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组装延长性染色体的方法及装置

摘要

本发明公开了一种组装延长性染色体的方法及装置。其中,该方法包括:S1,使用hifi数据对基因组组装挂载,根据hifi数据的深度在未挂载区域对潜在的性染色体片段根据深度进行鉴定,其中,性染色体为y染色体或w染色体;S2,使用超长数据对单独的潜在性染色体片段连长,得到性染色体片段,超长数据为N50长度到达50Kb以上的数据。与现有的组装技术相比,本发明在现有组装技术的水平上,单独对性染色体(y染色体或w染色体)根据reads深度做了鉴定,同时将鉴定出的潜在性染色体(y染色体或w染色体)进行连长和补洞,使性染色体(y染色体或w染色体)片段的连续性和完整性更高。

著录项

  • 公开/公告号CN114464261B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-07-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利号CN202210376925.0

  • 发明设计人 周勋;赵勇;王龙;曹斌斌;

    申请日2022-04-12

  • 分类号G16B30/20;C12N15/10;

  • 代理机构北京康信知识产权代理有限责任公司;

  • 代理人金田蕴

  • 地址 301700 天津市武清区武清开发区创业总部基地B07

  • 入库时间 2022-08-23 13:57:42

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-05-10

    公开

    发明专利申请公布

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