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HIGHLY SPECIFIC AND SENSITIVE METHODS FOR DETECTING ENTEROHEMORRHAGIC ESCHERICHIA COLI SEROTYPES O157:H7 AND/OR O145:H28

机译:检测肠出血性大肠杆菌O157:H7和/或O145:H28血清型的高特异性和灵敏方法

摘要

The present invention relates to methods and kits for the specific detection of Escherichia coli (E.coli) serotypes O157:H7 and/or O145:H28. The methods and kits are based on the values for the E. coli O157:H7 assay on E. coli O157:117 detection of newly identified sequence regions, which have a very high sequence identity between E.coli serotypes O157:H7 and O145:H28 and which are not present in any other known E.coli serotype or bacteria. This sequence region thus allows for selective detection of E.coli O157:1-17 and/or O145:H28 from other bacteria, especially other E.coli serotypes. Furthermore the present invention shows that a 3 bp InDel sequence in O157:H7 allows for distinguishing between O157:H7 and O145:H28, which allows for selective detection of O157:H7 over O145:H28 and vice versa. Furthermore, the invention provides oligo-nucleotides useful for said detection.
机译:本发明涉及特异性检测O157:H7和/或O145:H28血清型大肠杆菌(I.coli)的方法和试剂盒。方法和试剂盒基于 E的值。 E进行大肠杆菌 O157:H7检测。大肠杆菌 O157:117检测新鉴定的序列区域,这些序列区域在大肠杆菌血清型O157:H7和O145:H28之间具有非常高的序列同一性,并且在其他任何已知的序列区域中都不存在大肠杆菌血清型或细菌。因此,该序列区域允许选择性检测来自其他细菌(尤其是其他大肠杆菌血清型)的大肠杆菌 O157:1-17和/或O145:H28。此外,本发明显示O157:H7中的3bp InDel序列允许区分O157:H7和O145:H28,这允许相对于O145:H28选择性检测O157:H7,反之亦然。此外,本发明提供了可用于所述检测的寡核苷酸。

著录项

  • 公开/公告号US2017362637A1

    专利类型

  • 公开/公告日2017-12-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 QIAGEN GMBH;

    申请/专利号US201515532558

  • 发明设计人 SASCHA STRAUSS;KATHRIN WOLF;

    申请日2015-12-03

  • 分类号C12Q1/68;

  • 国家 US

  • 入库时间 2022-08-21 13:03:22

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