外显子

摘要： 作者吴瑞珊、张梦媛、刘晓华、赵文忠的文章《评估精子受孕能力的外显子标记物筛选》发表在本刊2021年52卷5期,第52-56页,现更正作者单位为:广东省生殖科学研究所(广东省生殖医院)。特此更正。

摘要： 目的探讨Duchenne型肌营养不良(DMD)患儿临床表型与基因型的特点。方法收集2014年1月至2020年6月经临床及基因检查确诊为DMD的171例患儿的临床资料,对其临床表现和基因变异结果进行分析。结果171例患儿中男165、女6例;中位年龄4.1(1.7~7.0)岁,其中<1岁21例,~3岁41例,~7岁65例,~13岁44例。以运动发育落后、肌酶增高和肢体无力为主要表现。婴幼儿主要因肌酶(包括肌酸激酶、肌酸激酶同工酶、乳酸脱氢酶)升高首次至神经内科就诊。与幼儿组比较,婴儿组因肌酶升高首次至神经内科就诊比例较高,因运动落后就诊比例较低,差异均有统计学意义(P<0.05)。激素治疗可使大部分患儿病情得到改善。通过高通量测序技术发现,DMD基因多为大缺失(111例,64.9%),大重复变异26例(15.2%),点变异34例(19.9%)。变异可发生在基因的任何位置,但有两个缺失的热点区域,即位于基因中央区外显子45~52区(76例,占大缺失变异68.5%)以及位于5’端外显子2~28区(21例,占大缺失变异的18.9%)。结论肌酶增高和肢体无力为DMD患儿的主要临床表现,发现异常者应及时行基因检测。了解DMD临床表现及基因型特点对其预防、管理和治疗至关重要。

摘要： 目的了解17-α羟化酶/17,20-裂解酶缺陷症(17α-hydroxylase/17,20-lyasedeficiency,17OHD)患儿的基因变异及遗传情况。方法1例主要临床表现为双侧腹股沟区肿物、外生殖器女性化的假两性畸形患儿,临床诊断为17OHD,抽取患儿、患儿父母及哥哥的外周静脉血,采用高通量测序技术(High-ThroughputSequencing,HTS)进行全基因组外显子测序,分析患儿、患儿父母及哥哥的基因情况。结果患儿细胞色素P450c17酶基因(Cytochrome P450c17 enzymegene,CYP17A1 gene)第6外显子存在c.987delC(p.Tyr329fs)纯合突变;患儿父母及其哥哥均存在10号染色体CYP17A1基因第6外显子c.987delC(p.Tyr329fs)杂合突变。结论17OHD患儿存在10号染色体CYP17A1基因第6外显子c.987delC(p.Tyr329fs)纯合突变,其父母、哥哥均存在10号染色体CYP17A1基因第6外显子c.987delC(p.Tyr329fs)杂合突变。17OHD患儿的外显子突变遗传自父母。

摘要： 为了检测水貂GHR基因多态性及其与生长性状的相关性分析,寻找可用于选育水貂生长性状的分子遗传标记,以同龄同场的短毛黑水貂、红眼白水貂和咖啡水貂为研究对象,采用PCR产物直接测序检测GHR基因的单核苷酸多态性,利用SPSS 19.0软件将该基因多态性与水貂生长性状进行关联分析。结果表明,存在3个SNPs位点,分别为外显子3处的g.82C>T突变和外显子10处g.350C>T和g.501C>T突变;g.82C>T位点与短毛黑水貂的体长显著相关;g.82C>T位点与3种群体的体质量极显著相关;g.350C>T位点与3种群体的体长极显著相关;g.350C>T位点与短毛黑水貂的体长极显著相关;g.501C>T位点与红眼白水貂的体长显著相关。因此,GHR基因可作为候选基因辅助用于水貂群体生长性状的遗传改良。

摘要： 64岁的王先生最近被医院诊断为肺癌。医生说,王先生属于“不幸中的万幸”一不幸是因为罹患癌症,接下来的抗癌之路注定充满荆棘与坎坷;而幸运的是,相比那些已经丧失所有治疗机会、只能无助等待死神降临的癌友而言,王先生还有希望,因为他的基因检测结果显示:肺癌基因检测19外显子阳性,意味着他可以通过靶向药进行治疗。

摘要： 试验设计3对引物,采用PCR产物直接测序检测BMP2基因在短毛黑水貂和咖啡水貂共252个个体中的单核苷酸多态性,分析该基因对水貂毛长性状的影响,并对序列进行了分析。结果表明,外显子1、2和3在2个水貂品种中均无多态性;内含子1有1个SNPs:C159T位点,但是和毛长性状无相关性。水貂扩增序列与雪貂的同源性为98.2%,与其它哺乳动物的同源性都在81.2%以上。研究结果表明,水貂BMP2基因外显子1、2和3序列保守性高,该区域不是影响水貂毛长的功能结构域。

摘要： 目的 探讨B族Ⅰ型清道夫受体(SR-B1)外显子8基因变异及HDL-C水平与老年冠心病发病风险的关系。方法 选取我院2020年4月~2022年4月收治的220例老年冠心病患者(研究组)以及同期185例健康体检者(对照组)。采用TaqMan法检测SR-B1外显子8基因多态性,分析SR-B1外显子8基因多态性、HDL-C水平与冠心病发病风险的关系,采用logistic回归分析基因型与冠心病危险因素间的相互作用。结果 SR-B1外显子8基因存在3种基因型:CC、CT、TT,研究组C和T等位基因频率分别为74.32%和25.68%,对照组C和T等位基因频率分别为82.43%和17.57%。研究组的TT基因型、T等位基因频率均高于对照组(P<0.05,P<0.01)。研究组CC基因型的HDL-C水平高于CT、TT基因型,CC基因型的LDL-C水平低于CT、TT基因型(P<0.05)。研究组高血压、糖尿病比例、LDL-C水平显著高于对照组,HDL-C显著低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。多因素logistic回归分析显示,SR-B1外显子8基因(OR=0.581,95%CI:0.411~0.820,P=0.002)、高血压(OR=1.904,95%CI:1.137~3.188,P=0.014)、糖尿病(OR=1.774,95%CI:1.093~2.878,P=0.020)、HDL-C(OR=0.495,95%CI:0.320~0.764,P=0.002)、LDL-C(OR=1.960,95%CI:1.063~3.613,P=0.031)均是冠心病发病的影响因素。结论 SR-B1外显子8基因多态性及血清HDL-C水平是老年冠心病发病风险的影响因素,其中SR-B1外显子8基因C→T突变可能引起血清HDL-C水平的降低。

摘要： 目的 检测一个着色性干皮病(xeroderma pigmentosum,XP)家系的基因突变.方法 在2019年1—12月间,收集XP家系的临床资料和外周血标本,先证者采用新一代测序(next generation sequencing, NGS)进行测序,其余亲属采用Sanger测序验证.结果 在一个中国家系中发现了POLH外显子9的无义突变(NM_006502.2,c.1066 C ＞T, p.Arg356Ter)和与XP相关的大片段缺失(外显子5-8).结论 中国XP家系,为XP的基因诊断和遗传咨询提供了重要信息.

摘要： 本研究旨在探索小尾寒羊S100钙结合蛋白A1(S100 Calcium Binding Protein A1,S100A1)基因结构、突变位点以及在各组织和脂肪细胞不同阶段的表达差异.通过荧光定量PCR检测S100A1基因在3日龄小尾寒羊脂肪组织及6月龄脂肪、肌肉、肺、脾、肠、心、肝组织的表达差异;体外克隆S100A1基因编码区,序列进行生物信息学分析;体外分离2月龄小尾寒羊前体脂肪细胞,培养并诱导分化;荧光定量PCR检测S100A1基因在细胞分化第0～12天的表达规律;60只6月龄羊血液基因组被用来检测S100A1基因的突变位点.结果表明:S100A1基因在6月龄羊脂肪组织中的相对表达量显著大于3日龄;S100A1基因在脂肪细胞分化过程中呈先升高后降低再升高的表达规律;小尾寒羊S100A1基因编码区序列与NCBI网站预测序列一致;S100A1蛋白主要定位在细胞质;蛋白二级结构存在4个α-螺旋、2个β-折叠、6个转角、2个卷曲.基因的5个外显子均无突变位点.S100A1基因在细胞分化期间以及不同日龄小尾寒羊脂肪组织中差异表达,说明S100A1基因可能参与脂肪代谢过程并发挥生理功能.

摘要： 目的 探讨NOTCH3 Cys206*无义突变所致的伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病(CADASIL)的临床及影像学特征.方法 分析河北省邢台市第三医院两例携带有新型NOTCH3基因突变患者的临床资料、家系发病情况、影像资料及基因检测情况.结果 两例患者既往有卒中病史且伴有进行性认知功能减退,但没有常见的血管危险因素,头颅MRI提示脑室周围、外囊及颞极存在广泛的白质病变.NOTCH3基因检测结果提示两例均为c.618C>A p.(Cys206*)突变,该突变位点在CADASIL病例中尚未被报道.结论 本文两例提示Noth3基因的无义突变(4号外显子,c.618C>A,p.Cys206*)患者也可表现出典型CADASIL的临床症状和影像学特点.

摘要： 对一例重症联合免疫缺陷患儿进行基因检测,明确其致病基因及突变位点及表达产物的改变.联合重症免疫缺陷病情严重，危及生命。疫苗接种引发感染可致命。该患儿为IL2RG剪接突变引发的X连锁隐性遗传重症联合免疫缺陷。C.270-1 G＞T为本研究发现的新突变，经RT-PCR证实为致病性剪接突变，引起R1VA剪接异常，丢失3个外显子。

摘要： MITF是色素细胞发育成熟中的重要因子,参与黑素生成的调控,从而影响动物毛色.本研究采用PCR-测序技术,检测了白色獭兔、海狸色獭兔样本中MITF基因5个外显子区域的多态性.结果表明:外显子2,4未表现出多态,外显子1,5,7中存在一些多态位点.这些多态存在于白色个体之间或白色和海狸色个体之间.分析表明,MITF中部分多态与獭兔毛色有显著关联,说明MITF是影响毛色的关键基因.

摘要： 以鹅血清总DNA为模板,设计引物对鹅脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因的第4至第6外显子区域进行扩增.测序结果表明,鹅LPL基因第4外显子到第6内含子的片段大小为3404bp,鹅LPL基因第4至6外显子序列与鸡LPL同源性达到91.9％,与人、羊、牛、猪等哺乳动物同源性在74％-77％之间.核酸进化树显示,鹅鸡较早地与哺乳类动物分化开来.分析了该区域编码氨基酸的亲水性、电荷密度和氨基酸位于蛋白质表面的概率,以及密码子的使用策略.

摘要： Leptin是一种内分泌激素(167个氨基酸),主要在脂肪组织中表达,通过下丘脑对机体内能量的消耗和摄取起着重要的调节作用.鉴于此本文对野猪、家猪及野家杂种猪leptin的2、3外显子进行了SNPs分析,并检测到了多态性.对纯合子片段进行克隆和测序,结果表明在编码区的214位碱基由T突变为C,编码的氨基酸没有发生改变;364位碱基由C突变为G,365位碱基由G突变为C,编码的Arg转变为Ala;426位由G突变为A,编码的氨基酸没有发生改变;451位插入碱基T,造成移码突变;462位由G突变为T.

摘要： 在临床实践中遇到的大多数出血性疾病一般可通过基因表型分析得到诊断.20世纪80年代以来,由于凝血因子编码基因特征得以明确,使出血性疾病的诊断和治疗取得了显著进步.对于血友病来说,分子基因检测可用于确定携带者、产前诊断以及评估凝血因子浓缩制剂应用后抑制物形成和发生过敏反应的可能性,因此它已成为临床综合管理的一部分.近年来,血管性血友病(vWD)分子遗传学的研究取得了显著进步,为开展基因诊断提供了途径和方法,但如何把复杂的基因缺陷以及新兴知识转化为诊断策略仍然存在着问题.基因分析的新进展包括全基因组连锁分析和全基因组/外显子测序的应用，可在诊断未明的患者中检测出导致出血的基因位点，最终提高对遗传性出血性疾病患者的治疗。

摘要： 目的：通过检测骨髓增生异常综合征(MDS)患者中IDH1与IDH2基因突变的发生情况来探讨其与疾病的关系.方法：选取2001年6月至2010年12月于东南大学附属中大医院与苏州大学附属第一医院血液科初诊MDS患者159例,根据WHO(2008)标准进行诊断与分型.应用Invitrogen公司提供的DNA试剂盒抽提基因组DNA,采用PCR技术和直接测序法分别检测IDH1和IDH2基因第4号外显子的突变情况,分析其与MDS的关系.

摘要： 本室之前在一名疑似FXS病人的FMR1基因中发现一个46bp大小的新型隐匿外显子(cryptic exon)，介于外显子9和外显子10之间，为内含子9中的一个小片段。为研究此隐匿外显子是否也存在于其它物种中，我们利用生物信息学软件对其它物种的FMR1基因进行分析。结果显示：在猕猴、黑猩猩、苏门达腊猩猩的同源基因中具有相似的基因序列，但其所在位置宵所不同，而小鼠及人鼠基因组则无相似的同源序列。同时对人FMR1基因可能的剪接变异体进行预测。本研究证明在人FMR1基因内含子9中存在一个新的隐匿可变剪接外显子，为研究FMR1基因可变剪接与FXS之间的关系奠定了基础。

摘要： 目的：观察不同证候荷瘤小鼠的情志与神经内分泌基因表达的特征。方法：采用小鼠计量化四诊和辨证方法、RNA Nano LabChip(Agi lent)、及Genechip Mouse Exon 1.0 sT Array(Affymetrix)等先进技术，观察邪毒壅盛证、气虚证、阳气虚证、气阴阳虚证等H22荷瘤小鼠下丘脑、垂体、肾上腺基因表达与剪接。结果：抓力/旷场检测表明荷瘤小鼠存在焦虑、恐惧、愤怒等情志，其中邪毒壅盛小鼠尤为严重；荷瘤小鼠下丘脑基因表达较正常小鼠有显著改变，并导致垂体、肾上腺的抑制，其中邪毒壅盛较同期气虚小鼠程度严重；不同证候荷瘤小鼠下丘脑、垂体等组织POMC、CRHBP、CRHR、GnRH、GnRHR等基因不同程度地发生了外显子剪接方式的改变，其中以邪毒壅盛证尤甚。结论：荷瘤小鼠存在情志的改变，存在下丘脑一垂体一肾上腺等神经内分泌组织基因表达与剪接的显著差异与特征，其中以邪毒壅盛证最为严重，这可能是导致该证候小鼠预后差的重要因素；不同证候荷瘤小鼠下丘脑等组织发生大量的基因表达和外显子剪接的差异，推测部分与情志、不同证候有关，值得深入研究．

摘要： 采用PCR法自人DNA文库中分别克隆人分泌型klotho (hskl)基因的三个外显子序列,依次构建载体pBS-hsklex1、 pBS-hsklex(1+2)、克隆载体pBS-hskl。经核酸测序确证后,用PCR法自克隆载体pBS-hskl克隆hskl基因,最终建立真核表达载体pcDNA3.1/Zeo(+)-hskl。

摘要： 本发明涉及神经退行性病症，并且具体地涉及用于治疗这种病状，例如阿尔茨海默病的新颖寡核苷酸。本发明提供新颖反义寡核苷酸和包括这种寡核苷酸的组合物以及用于治疗神经退行性病症的疗法和方法。本发明包含基因组编辑技术，以实现与使用新颖反义寡核苷酸类似的结果。

摘要： 本发明公开了一种检测表皮生长因子受体基因外显子19缺失突变和外显子21点突变的方法，该方法在同一个反应体系中进行酶切富集PCR反应和ARMS荧光定量PCR反应来分别检测E746_A750del缺失突变和L858R点突变，其将酶切突变富集PCR和ARMS荧光定量PCR整合在一起，通过有效的温度和时间控制，经一个反应程序即可完成酶切突变富集和ARMS荧光定量PCR反应。

摘要： 本发明公开了一种杜氏肌营养不良症相关的外显子剪接增强子、sgRNA、基因编辑工具及应用。相关的外显子剪接增强子、sgRNA和基因编辑工具可在制备治疗杜氏肌营养不良症的药物中应用。其中，基于胞嘧啶脱氨酶AID的突变体与Cas9突变体设计的基因编辑工具，以腺相关病毒AAV为载体，可对哺乳动物的基因组进行定点改造。本发明通过优化编辑工具的编码核酸序列以及元件组成结构，可以高效实现哺乳动物遗传物质DNA的定点靶向改造，通过对携带疾病突变的核酸序列进行靶向遗传操作，使其致病突变无法保留至成熟的蛋白质氨基酸序列中或使致病突变无法发挥其功能，从而达到治疗多种基因突变类遗传性罕见病的目的，具有高效，安全，稳定的优点。

摘要： 本发明公开了一种抑制外显子剪切抑制子功能的反义寡核苷酸的筛选方法。包括如下步骤：1）获得靶基因的外显子剪切抑制子和临近的基因序列。2）根据序列设计和合成一系列经硫代修饰的反义寡核苷酸。3）将反义寡核苷酸转染到细胞中，并在24小时后提取总蛋白。用western杂交法确定与靶基因外显子剪切抑制子结合效果最好的反义寡核苷酸。4）根据步骤3）获得的反义寡核苷酸的序列，合成2'‑O‑Methyl和硫代修饰的反义寡核苷酸，并转染细胞，用RT‑PCR的方法确定其可以高效地抑制外显子剪切抑制子功能。该方法适用于经济地筛选可以高效地抑制外显子剪切抑制子功能的反义寡核苷酸，具有良好的开发和应用前景。

摘要： 人tau蛋白外显子2、外显子3、外显子10多克隆抗体。属于传染病诊断与研究领域。因外显子自身表达蛋白后相对分子质量较小，均为3KD，难于分离和纯化，同时难以保证其免疫原性。针对上述问题，申请人在表达和免疫时采用融合了谷胱甘肽巯基转移酶(GST)蛋白。而在后期的抗体纯化过程中，采用亲和层析法成功地将GST抗体组分除掉，从而获得了特异性强、效价高的鼠源和兔源的抗人tau蛋白外显子2、外显子3、外显子10的多克隆抗体。为进行tau蛋白在神经退行性疾病中的作用研究及不同tau蛋白异构体分布和对疾病的作用机制研究提供了基础。本发明中的抗体可制成试剂盒，用于疾病的诊断。

摘要： 本申请涉及治疗表达具有至少一种选自以下突变的EGFR的恶性肿瘤患者的抗肿瘤剂：外显子18的G719X突变、外显子18的E709X突变和外显子21的L861X突变，其中X表示任意氨基酸残基，所述抗肿瘤剂包含(S)‑N‑(4‑氨基‑6‑甲基‑5‑(喹啉‑3‑基)‑8,9‑二氢嘧啶并[5,4‑b]吲嗪‑8‑基)丙烯酰胺或其盐。

摘要： 本发明提供了治疗具有携带MET外显子14跳跃突变或MET外显子14跳跃表型的肿瘤的癌症的方法，包括给需要这种治疗的患者施用有效量的式(I)化合物或其药学上可接受的盐。

摘要： 本发明提供了用于在治疗中使用的药物的制备，以及如本文所述的，用与merestinib组合的emibetuzumab治疗患有具有MET外显子14跳读突变或MET外显子14跳读表型的肿瘤的癌症的方法。

摘要： 本发明公开了一种检测表皮生长因子受体基因外显子19缺失突变和外显子21点突变的方法，该方法在同一个反应体系中进行酶切富集PCR反应和ARMS荧光定量PCR反应来分别检测E746_A750del缺失突变和L858R点突变，其将酶切突变富集PCR和ARMS荧光定量PCR整合在一起，通过有效的温度和时间控制，经一个反应程序即可完成酶切突变富集和ARMS荧光定量PCR反应。

摘要： 本发明公开了一种杜氏肌营养不良症相关的外显子剪接增强子、sgRNA、基因编辑工具及应用。相关的外显子剪接增强子、sgRNA和基因编辑工具可在制备治疗杜氏肌营养不良症的药物中应用。其中，基于胞嘧啶脱氨酶AID的突变体与Cas9突变体设计的基因编辑工具，以腺相关病毒AAV为载体，可对哺乳动物的基因组进行定点改造。本发明通过优化编辑工具的编码核酸序列以及元件组成结构，可以高效实现哺乳动物遗传物质DNA的定点靶向改造，通过对携带疾病突变的核酸序列进行靶向遗传操作，使其致病突变无法保留至成熟的蛋白质氨基酸序列中或使致病突变无法发挥其功能，从而达到治疗多种基因突变类遗传性罕见病的目的，具有高效，安全，稳定的优点。