增强子在全基因组相互作用研究方法

摘要

本发明涉及一种增强子在全基因组相互作用研究方法，属于基因技术领域。该方法步骤为：(1)数据转换：采用UCSC网站liftover软件把增强子数据转换成hg18，对1760个增强子长度和分布进行统计分析。(2)数据过虑：过虑掉两个染色质片段距离小于100kb的数据，得到hESC细胞系、IMR90细胞系以及它们的重复实验基因表达数据，求平均值。(3)数据注释：将过虑好的数据比对到增强子数据中，统计不同细胞能捕获到的增强子数。(4)结果分析：比较增强子在全基因组范围相互位点数据。本发明能很好地得到细胞核内染色质三维构象的信息，能知道基因的表达调控信息，鉴定一些未知调控序列，这些技术在鉴定全基因组上的长距离作用起着十分重要的作用。