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吉尔吉斯白桦的BkERF1基因及编码蛋白

摘要

吉尔吉斯白桦的BkERF1基因及编码蛋白,它涉及桦的BkERF1基因及编码蛋白。吉尔吉斯白桦的BkERF1基因的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示,该基因编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明吉尔吉斯白桦BkERF1基因cDNA序列全长为1390bp,编码328个氨基酸,本发明的BkERF1基因转入拟南芥中,结果表明转基因株系生长好于野生型(WT)株系,表现出过表达BkERF1基因的株系比野生型(WT)株系抗性生长的差别,说明白桦BkERF1基因能够提高植物对碱性盐(NaHCO3)胁迫的抗性,为抗碱性盐植物分子育种准备了基因条件。

著录项

  • 公开/公告号CN103695437A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2014-04-02

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 东北林业大学;

    申请/专利号CN201310674412.9

  • 发明设计人 杨成君;李桂英;

    申请日2013-12-11

  • 分类号C12N15/29(20060101);C07K14/415(20060101);

  • 代理机构23109 哈尔滨市松花江专利商标事务所;

  • 代理人侯静

  • 地址 150040 黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号

  • 入库时间 2024-02-19 22:23:04

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-02-01

    未缴年费专利权终止 IPC(主分类):C12N15/29 授权公告日:20150715 终止日期:20151211 申请日:20131211

    专利权的终止

  • 2015-07-15

    授权

    授权

  • 2014-04-30

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N15/29 申请日:20131211

    实质审查的生效

  • 2014-04-02

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及白桦的BkERF1基因及编码蛋白。

背景技术

乙烯应答因子ERF是植物转录因子(AP2/EREBP)家族中的一员,其ERF蛋白含有 高度保守的AP2结构域,ERF转录因子与细胞发育、激素、抗病、低温、干旱、高盐等 信号传递有关,在调控植物生长发育和逆境胁迫中表现出一定的应答响应。是植物生长 发育和胁迫应答反应的重要调控因子。

发明内容

本发明的目的是提供吉尔吉斯白桦的BkERF1基因及编码蛋白。

本发明中吉尔吉斯白桦的BkERF1基因的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示。

本发明中吉尔吉斯白桦的BkERF1基因编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所 示。

本发明吉尔吉斯白桦BkERF1基因cDNA序列全长为1390bp,编码328个氨基酸, 本发明的BkERF1基因转入拟南芥中,过表达该基因的株系和野生型(WT)萌发后在碱性 盐(NaHCO3)下胁迫生长试验,结果表明转基因株系生长好于野生型(WT)株系,表现出过 表达BkERF1基因的株系比野生型(WT)株系抗性生长的差别,说明白桦BkERF1基因能够 提高植物对碱性盐(NaHCO3)胁迫的抗性,为抗碱性盐植物分子育种准备了基因条件。

附图说明

图1为本发明中吉尔吉斯白桦叶片总RNA的电泳图;

图2为本发明中PCR扩增得到全长cDNA电泳图,M为λDNA/HindIII酶切Marker, 1为PCR产物电泳;

图3为本发明中吉尔吉斯白桦的全长核苷酸序列ORF分析结果图;

图4为本发明中吉尔吉斯白桦的BkERF1基因编码氨基酸的同源性比对结果图;

图5为本发明中表达载体pBI121-BkERF1酶切鉴定电泳图,M为DL2000Marker,1, 2和3泳道为质粒DNA;

图6为本发明中无胁迫转基因植株的图;

图7为本发明中1.5mM NaHCO3胁迫转基因植株的图;

图8为本发明中3mM NaHCO3胁迫转基因植株的图。

具体实施方式

本发明技术方案不局限于以下所列举具体实施方式,还包括各具体实施方式间的任 意组合。

具体实施方式一:本实施方式吉尔吉斯白桦的BkERF1基因的核苷酸序列如SEQ ID  No:1所示。

具体实施方式二:本实施方式吉尔吉斯白桦的BkERF1基因编码蛋白的氨基酸序列 如SEQ ID NO:2所示。

吉尔吉斯白桦的BkERF1基因的编码区在117bp-1103bp。

吉尔吉斯白桦的BkERF1基因的核苷酸序列的获得:

1、向2.0mL的离心管中加入900μL无水乙醇、100μLβ-巯基乙醇混匀放在冰上预冷, 取吉尔吉斯白桦的叶片0.5g,迅速加液氮冷冻研磨成细粉状,分装加入离心管中,震荡 2min,4℃,13000r/min离心5min,吸出上清;向离心管中加入CTAB提取缓冲液600μL, 100μLβ-巯基乙醇,65℃水浴中预热5min;加入350μL苯酚,350μL氯仿,震荡5min, 4℃,13000r/min,离心10min,取上清,向其中加入700μL的氯仿,震荡5min,4℃, 13000r/min,离心5min;取上清,加入等体积的5mol/L LiCL,1/2体积的无水乙醇,混 匀,冰上沉淀10min,4℃,13000r/min,离心10min;去上清;用冰浴的体积分数为75% 的乙醇400μL洗涤沉淀;离心5min,去上清,空气中干燥沉淀;加50μL的DEPC水溶 解RNA;1%的琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整性,见图1,紫外分光光度法进行纯度 检测,A260/A280比值在1.8-2.0之间,检测质量合格,送交华大基因进行转录组测序。测 序分析获得白桦ERF序列信息。经过比对拼接,即得到完整的吉尔吉斯白桦BkERF1基 因序列。

2、用上述CTAB法提取白桦叶片RNA,取1μg总RNA进行反转录,按照东洋纺生 化部反转录试剂盒反转录成总cDNA,作为模板,根据完整的吉尔吉斯白桦BkERF1基因 序列设计全长PCR扩增引物,F1:5'-GCAGTCTGTCAACGTTCACACCAAAG-3',R1: 5'-CCGCCATCGCCTCAACAAACTATAT-3',进行PCR扩增,反应体系50μL,成分如下:

反应条件:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,共35 个循环,最后72℃延伸10min。

采用1%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,并回收目的基因片段,获得吉尔吉斯白 桦BkERF1基因cDNA产物,特异产物大小1390bp与预期片段长度相符,见图2。取PCR 产物2μL,1μL pMD18-T,5μL Slusion I连接酶,加无菌水2μL至反应体积10μL,16℃ 连接过夜。连接产物转化大肠杆菌DH5α,在氨苄青霉素平板上进行蓝白斑筛选阳性菌落。 单克隆摇菌,菌液送交华大基因公司测序鉴定。对全长核苷酸序列ORF分析结果如图3; 使用NCBI上的Blast程序进行氨基酸同源性比对,结果与葡萄(Vitis vinifera)同源性达 60%(见图4)。

3、植物表达载体的构建及转化植株鉴定,在cDNA的ORF的5'和3'端引入BmaHI 和SacI酶切位点,设计增设酶切位点的引物:

F2:5'-GGATCCATGATTTGGCCAAACAAAT-3',

R2:5'-GAGCTCTTATCTTGAGTCTCTCCTG-3',扩增目的基因片段。

反应体系

反应条件:94℃预变性5min,94℃变性1min,60℃退火30s,72℃延伸90s,共35 个循环,最后72℃延伸10min。

然后分别对PCR产物与pBI121质粒进行BmaHI和SacI酶切,回收DNA片段与载 体,用T4-DNA连接酶连接构建植物表达载体pBI121-BkERF1,酶切鉴定(见图5)。酶切 体系补齐。酶切体系:

将植物表达载体pBI121-BkERF1电转化至农杆菌EHA105菌株中,利用真空渗入法 转入拟南芥,在含有卡那霉素的1/2MS培养基上筛选转基因拟南芥,将T0代种子播种在 卡那霉素筛选平板上,收获T1代种子,然后T1种子卡那霉素筛选抗性播种收获T2代种 子,转基因T2代种子和WT在1/2MS平板上萌发,培养7天后移栽在1/2MS+碱性盐 (NaHCO3)培养基上对NaHCO3进行抗性的试验分析,结果表明转基因株系生长好于野生 型(WT)株系,说明在NaHCO3胁迫下生长的转基因株系比野生型表现出一定的抗性(图6、 图7、图8),过表达BkERF1基因能够提高植物对碱性盐(NaHCO3)的抗性,BkERF1基因 的克隆为抗性分子植物育奠定了基础。

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