘抗病基因同源序列的分布及多样性具有重要意义。
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